祁連山脈，簡稱祁連山，意即天山，古匈奴語，因位于河西走廊以南，也被稱為南山。祁連山脈有狹義和廣義之分，狹義上的祁連山單指祁連山脈北部的走廊南山；廣義上的祁連山脈，指甘肅省西部和青海省東北邊境山區的整體，由一系列大致平行的、主要呈西北-東南走向的山脈（包括照壁山、大雪山、托來山、托來南山、野馬山、野馬南山、疏勒南山、黨河南山、土爾根達坂山、賽什騰山、柴達木山和宗務隆山）和山間谷地交替排列而成，這些次級山嶺從北到南分布，東西長800公里，南北寬200－400公里，最高峰為海拔5808米的團結峰。祁連山脈共有冰川3306條，面積約2062平方公里。
祁連山系晚新生代以來，印度板塊與歐亞板塊持續擠壓碰撞而形成。西抵阿爾金山脈，北靠河西走廊，南接柴達木盆地，東端至黃河谷地，與秦嶺、六盤山相連。祁連山的氣候類型是典型的大陸性氣候。在一般的山前低山區，屬于荒漠氣候。中山下部則屬于半干旱草原氣候。中山上部的氣候屬于半濕潤森林草原氣候。亞高山和高山區屬于寒冷濕潤氣候。
祁連山脈地區新石器時代的代表是繼馬家窯文化之后的青銅器時代各種文化，其中以卡約文化最為典型。祁連山的現代研究工作始于二十世紀三十年代，在二十世紀六十年代末到七十年代末期，祁連山的研究幾乎中斷。二十世紀七十年代末期張掖祁連山水源林研究所成立，祁連山的林業科學研究工作開始全面展開。2017年起，中國在祁連山地區開始創建祁連山國家公園試點工作。
命名
祁連山意即天山，古匈奴部落將高聳可達天空的山稱為“祁連”，意為“天空”，而祁連山就因其坐落于河西走廊南部邊緣，曾在中國歷史上被稱為南山、雪山、白山等名稱。
位置境域
狹義的祁連山特指祁連山脈的走廊南山，廣義的祁連山指分布于青藏高原東北緣，由一系列西北-東南走向的平行山脈與谷地組成的山地系統，東西延伸約800公里，南北寬度200至400公里，主體海拔4000至6000米。其地處青藏高原北部邊緣，為甘肅省與青海省的界山。經緯度跨度為東經94°～103°，北緯36°～40°，或東經90°10’~103°04’，北緯35°50’~39°19’。祁連山的東端延伸至黃河谷地，與秦嶺、六盤山相接；西端抵達當金山口，與阿爾金山脈相連；南界連接柴達木盆地及湟水谷地的北部邊緣地帶（包括茶卡-共和盆地和黃河谷地）；北鄰河西走廊地帶。作為重要的地理單元，祁連山不僅是青藏高原、內蒙古高原與黃土高原的分界線，還發揮著連接中原、北方草原、西域綠洲和青藏高原四大區域的作用。
成因
祁連山是在晚新生代以來，印度板塊與歐亞板塊持續擠壓碰撞的結果。該山脈由一系列北西-南東向的條狀山脈組成，山勢西高東低，平均海拔超過3000米。祁連山與其北部的河西走廊形成了2000~3000米的高差，約有30%的山體海拔超過4000米，山峰多海拔4000－5500米，最高峰疏勒南山的團結峰海拔5808米。
從總體上來看，祁連山地區經歷了三個基本的大地構造階段：地槽階段、地臺階段和地洼階段，最終形成了現今的祁連山構造區，即祁連地穹系。
地槽階段
本區地槽階段的發展過程，可以劃分為三個時期。
早元古代陸塊奠基時期
在太古代末和元古代初，祁連山地區的北部橫跨中朝一塔里木盆地太古界古地臺。在下元古界，該地區主要以復理石建造、碳酸鹽巖建造和火山建造為主。早期的火山活動比較廣泛。早元古代經歷了多次構造運動，其中現今所觀察到的最明顯的運動是早元古代末期的徨源運動。這次運動奠定了祁連山地區的基本構造格局。
