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模式生物
來源:互聯(lián)網(wǎng)

模式生物是指幫助人們?cè)谝欢ǔ潭取⒁欢ǚ秶鷥?nèi)理解生命世界的一般規(guī)律的生物。模式生物中很多基因與人類具有很高的同源性,通過對(duì)模式生物基因結(jié)構(gòu)和功能的研究可以闡明人類相應(yīng)基因的功能。

模式生物應(yīng)具備下列條件:首先是容易繁殖,且生命周期較短;其次是具有清楚的遺傳背景,并已建立較成熟的遺傳操 作技術(shù)和表型分析方法:第三是通過實(shí)驗(yàn)?zāi)芑卮鸹蚪鉀Q研究者所關(guān)注的生物學(xué)問題。根據(jù)這些條件,大腸 桿菌、酵母、線蟲果蠅斑馬魚小鼠和大鼠等生物被 列入了常用模式生物的行列。

模式生物是在解析人類新基因功能的核心平臺(tái)。是體內(nèi)基因表達(dá)調(diào)控研究的有效途徑,是發(fā)育生物學(xué)研究不可或缺的技術(shù)手段,是人類疾病相關(guān)或掃描致病基因功能研究的理想模型,是解析疾病發(fā)病機(jī)制和藥物篩選的有力工具,是藥物療效及作用機(jī)制研究的必要手段。

簡介

生物學(xué)家通過對(duì)選定的生物物種進(jìn)行科學(xué)研究,用于揭示某種具有普遍規(guī)律的生命現(xiàn)象。此時(shí),這種被選定的生物物種就是模式生物。比如:格雷戈?duì)枴っ系聽?/a>在揭示生物界遺傳規(guī)律時(shí)選用豌豆作為實(shí)驗(yàn)材料,而托馬斯·摩爾根選用果蠅作為實(shí)驗(yàn)材料,在他們的研究中,豌豆和果蠅就是研究生物體遺傳規(guī)律的模式生物。由于進(jìn)化的原因,許多生命活動(dòng)的基本方式在地球上的各種生物物種中是保守的,這是模式生物研究策略能夠成功的基本基礎(chǔ)。選擇什么樣的生物作為模式生物首先依賴于研究者要解決什么科學(xué)問題,然后尋找能最有利于解決這個(gè)問題的物種。19世紀(jì)末20世紀(jì)初,人們就發(fā)現(xiàn),如果把關(guān)注的焦點(diǎn)集中在相對(duì)簡單的生物上則發(fā)育現(xiàn)象的難題可以得到部分解答。因?yàn)檫@些生物更容易被觀察和實(shí)驗(yàn)操作,因此,除了在遺傳學(xué)研究外,模式生物研究策略在發(fā)育生物學(xué)中獲得了非常廣泛的應(yīng)用,一些物種被大家公認(rèn)為優(yōu)良的模式生物,如線蟲果蠅非洲爪蟾蠑螈小鼠等。

隨著人類基因組計(jì)劃的完成和后基因組研究時(shí)代的到來,模式生物研究策略得到了更加的重視;基因的結(jié)構(gòu)和功能可以在其它合適的生物中去研究,同樣人類的生理和病理過程也可以選擇合適的生物來模擬。

目前在人口與健康領(lǐng)域應(yīng)用最廣的模式生物包括,噬菌體大腸桿菌釀酒酵母秀麗隱桿線蟲海膽、果蠅、斑馬魚、非洲爪蟾和小鼠。在植物學(xué)研究中比較常用的有,擬南芥、水稻等。

隨著生命科學(xué)研究的發(fā)展,還會(huì)有新的物種被人們用來作為模式生物。

但它們會(huì)有一些基本共同點(diǎn):

1)有利于回答研究者關(guān)注的問題,能夠代表生物界的某一大類群;

2)對(duì)人體和環(huán)境無害,容易獲得并易于在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)飼養(yǎng)和繁殖;

3)世代短、子代多、遺傳背景清楚;

4)容易進(jìn)行實(shí)驗(yàn)操作,特別是具有遺傳操作的手段和表型分析的方法。

背景

早在20世紀(jì)最初的20年中,甚至更早到19世紀(jì),人們就發(fā)現(xiàn),如果把關(guān)注的焦點(diǎn)集中在相對(duì)簡單的生物上則發(fā)育的現(xiàn)象難題可以得到部分解答。因?yàn)檫@些生物的細(xì)胞數(shù)量更少,分布相對(duì)單一,變化也較好觀察。由于進(jìn)化的原因,細(xì)胞生命在發(fā)育的基本模式方面具有相當(dāng)大的同一性,所以利用位于生物復(fù)雜性階梯較低級(jí)位置上的物種來研究發(fā)育共通規(guī)律是可能的。尤其是當(dāng)在有不同發(fā)育特點(diǎn)的生物中發(fā)現(xiàn)共同形態(tài)形成和變化特征時(shí),發(fā)育的普遍原理也就得以建立。因?yàn)閷?duì)這些生物的研究具有幫助我們理解生命世界一般規(guī)律的意義,所以它們被稱為“模式生物”。

