一種引起疾病的微生物，比如病毒或細菌、病原微生物又可稱為病原菌，是指能入侵宿主引起感染的微生物，有細菌、真菌、病毒等。它們能產生致病物質，造成宿主感染。
病原菌就是指可導致人或動物與植物感染病癥的微生物菌種（包含病菌、病毒感染、立克次氏體、裂頭蚴、細菌）或別的微生物菌種重組體包含混種體或突變體。
基本介紹
概述
病原菌為什么會使人生病呢？是因為它們能產生致病物質，造成宿主感染。如果不產生致病物質，就是非病原菌。至于正常菌群，當與宿主處于生態平衡狀態，它們并不引起機體的感染，故屬于非病原菌范疇。但是，在特定條件下，因為菌群失調、宿主免疫功能低下或菌群寄居部位改變造成了生態失調狀態，正常菌群也能引起感染，這樣它們又應看成病原菌。為此，將這些正常菌群稱為條件性病原菌或機會性病原菌，意思是在特殊條件下或遇到合適機會時，它們也可以具有病原菌的特性，造成人類感染性疾病。
致病原理
霍亂弧菌、痢疾桿菌和大腸桿菌能產生分泌到它們細胞外面的腸毒素引起患者腹瀉；鼠疫桿菌分泌的鼠疫毒素作用于全身血管及淋巴使其出血和壞死；還有些細菌產生不分泌到菌體細胞外的毒素，例如沙門氏菌。當我們不小心弄破了手足而傷口比較深時，或者被銹鐵釘扎到肉中，必須到醫院去注射預防針，預防由梭狀芽孢桿菌引起的破傷風。梭狀芽孢桿菌也來自土壤，是一種不喜歡氧氣的厭氧菌。它在氧氣較少的深部傷口中繁殖，并產生一種能致人于死地的毒素。還有一種梭狀芽孢桿菌，它們會產生一種已知對人類最厲害的毒素（0.1微克就足以致人死命），它并不在宿主體內繁殖，而是在罐頭里腌制的魚和肉類中繁殖并產生毒素。不過現代先進有效的食品保藏方法使肉毒中毒癥變得很少見了。
致病物質分類
病原菌的致病物質可分為毒素和侵襲力兩大類。毒素對宿主有毒，能直接破壞機體的結構和功能。侵襲力本身無毒性，但能突破宿主機體的生理防御屏障，并可在機體內生存下來（醫學上稱為定殖）、繁殖和擴散。如果把毒素當作“元兇”，那侵襲力就是“幫兇”。
依據細胞壁結構的不同，可將病原菌（病毒除外，因為病毒沒有完整的細胞結構）分為革蘭氏陽性和革蘭氏陰性兩類。對于病原菌的毒素來說，可被分為根據性質、作用和產生菌的不同，將其分為外毒素（主要由革蘭氏陽性菌產生）和內毒素（主要由革蘭氏陰性菌產生）兩種。下面的表格列出了細菌外毒素和內毒素的主要區別。
外毒素和內毒素的區別
參考資料 >
西京醫院感染性疾病科主任醫師許榮放簡介.騰訊大秦網健康頻道.2016-01-05