中、晚元古代陸塊成長和擴展時期
在中元古代的長城紀時期，祁連山地區北部跨越中朝一塔里木太古界古地臺的海槽規模較大。長城紀末期發生了徨中運動，這次運動將祁連陸塊擴展到柴達木盆地地區。青白口紀末期的晉寧運動或全吉運動形成了總體方向為北西西方向的區域構造地質體的雛形。
在震旦紀末，祁連地區發生了一次強烈的托萊運動。這是祁連山第一次明顯的造山運動，主要表現為擠壓褶皺的構造特征。托萊運動使得祁連山與中朝區的塔里木盆地、揚子區域聯合在一起，結束了陸塊擴展發展時期，陸殼初步成熟。
地臺階段
在本區地臺階段，形成了大型的沉積盆地。在石炭紀時期，該區海域范圍廣闊，形成了穩定的淺海相和海陸交互相沉積。到了二疊紀和三疊紀，北祁連地區陸相（如河湖相和湖沼相）盆地發育，南祁連地區海相沉積較為發達，尤其是在中三疊世。在這一段時期中，也發生了少量的火山活動。祁連山地區在石炭紀到三疊紀這段時間內，構造運動和巖漿侵入活動相對微弱。這一時期是祁連山地區最為相對安定的時期。
地洼階段
晚三疊世結束時，印支運動的爆發，該地區的地質構造發展進入了一個新的歷程，即地洼構造的發展階段。該階段的特征是塊斷、推覆、拉張以及陸內造山、造盆作用的發育，進而形成了現今所見的祁連地洼、地彎造山帶。
在侏羅紀時，祁連山地區開始形成山脈區和陸相盆地（盆嶺構造）。在白圣紀時期，塊斷差異運動更加明顯，形成以走廊南山、西寧市、蘭州市等為中心的陸相湖盆區。
始于第四紀時期，由于受到東昆侖山脈斷裂和阿爾金山脈斷裂的左行擠壓逆沖作用的影響，形成了斜壓逆沖和斷塊疊覆構造的祁連山構造區。該區域發育了大量的活動斷裂，其中以擠壓逆沖為主、左旋走滑為輔的斷裂活動強烈。特別是在中新世末期，陸內推覆構造發展非常強烈。
在祁連山地區的地洼階段，由于構造運動、巖漿活動以及陸相沉積作用的綜合作用，形成了現今的祁連陸內造山帶。這一帶經歷了塊斷、推覆和拉張等應力和應變作用，最終形成了現在的祁連陸內盆嶺構造帶。
總結
綜上所述，祁連山地區經歷了四次主要的造山作用，這些作用的性質各異。早元古代末的徨源運動導致動熱擠壓型造山作用的形成；元古代末的托萊運動則導致陸塊擠壓型造山作用的形成；加里東晚期的祁連運動則導致陸間碰撞擠壓型造山作用的形成。而中、新生代則經歷了塊斷一推覆型造山作用。前三者可被歸類為地槽型造山作用，其共同特點是區域變質作用十分強烈。后者則屬于地洼型造山作用，其特點是斷裂變質作用的發育。
地理特征
氣候
祁連山的氣候類型是典型的大陸性氣候。在一般的山前低山區，屬于荒漠氣候，平均年降水量約為150毫米，年平均氣溫約為6攝氏度。中山下部則屬于半干旱草原氣候，年平均氣溫在2攝氏度至5攝氏度之間，年降水量在250毫米至300毫米之間。中山上部的氣候屬于半濕潤森林草原氣候，年平均氣溫在0攝氏度至1攝氏度之間，年降水量在400毫米至500毫米之間。亞高山和高山區屬于寒冷濕潤氣候，平均年降水量約為800毫米，年平均氣溫大約為-5攝氏度。相對而言，祁連山東部的氣候較為濕潤，而西部則相對較為干燥。
氣溫從東到西表現出逐漸升高的趨勢，而隨著海拔的升高，氣溫逐漸降低。但是冬季氣溫在東西部有所不同，而中部氣溫則低于東、西部。相比之下，氣溫的日較差和年較差從東到西表現出逐漸增大的趨勢，但是隨著海拔的升高，日較差逐漸減小，而年較差則在海拔超過2800米后開始增大。