應(yīng)用

基因研究

人類基因組研究中十分注重模式生物的研究,這是由于要認(rèn)識(shí)人體基因的功能,無法直接用人體作為實(shí)驗(yàn)對(duì)象。但是,生物是從共同祖先演化而來的,所以對(duì)生命活動(dòng)有重要功能的基因在進(jìn)化上是保守的,也就是說,這些基因的結(jié)構(gòu)和功能,在低等生物和高等生物中是相似的。因此,可以用比較容易研究的生物作為模型來研究其基因的結(jié)構(gòu)和生物學(xué)功能,由此獲得的信息可以使用于其他比較難以研究的生物,特別是推測(cè)相似的人體基因的功能。

影響

1. 生物的多樣形式在進(jìn)化過程中形成的,不同的生物有不同的形態(tài)結(jié)構(gòu)和生理特征,但對(duì)生命活動(dòng)有重要功能的基因卻是高度保守的。因此,可從模式生物著手,先弄清楚低等生物的相對(duì)比較簡單的基因組和生理功能,再以此為基礎(chǔ)進(jìn)一步研究人體這一復(fù)雜系統(tǒng)。比如,克隆低等生物的基因和闡明其功能后,將有助于克隆與該基因有同源序列的人體基因,并推測(cè)其可能的生理功能。

2. 在很多情況下不可能用人直接進(jìn)行試驗(yàn)。比如設(shè)法破壞某一個(gè)基因或轉(zhuǎn)入某一個(gè)基因,觀察這樣做對(duì)生物體的發(fā)育、生長、壽命和健康會(huì)產(chǎn)生什么樣的后果,這只能在實(shí)驗(yàn)動(dòng)物身上進(jìn)行。因此也就的研究這些實(shí)驗(yàn)動(dòng)物的基因組。

定義

模式生物學(xué)就是利用模式生物來研究生物學(xué)問題的學(xué)科,由于生物進(jìn)化的保守性,從一種實(shí)驗(yàn)生物得到的有關(guān)基因性質(zhì)或功能方面的信息往往也適用于其他生物。因此研究人員可以利用一些技術(shù)上更容易操作的生物來研究高等生物的生物學(xué)問題。嚴(yán)格意義上來說,這不是一門獨(dú)立的學(xué)科,國外也沒有專門設(shè)置這個(gè)學(xué)科,而是把它作為一種研究手段和方法而已。

最常見的模式生物有:逆轉(zhuǎn)錄病毒(retrovirus),大腸桿菌(Escherichiacoli),酵母(budding酵母浸膏(Saccharomycescerevisiae),fissionyeast(裂殖酵母屬pombe)),秀麗隱桿線蟲(Caenorhabditiselegans),果蠅(Drosophilamelanogaster),斑馬魚(斑馬fish),小鼠(mouse)等

此外模式植物包括:

擬南芥(Arabidopsis),水稻(Rice(OryzasativaL.))等。

舉例

果蠅

有誰會(huì)想到,一種紅眼、雙翅、羽狀觸角芒、身體分節(jié)、黃褐色的小昆蟲,在近百年間竟然能夠“培養(yǎng)”出好幾位獲得諾貝爾獎(jiǎng)的大科學(xué)家。它就是果蠅。果蠅英文俗名fruitfly或vinegarfly,果蠅廣泛地存在于全球溫帶熱帶氣候區(qū),而且由于其主食為腐爛的水果,因此在人類的棲息地內(nèi)如果園,菜市場等地區(qū)內(nèi)皆可見其蹤跡。除了南北極外,至少有1000個(gè)以上的果蠅物種被發(fā)現(xiàn),大部分的物種以腐爛的水果或植物體為食,少部分則只取用真菌,樹液或花粉為其食物。

在不供給食物的情況下,果蠅可存活50小時(shí)左右,在不供給水的情況下,果蠅無法活過一天。蛹期果蠅在其正常5天生活周期下可取食其體重3~5倍之食物,雌果蠅在產(chǎn)卵期每日可取用與其體重等重之食物。果蠅成蟲的食物內(nèi)需有類,而蛹期果蠅則可只依賴酵母即可生育。