祁連山的高山和外圍山腰地帶在夜間的氣溫下降緩慢，同時氣壓存在半日波現象。山區邊緣地帶的夜雨比晝雨更多，年降水量存在兩個最大值。祁連山北坡的年降水量隨海拔升高而增加。由東向西，年降水的變差系數增大，降水量逐漸減少。
祁連山主體的降水量大于周圍地區，西部降水主要集中在5至9月，東部降水主要集中在4至10月。東部降水比西部更加穩定，但年平均總云量有顯著減少的趨勢。祁連山的大氣水汽和地面降水受到西風帶、偏南季風和東亞季風的共同影響。西北部的大氣水汽主要受西風帶氣流控制，中南部偏南季風占主導地位，東北部受東亞季風影響明顯。降水隨著平均海拔的上升而增加。河西走廊春末夏初的降水空間分布，東南部和西北部較多，中間較少。ENSO事件對降水有顯著影響。
根據EOF分析，祁連山的降水空間變化可以分為三個部分：祁連山西部、河西走廊中部和祁連山東部。東部降水量大于西部，隨著海拔高度的升高，降水量增加，達到最大值的海拔約為2900米。
年降水從東到西表現出逐漸減少的趨勢，而隨著海拔的升高，降水量逐漸增加，不過當海拔超過3600米時，由于接近山頂，風速加大，降水量多為固態，降水量出現下降趨勢。降水的比率在東西部也有較大的差異。春季和冬季的降水比率增大，而秋季的降水比率則減小，夏季則呈現先增大后減小的趨勢。從北到南隨著海拔的升高，春季和冬季的降水比率逐漸降低，而秋季的降水比率則呈現先增大后減小的趨勢。夏季的降水比率則與此相反，大致的分界線在海拔2300米處。
地質
祁連山最初形成于古生代的大地槽環境，后經歷加里東運動和華力西運動，形成一系列褶皺帶。其造山帶自北向南可劃分為北祁連縣造山帶、中祁連隆起和南祁連造山帶三個地質構造單元。其中，北祁連造山帶分布有混雜堆積及高壓變質帶；中祁連隆起主要由元古宙結晶基底及三疊紀地層構成；南祁連造山帶以早古生代地層為特征，并發育同碰撞造山及后造山花崗石侵入體。從白堊紀開始，祁連山主要經歷了斷塊升降運動，形成了一系列平行的地壘（或山嶺）和地塹（谷地、盆地）。
祁連山為典型多旋迥加里東地槽，加里東晚期褶皺成山后，已為塔里木盆地一阿拉善一華北地臺的一部分，其南為新發展起來的青海南山一北秦嶺冒地槽，由于昆侖山脈一柴達木盆地板塊向北俯沖，青海南山冒地槽的西段已消減于阿爾金山脈和祁連山之下。
祁連山存在兩條重要的巖石圈深斷裂，形成了古板塊縫合線。其中，北祁連山深斷裂是北祁連山洋殼向中祁連山陸殼消減帶，多次發育蛇綠巖套，并存在具有雙變質帶特征的藍閃片巖、遠深海含放射蟲硅質大理石以及少量混雜堆積。另一條縫合線為青海湖至北淮陽深斷裂，是祁連山板塊組合和昆侖秦嶺板塊組合的縫合線。前者向南仰沖，后者向北俯沖，俯沖帶沿線存在混雜堆積和蛇綠巖。
祁連山位于中國南北板塊間構造帶上，因此在泥盆紀以前的不同發展階段，具有洋殼地槽、優地槽、陸殼地槽和冒地槽等特點。祁連山地槽在加里東晚期閉合，形成了泥盆系類磨拉石建造，在喜山期抬升形成了巨厚的磨拉石建造，因此祁連山可以被稱為“阿爾卑斯”型構造。
當前，祁連縣山及周邊區域的地震活動主要與印度板塊向北東側向推擠歐亞板塊向南側推擠產生的北西、北北西向的剪切應力場有關。這種構造活動導致了一系列地震，例如民勤縣、山丹縣、右浪、西吉縣、海源等地的一級地震震中。
地形地貌
該山系為西北高、東南低的地形，大部分平均海拔位于3500米至5000米之間。其中，疏勒南山的團結峰是該山系最高峰，高達5827米。此外，北坡相對高度高達3000米，而南麓相對高度僅在500米至1000米之間，南北兩翼高度差異明顯。
山系低山區主要受到風化侵蝕和剝蝕作用的影響，中山區則主要受到流水侵蝕的作用，而高山區則主要受到寒凍風化的控制。在祁連山區，存在三個不同海拔的夷平面。第一級夷平面位于東段海拔4400～4600米，西段海拔4800～5000米；第二級夷平面位于東段海拔4000～4200米，西段海拔4500～4700米；第三級夷平面位于東段海拔3600～3800米，西段海拔4000～4200米。河谷中還發育著多級階地。
祁連山脈古冰川的冰磧[qì]地貌廣泛分布在祁連山北坡海拔2700～2800米以上的地區，而現代冰川下限則分別位于北坡海拔4100～4300米和南坡海拔4300～4500米之間，且西部的現代冰川下限較東部高200～300米。祁連山共有冰川3306條，面積約2062平方公里，儲水量達1320億立方米。其中，走廊南山、疏勒南山和黨河南山的冰川數量最多，疏勒南山、土爾根達坂和走廊南山的冰川規模最大。近100年來，這些冰川處于不斷退縮的階段。祁連山區由于多年凍土的下界高程一般為3500-3700米之間，使大多數山地和一些黃河的上游都發育著冰緣地貌。
水文
祁連山區屬于我國西北干旱地區，但卻擁有一個以森林、草原為主體、較為濕潤的復合生態系統。該區現存的水源涵養林總面積為43161萬公頃，同時該區冰川儲量為81112億立方米，這兩者共同構成了一個巨大的天然水庫。每年有7216億立方米的出山徑流通過石羊河、黑河、疏勒河等內陸河水系。
祁連山水系分布成輻射狀和格狀兩種形態。輻射中心位于北緯38°20'、東經99°左右的“五河之源”，即黑河、托來河（北大河）、疏勒河、大通河和布哈河的發源地。從輻射中心沿著冷龍嶺至毛毛山，再沿大通山、日月山至青海南山東段一線為內外流域分界線。分界線的東南側包括黃河支流莊浪河、大通河、湟水等外流水系；而西北側的石羊河、黑河、托來河、疏勒河、黨河、哈爾騰河、魚卡河、塔塔棱河等屬于內陸水系。這些河流大多數發源于高山冰川，冰雪融水為主要補給來源。河流的流量年際變化較小。
黑河
黑河，是甘肅省河西走廊內流最大的河流，古稱弱水。其上游稱為甘州河，起源于祁連山脈走廊南山和托來山之間的分水梁處。河流向東南流經縱谷草地，經過黃藏寺匯入鄂博河，隨后向西北穿過走廊南山80千米橫谷，流速急促。鷹落峽口是中游的起點，該站平水年年均流量為50.0立方米/秒，年徑流量為15.8億立方米。在鷹落峽口以北，黑河進入走廊平原，在甘州區烏江堡以北匯入山丹河，轉向西北流，成為黑河。在高臺正義峽以北，黑河成為下游，在經過金塔盆地東端時水量大幅減少，到鼎新后有一條西來匯流的北大河（現已干涸），黑河重新向東北流動，進入居延海盆地干三角洲，此時黑河也被稱為額濟納河（弱水）。
疏勒河