以果蠅作為遺傳學(xué)研究的材料,利用突變株研究基因和性狀之間的關(guān)系已近一百年,至今,各種研究遺傳學(xué)的工具已達(dá)完善的地步,果蠅提供我們對(duì)今日的遺傳學(xué)的知識(shí)有其不可磨滅的貢獻(xiàn);從1980年初,Drs.C.Nesslein-Volhard和E.Weichaus以果蠅作為發(fā)育生物學(xué)的模式動(dòng)物,利用其完備的遺傳研究工具來探討基因是如何調(diào)控動(dòng)物體胚胎的發(fā)育,也帶動(dòng)了其它模式生物(線蟲斑馬魚小鼠和擬南芥等)的研究,且成果非常多。

黑腹果蠅( Drosophila melanogaster)是雙翅目昆蟲,生活史短,易飼養(yǎng),繁殖快,染色體少,突變型多,個(gè)體小,是一種很好的遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)材料,是一種模式生物。基因組全長kb,大約編碼13600個(gè)基因。

黑腹果蠅是一種原產(chǎn)于熱帶亞熱帶的蠅種。它和人類一樣分布于全世界,并且在人類的居室內(nèi)過冬。雌性體長2.5毫米,雄性較之還要小。雄性有深色后肢,可以此來與雌性作區(qū)別。

雌蠅可以一次產(chǎn)下400個(gè)0.5毫米大小的卵,它們有絨毛膜和一層卵黃膜包被。其發(fā)育速度受環(huán)境溫度影響。在25℃環(huán)境下,22小時(shí)后美國白燈蛾就會(huì)破殼而出,并且立刻覓食。因?yàn)槟阁w會(huì)將它們放在腐爛的水果上或其他發(fā)酵的有機(jī)化合物上,所以它們的首要食物來源是使水果腐爛的微生物,如酵母和細(xì)菌,其次是含糖的水果。幼蟲24小時(shí)后就會(huì)第一次蛻皮,并且不斷生長,以到達(dá)第二幼體發(fā)育期。經(jīng)過三個(gè)幼蟲發(fā)育階段和四天的蛹期,在25℃下過一天,就會(huì)發(fā)育為成蟲。

在20世紀(jì)生命科學(xué)發(fā)展的歷史長河中,果蠅扮演了十分重要的角色,是十分活躍的模型生物。遺傳學(xué)的研究、發(fā)育的基因調(diào)控的研究、各類神經(jīng)疾病的研究、帕金森病阿爾茲海默癥、藥物成癮和乙醇中毒、衰老與長壽、學(xué)習(xí)記憶與某些認(rèn)知行為的研究等都有果蠅的“身影”。

果蠅以發(fā)酵爛水果上的酵母為食,廣泛分布于世界各溫帶地區(qū)。果蠅具有生活周期短、容易飼養(yǎng)、繁殖力強(qiáng)、染色體數(shù)目少而易于觀察等特點(diǎn),因而是遺傳學(xué)研究的最佳材料。早在1908年由天才的遺傳學(xué)家托馬斯·摩爾根把它帶上了遺傳學(xué)研究的歷史舞臺(tái),約在此后30年的時(shí)間中,果蠅成為經(jīng)典遺傳學(xué)的“主角”。

科學(xué)家不僅用果蠅證實(shí)了孟德爾定律,而且發(fā)現(xiàn)了果蠅白眼突變的性連鎖遺傳,提出了基因在染色體上直線排列以及連鎖交換定律。摩爾根1933年因此被授予諾貝爾獎(jiǎng)。1946年,摩爾根的學(xué)生,被譽(yù)為“果蠅的突變大師”的米勒,證明X射線能使果蠅的突變率提高150倍,因而成為諾貝爾獎(jiǎng)獲得者。

在近代發(fā)育生物學(xué)研究領(lǐng)域中,果蠅的發(fā)生遺傳學(xué)獨(dú)領(lǐng)風(fēng)騷。1995年,諾貝爾獎(jiǎng)再次授予三位在果蠅研究中辛勤耕耘的科學(xué)家。果蠅為進(jìn)一步闡明基因-神經(jīng)(腦)-行為之間關(guān)系的研究提供了理想的動(dòng)物模型。

專家認(rèn)為,近一個(gè)世紀(jì)以來,果蠅遺傳學(xué)在各個(gè)層次的研究中積累了十分豐富的資料。人們對(duì)它的遺傳背景有著比其他生物更全面更深入的了解。作為經(jīng)典的模式生物,果蠅在21世紀(jì)的遺傳學(xué)研究中將發(fā)揮更加巨大而不可替代的作用。

大腸桿菌

大腸埃希氏菌(E.coli)通常稱為大腸桿菌,是人類和大多數(shù)溫血?jiǎng)游锬c道中的正常茵群。但也有某些血清型的大腸桿菌可引起不同癥狀的腹瀉,根據(jù)不同的生物學(xué)特性將致病性大腸桿菌分為5類:致病性大腸桿菌(EPEC)、腸產(chǎn)毒性大腸桿菌(ETEC)、腸侵襲性大腸桿菌(EIEC)、腸出血性大腸桿菌(E.I"IEC)、腸黏附性大腸桿菌(EAEC)。

大腸桿菌電子顯微鏡下圖像

大腸桿菌0157:H7血清型屬腸出血性大腸桿菌,自1982年在美國首先發(fā)現(xiàn)以來,包括我國等許多國家都有報(bào)道,且日見增加。日本自80年代以來因食物污染該菌導(dǎo)致的數(shù)起大暴發(fā),格外引人注目。在美國和加拿大通常分離的腸道致病菌中,截止2013年它已排在第二和第三位。大腸桿菌0157:H7引起腸出血性腹瀉,約2%~7%的病人會(huì)發(fā)展成溶血性尿毒綜合癥,兒童與老人最容易出現(xiàn)后一種情況。致病性大腸桿菌通過污染飲水、食品、娛樂水體引起疾病暴發(fā)流行,病情嚴(yán)重者,可危急生命。

大腸桿菌(Escherichiacoli,E.coli)革蘭氏陰性短桿菌,大小0.5×1~3微米。周身鞭毛,能運(yùn)動(dòng),無芽孢。能發(fā)酵多種糖類產(chǎn)酸、產(chǎn)氣,是人和動(dòng)物腸道中的正常棲居菌,嬰兒出生后即隨哺乳進(jìn)入腸道,與人終身相伴,其代謝活動(dòng)能抑制腸道內(nèi)分解蛋白質(zhì)的微生物生長,減少蛋白質(zhì)分解產(chǎn)物對(duì)人體的危害,還能合成維生素B和K,以及有殺菌作用的大腸桿菌素。正常棲居條件下不致病。但若進(jìn)入膽囊膀胱等處可引起炎癥。在腸道中大量繁殖,幾占糞便干重的1/3。兼性厭氧菌。在環(huán)境衛(wèi)生不良的情況下,常隨糞便散布在周圍環(huán)境中。若在水和食品中檢出此菌,可認(rèn)為是被糞便污染的指標(biāo),從而可能有腸道病原菌的存在。因此,大腸菌群數(shù)(或大腸菌值)常作為飲水和食物(或藥物)的衛(wèi)生學(xué)標(biāo)準(zhǔn)。大腸桿菌的抗原成分復(fù)雜,可分為菌體抗原(O)、鞭毛抗原(H)和表面抗原(K),后者有抗機(jī)體吞噬和抗補(bǔ)體的能力。根據(jù)菌體抗原的不同,可將大腸桿菌分為150多型,其中有16個(gè)血清型致病性大腸桿菌,常引起流行性嬰兒腹泄和成人胸膜炎。大腸桿菌是研究微生物遺傳的重要材料,如局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)就是1954年在大腸桿菌k12菌株中發(fā)現(xiàn)的。喬舒亞·萊德伯格(Lederberg)采用兩株大腸桿菌的營養(yǎng)缺陷型進(jìn)行實(shí)驗(yàn),奠定了研究細(xì)菌接合方法學(xué)上的基礎(chǔ),以及基因工程的研究。

大腸桿菌是人和許多動(dòng)物腸道中最主要且數(shù)量最多的一種細(xì)菌,主要寄生在大腸內(nèi)。它侵入人體一些部位時(shí),可引起感染,如腹膜炎膽囊炎、膀胱炎腹瀉等。人在感染大腸桿菌后的癥狀為胃痛、嘔吐、腹瀉和發(fā)熱。感染可能是致命性的,尤其是對(duì)孩子及老人。

大腸細(xì)菌(E.coli)為埃希氏菌屬(Escherichia)代表菌。一般多不致病,為人和動(dòng)物腸道中的常居菌,在一定條件下可引起腸道外感染。某些血清型菌株的致病性強(qiáng),引起腹瀉,統(tǒng)稱病致病大腸桿菌。

該菌對(duì)熱的抵抗力較其他腸道桿菌強(qiáng),55℃經(jīng)60分鐘或60℃加熱15分鐘仍有部分細(xì)菌存活。在自然界的水中可存活數(shù)周至數(shù)月,在溫度較低的糞便中存活更久。膽鹽煌綠等對(duì)大腸桿菌有抑制作用。對(duì)磺胺類、鏈霉素氯霉素等敏感,但易耐藥,是由帶有R因子的質(zhì)粒轉(zhuǎn)移而獲得的。

斑馬魚

斑馬魚屬鯉科短擔(dān)尼魚屬,原產(chǎn)于南亞,是一種常見的熱帶魚。斑馬魚體型纖細(xì),成體長3-4cm,對(duì)水質(zhì)要求不高。孵出后約3個(gè)月達(dá)到性成熟,成熟魚每隔幾天可產(chǎn)卵一次。卵子體外受精,體外發(fā)育,胚胎發(fā)育同步且速度快,胚體透明。發(fā)育溫度要求在25-31℃之間。斑馬魚由于個(gè)體小,養(yǎng)殖花費(fèi)少,能大規(guī)模繁育,且具許多優(yōu)點(diǎn),吸引了眾多研究者的注意。經(jīng)過30多年的研究應(yīng)用和系統(tǒng)發(fā)展,已有約20個(gè)斑馬魚品系,斑馬魚基因數(shù)據(jù)庫里有相關(guān)的資料可供查詢和下載,方便了研究。斑馬魚細(xì)胞標(biāo)記技術(shù)、組織移植技術(shù)、突變技術(shù)、單倍體育種技術(shù)、轉(zhuǎn)基因技術(shù)、基因活性抑制技術(shù)等已經(jīng)成熟,且有數(shù)以千計(jì)的斑馬魚胚胎突變體,是研究胚胎發(fā)育分子機(jī)制的優(yōu)良資源,有的還可做為人類疾病模型。斑馬魚已經(jīng)成為最受重視的脊椎動(dòng)物發(fā)育生物學(xué)模式之一,在其它學(xué)科上的利用也顯示很大的潛力. 斑馬魚(Daniorerio,俗稱zebrafish)具有繁殖能力強(qiáng)、體外受精和發(fā)育、胚胎透明、性成熟周期短、個(gè)體小易養(yǎng)殖等諸多特點(diǎn),特別是可以進(jìn)行大規(guī)模的正向基因飽和突變與篩選。這些特點(diǎn)使其成為功能基因組時(shí)代生命科學(xué)研究中重要的模式脊椎動(dòng)物之一。在國際上,斑馬魚模式生物的使用正逐漸拓展和深入到生命體的多種系統(tǒng)(例如,神經(jīng)系統(tǒng)免疫系統(tǒng)、心血管系統(tǒng)、生殖系統(tǒng)等)的發(fā)育、功能和疾病(例如,神經(jīng)退行性疾病、遺傳性心血管疾病糖尿病等)的研究中,并已應(yīng)用于小分子化合物的大規(guī)模新藥篩選。我國開展斑馬魚相關(guān)的研究無論在規(guī)模還是在重視程度上都遠(yuǎn)遠(yuǎn)落后于國際形勢(shì)發(fā)展的需要。推動(dòng)和發(fā)展斑馬魚模式生物在我國生命科學(xué)研究中的廣泛使用是本中心的宗旨。在國家科技部重大科學(xué)研究計(jì)劃的支持下,我們匯集優(yōu)勢(shì),整合我國現(xiàn)有的斑馬魚主要研究力量,在未來幾年內(nèi)逐步建立全國共享的斑馬魚模式動(dòng)物研究技術(shù)和資源庫,向國內(nèi)同行提供斑馬魚資源、信息和技術(shù)支撐。本著提高服務(wù)效率和質(zhì)量為原則,我們?cè)谏虾:?a href="/hebeideji/7158714370888728613.html">北京市分別建立國家斑馬魚模式動(dòng)物南方中心和北方中心。南方中心依托于中國科學(xué)院中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院,北方中心依托于北京大學(xué)清華大學(xué)。兩個(gè)中心本著優(yōu)勢(shì)互補(bǔ)的原則,共同開發(fā)研究技術(shù)和資源,以輻射狀向國內(nèi)研究人員提供服務(wù),積極推進(jìn)我國斑馬魚相關(guān)科學(xué)研究。

斑馬魚的發(fā)育譜系

主要技術(shù)和資源服務(wù)內(nèi)容:

1)斑馬魚基因表達(dá)分析服務(wù):包括抽提斑馬魚基因組脫氧核糖核酸和總核糖核酸核酸原位雜交探針制備和純化,全胚胎原位雜交技術(shù),顯微注射技術(shù),基因過表達(dá)(over-expression)和基因下調(diào)(morpholinoknockdown)技術(shù);

2)斑馬魚轉(zhuǎn)基因技術(shù)服務(wù):包括各類斑馬魚非特異性和組織特異性啟動(dòng)子克隆,基因組BAC文庫篩選與修飾,基于Tol2轉(zhuǎn)座子的轉(zhuǎn)基因質(zhì)粒的構(gòu)建,以及子一代轉(zhuǎn)基因系的篩選和保存;

3)斑馬魚基因功能活體檢測(cè)服務(wù):包括清醒斑馬魚在體共聚焦/雙光子顯微鏡成像技術(shù)和在體電生理記錄技術(shù);

4)動(dòng)物行為范式分析服務(wù):包括感覺相關(guān)的應(yīng)激行為、視覺運(yùn)動(dòng)行為、學(xué)習(xí)記憶行為和藥物成癮行為等;

5)斑馬魚基因突變技術(shù)服務(wù):包括插入誘變和ENU化學(xué)誘變技術(shù);

6)斑馬魚轉(zhuǎn)基因資源庫和突變體資源庫服務(wù):包括研制、收集和分發(fā)各種斑馬魚轉(zhuǎn)基因品系和突變體;

7)信息服務(wù):包括建立斑馬魚資源信息網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫和提供斑馬魚基因組生物信息學(xué)分析服務(wù)。

轉(zhuǎn)基因斑馬魚的制備主要采用兩種方法:通過Tol2轉(zhuǎn)座子構(gòu)建組織特異性表達(dá)報(bào)告基因的方法;利用特定基因的啟動(dòng)子/增強(qiáng)子驅(qū)動(dòng)報(bào)告基因在特定細(xì)胞組織中表達(dá)的方法。

首先構(gòu)建以Tol2轉(zhuǎn)座子為基礎(chǔ)的enhancertrap載體,報(bào)告基因選用GFP或RFP,最小啟動(dòng)子來自斑馬魚gata2基因;將上述載體與體外轉(zhuǎn)錄得到的Tol2轉(zhuǎn)座酶的mRNA共同注射到斑馬魚的單細(xì)胞受精卵中,受精卵長大后成為founder;Founder外交(out-cross)得到F1代胚胎,從中挑選出對(duì)于報(bào)告基因具有組織特異性表達(dá)模式的胚胎,拍照記錄后分類培養(yǎng);F1長大后通過linker-mediatedPCR的方法鑒定對(duì)應(yīng)于GFP(或RFP)表達(dá)圖式的Tol2插入位點(diǎn),并通過與已知基因組數(shù)據(jù)比較,對(duì)插入位點(diǎn)進(jìn)行定位與分析;通過外交純化得到轉(zhuǎn)基因魚,直至得到只含有單個(gè)插入品系的轉(zhuǎn)基因魚。通過克隆特定基因的啟動(dòng)子/增強(qiáng)子或BAC修飾法構(gòu)建在特定組織器官或特定胚胎發(fā)育階段表達(dá)報(bào)告基因的轉(zhuǎn)基因品系。BAC方法如下:在斑馬魚基因組計(jì)劃網(wǎng)站上通過BLAST將感興趣的基因定位到已知的contig上,并通過contig信息尋找包含所選基因的BACID號(hào);通過同源重組的方法對(duì)上述BAC克隆進(jìn)行修飾,將報(bào)告基因引入原有的BAC克隆;將修飾過的BAC克隆通過顯微注射的方法引入斑馬魚受精卵,連續(xù)觀察并挑選具有特異表達(dá)模式的轉(zhuǎn)基因魚;將上述成魚外交得到F1代,在F1代中篩選具有特異表達(dá)模式的成魚,即得到所需的轉(zhuǎn)基因品系。

小鼠

分類學(xué)上,小鼠屬于哺乳綱(Mammalia)、嚙齒目(Rodentia)、鼠科(鼠科)、小鼠屬(Mus)動(dòng)物。小鼠是由小家鼠演變而來。它廣泛分布于世界各地,經(jīng)長期人工飼養(yǎng)選擇培育,已育成1000多近交系和獨(dú)立的遠(yuǎn)交群。早在17世紀(jì)就有人用小鼠做實(shí)驗(yàn),現(xiàn)已成為使用量最大、研究最詳盡的哺乳類實(shí)驗(yàn)動(dòng)物。

1.小鼠屬于脊索動(dòng)物門,哺乳綱小鼠嚙齒目,鼠科,小鼠屬動(dòng)物。

小鼠(清潔級(jí))

2.成熟早,繁殖力強(qiáng)。小鼠6~7周齡時(shí)性成熟雌性35~50日齡,雄性45~60日齡;體成熟雌性為65~75日齡,雄性為70~80日齡;性周期為4~5天,妊娠期為19~21天;哺乳期為20~22天;特別有產(chǎn)后發(fā)情(PostPartumOestrus)便于繁殖的特點(diǎn),一次排卵10~23個(gè)(視品種而定),每胎產(chǎn)仔數(shù)為8~15頭,一年產(chǎn)仔胎數(shù)6~10胎,屬全年、多發(fā)情性動(dòng)物,繁殖率很高,生育期為一年。

3.體形小,易于飼養(yǎng)管理。小鼠嚙齒目實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中較小型的動(dòng)物,一只小鼠出生時(shí)1.5克左右,哺乳一月后可達(dá)12~15克,哺乳、飼養(yǎng)1.5~2月即可達(dá)20克以上,可供實(shí)驗(yàn)需要,在短時(shí)間內(nèi)可提供大量的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物。飼料消耗量少,一只成年小鼠的食料量為4~8克/天,飲水量4~7毫升/天,排糞量1.4~2.8克/天,排尿量1~3毫升/天,需要的飼養(yǎng)條件也較簡單,因個(gè)體小,可節(jié)省飼養(yǎng)場地。

4.性情溫順,膽小怕驚。小鼠經(jīng)長期的培育,在用于實(shí)驗(yàn)研究時(shí),性情溫順,易于抓捕,不會(huì)主動(dòng)咬人,但在雌鼠哺乳期間或雄鼠打架時(shí)“捉弄”則會(huì)咬人,一般很少相互斗架,操作起來很方便,是理想的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物。小鼠在罐、盒內(nèi)飼養(yǎng)時(shí),是很溫順的,但讓其到罐外,很快就恢復(fù)到處亂竄的野性。雌鼠吃食仔鼠與其膽小怕驚有關(guān)。

5.對(duì)外來刺激極為敏感。對(duì)于多種毒素和病原體具有易感性,反應(yīng)極為靈敏,如百萬分之一的破傷風(fēng)毒素能使小鼠死亡,這是其他實(shí)驗(yàn)動(dòng)物所不能比擬的。對(duì)致癌物質(zhì)也很敏感,自發(fā)性腫瘤多。

6.便于提供同胎和不同品系動(dòng)物。可根據(jù)實(shí)驗(yàn)要求選擇不同品系或同胎小鼠做實(shí)驗(yàn),也可選擇同一品種(或品系)、同年齡、同體重、同性別的小鼠做實(shí)驗(yàn),由于動(dòng)物遺傳均一,個(gè)體差異小,實(shí)驗(yàn)結(jié)果精確可靠。

7.喜居于光線暗的安靜環(huán)境,習(xí)于晝狀夜動(dòng),喜歡啃咬。小鼠白天活動(dòng)較少,夜間卻十分活躍,互相追逐配種,忙于覓食飲水,為此夜間應(yīng)備有飼料和飲水。

8.體小嬌嫩,不耐饑餓,不耐冷熱,對(duì)環(huán)境的適應(yīng)性差。對(duì)疾病的抵抗力也差,因而遇到傳染病時(shí)往往會(huì)發(fā)生成群死亡。如果飼料中斷和飲水中斷會(huì)發(fā)生休克,恢復(fù)后對(duì)體質(zhì)會(huì)帶來嚴(yán)重?fù)p害。特別怕熱,一出汗就易得病死亡,如果飼料溫度32℃時(shí),常會(huì)造成小鼠死亡。

9.成雌鼠在動(dòng)情周期不同級(jí)段,陰道粘膜可發(fā)生典型變化,根據(jù)陰道涂片的細(xì)胞學(xué)改變,可以推斷卵巢功能的周期性變化。成年雌鼠交配后10~12小時(shí)陰道口有白色的陰道栓,這是受孕的標(biāo)志,小鼠較為明顯、大鼠和豚鼠不明顯。小鼠的動(dòng)情期往往開始于晚間,最普遍的是在晚10點(diǎn)到晨1點(diǎn),偶爾在早晨1~7點(diǎn),很少在白天,大鼠也類似,但較小鼠稍早,一般在下午4~10點(diǎn)。

10.小鼠面部尖突,嘴臉前部有長長的觸須,耳聳立呈半圓形,眼大鮮紅,生有較長的尾,尾部有模列并覆有環(huán)狀角質(zhì)的小表皮鱗,其數(shù)量小于200片。

11.小鼠發(fā)育成熟時(shí)體長小于15.5cm,體重雌性為18~40克,雄性為20~49克,雙子座型,胸部有3對(duì)乳頭,鼠蹊部有2對(duì)乳頭,有膽囊,胃容量小,腸內(nèi)能合成維生素c,小鼠的染色體為20對(duì),壽命2~3年。

12.小鼠的體溫38(37~39)℃,呼吸頻率163(84~230)次/分,心跳頻率625(470~780)次/分,耗氧量1530mm2/g活體重,通氣量24(11~36)ml/分,潮氣量0.15(0.09~0.23)ml,收縮壓113(95~125)mmHg、舒張壓81(67~90)mmHg,紅細(xì)胞總數(shù)9.3(7.7~12.5)百萬/mm3,血色素14.8(10~19)g/100ml,白細(xì)胞總數(shù)8.0(6~12)千/mm3,總蛋白4.8(4.2~5.5)g%。

13.小鼠有多種手色,不能都叫小白鼠,一般通稱為小鼠。小鼠手色有白色(albino),鼠灰色(ayouti)、黑色(黑色)、褐色(brown)、黃色(黃色)、蛋白巧克力色(chocolate)、肉桂色(cinnamon)、淡色(dilution)、白斑(piebeld)等。

酵母

英語名稱:yeast

酵母菌是一些單細(xì)胞真菌,并非系統(tǒng)演化分類的單元。截止2012年為止已知有1000多種酵母,根據(jù)酵母菌產(chǎn)生孢子(子囊孢子擔(dān)孢子)的能力,可將酵母分成三類:形成孢子的株系屬于子囊菌門擔(dān)子菌門。不形成孢子但主要通過出芽生殖來繁殖的稱為不完全真菌,或者叫“假酵母”。截止2012年為止已知大部分酵母被分類到子囊菌門。酵母菌主要的生長環(huán)境是潮濕或液態(tài)環(huán)境,有些酵母菌也會(huì)生存在生物體內(nèi)。

釀酒酵母的掃描電鏡照片

酵母營專性或兼性好氧生活,如今未知專性厭氧的酵母。在缺乏氧氣時(shí),發(fā)酵型的酵母通過將糖類轉(zhuǎn)化成為二氧化碳乙醇來獲取能量。

C6H12O6(葡萄糖)→2C2H5OH(酒精)+2CO2↑

在釀酒過程中,乙醇被保留下來;在烤面包或蒸饅頭的過程中,二氧化碳將面團(tuán)發(fā)起,而酒精則揮發(fā)。

多數(shù)酵母可以分離于富含糖類的環(huán)境中,比如一些水果(葡萄蘋果、桃等)或者植物分泌物(如仙人掌科的汁)。一些酵母在昆蟲體內(nèi)生活。酵母菌是單細(xì)胞真核微生物。酵母菌細(xì)胞的形態(tài)通常有球形、卵圓形、臘腸形、橢圓形、檸檬形或藕節(jié)形等。比細(xì)菌的單細(xì)胞個(gè)體要大得多,一般為1~5微米′5~30微米。酵母菌無鞭毛,不能游動(dòng)。酵母菌具有典型的真核生物結(jié)構(gòu),有細(xì)胞壁、細(xì)胞膜、細(xì)胞核細(xì)胞質(zhì)、液泡、線粒體等,有的還具有微體。酵母菌的細(xì)胞形態(tài)酵母菌的細(xì)胞形態(tài)酵母菌細(xì)胞結(jié)構(gòu)的顯微照片酵母菌的菌落

大多數(shù)酵母菌的菌落特征與細(xì)菌相似,但比細(xì)菌菌落大而厚,菌落表面光滑、濕潤、粘稠,容易挑起,菌落質(zhì)地均勻,正反面和邊緣、中央部位的顏色都很均一,菌落多為乳白色,少數(shù)為紅色,個(gè)別為黑色。釀酒酵母的菌落紅酵母的菌落各種酵母菌的菌落。

擬南芥

拉丁名(Arabidopsisthaliana)十字花科二年生草本,高7~40厘米。基生葉有柄呈蓮座狀,葉片倒卵形或匙形;莖生葉無柄,披針形或線形。總狀花序頂生,花瓣4片,白色,匙形。長角果線形,長1~1.5厘米。花期3~5月。我國內(nèi)蒙、新疆、陜西省甘肅省西藏自治區(qū)山東省江蘇省安徽省、湖北、四川省云南省等省區(qū)均有發(fā)現(xiàn)。擬南芥的優(yōu)點(diǎn)是植株小(1個(gè)茶杯可種植好幾棵)、每代時(shí)間短(從發(fā)芽到開花不超過6周)、結(jié)子多(每棵植物可產(chǎn)很多粒種子)、生活力強(qiáng)(用普通培養(yǎng)基就可作人工培養(yǎng))。

擬南芥反向演化

參考資料 >

..2024-03-19

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