疏勒河是甘肅省河西走廊內流水系中排名第二的大河，也叫做籍端水。它的源頭位于祁連山脈西段的疏勒腦，夾在托來南山和疏勒南山之間，自西向北流經肅北縣的高山草地，然后穿越大雪山與托來南山之間的峽谷，最后經過昌馬盆地。在昌馬峽以前的段落被稱為上游，當地人稱之為昌馬大河。水量充沛急流險灘，昌馬堡站的平均水流量為每秒24.8立方米，年徑流量達到7.81億立方米。出昌馬峽后至平原區段被稱為中游，此時它分成十個溝渠流向大壩沖積扇面。在扇緣，疏勒河匯合了許多泉水河，形成東、西兩支流。其中，東支的一部分又分成南、北兩支，分別被稱為南石河和北石河，流入花海盆地的終端湖。而西支則是主要的流域，也叫做布隆吉河。下游從安西雙塔堡水庫以下開始，因為灌溉、蒸發和下滲等原因，疏勒河的水量急劇減少。
疏勒河的古河道穿過哈拉諾爾到達疆羅布泊。整個流域長不超過600千米，從源頭到近期終端湖哈拉諾爾，實際上早已經沒有地面徑流，僅存干河道遺跡。
昌馬沖積扇以西的主要支流有踏實河和黨河，而以東的主要支流有石油河和白楊河，都發源自祁連山西段。由于疏勒河水系雨水補給減少，冰雪融水顯著增加，從山口處流出的多年平均流量為每秒58.1立方米，年徑流量為18.30億立方米，其中6至9月占50%至70%。疏勒河的上游位于祁連山區，那里降雨量比較豐富，冰川面積達到850平方千米，大部分是高山草地，非常適宜養殖畜牧業。而中、下游地勢比較平坦，包括玉門鎮、瓜州縣、敦煌市以及赤金-花海等綠洲地區，這些地方的灌溉農業發展迅速。全流域已經建成了5座容量超過100萬立方米的水庫，其中雙塔堡、黨河和赤金峽水庫較大。
大通河
大通河是湟水的支流，又稱浩門河，宋代在大通城筑城后得名。它位于青海省省東北部，以長度和流量來論，實際上是湟水的正源。它發源于青海疏勒南山的東端，向東穿過走廊南山─冷龍嶺和大通山─達坂山兩大山嶺之間的561千米長的縱谷內。上、中、下游各有一段構造沉降帶，形成寬谷。上游寬谷海拔高，有大面積高位沼澤。中游的浩門川（門源回族自治縣縣城附近）和下游的八寶川（連城、窯街之間）是重要的農耕區。它在享堂附近注入湟水，流域面積為1.5126萬平方千米，年均流量為88.7立方米/秒。流域內植被良好。
石羊河
石羊河是甘肅省河西走廊的第三大河，古稱谷水。它的干流上游是雜木河，起源于祁連山脈東段冷龍嶺北側的大雪山，向東北流淌于山谷中，水流湍急，雜木寺平水年均流量為7.90立方米/秒，年均徑流量為2.49億立方米。從塔兒莊出山后，進入河西走廊東段成為中游，經過武威市接納緣泉水，然后向東北流淌，成為石羊大河。紅崖山以北是下游，原本分為大東河和大西河兩條支流，現在已經修建成東西干渠，繼續向東北方向流淌，最終流入民勤縣東鎮以北的沙漠中。
石羊河全長250千米。全水系自東向西，主要支流包括大景（靖）河、古浪河、黃羊河、金塔河、西營河、東大河和西大河（下游稱為金川河），都源于祁連山東段。河流的補給主要來自雨水和融雪，出山口多年平均流量為50.5立方米/秒，年徑流量為15.91億立方米，其中6月至9月的徑流量占總量的70%左右。石羊河上游的祁連山區降水豐富，擁有64.8平方千米的冰川和殘留林木，是河流的主要水源補給地。前山皇城灘是一個優良的牧場，中游經過走廊平原，形成了武威市和永昌縣等綠洲，灌溉農業非常發達。下游則是民勤綠洲。終端湖如白亭海和青土湖等已經消失。整個流域建有15座100萬立方米以上的水庫，其中大景峽、黃羊河、南營、西馬湖、紅崖山和金川峽等水庫規模較大。
湟水
湟水是中國黃河上游的重要支流之一，發源于青海省海晏縣的包呼圖山，其河流形成羽狀水系，流經青海省大通山、達坂山和拉脊山之間的縱谷。湟水在其河道途經過程中，經過湟源縣時，與日月山的藥水河匯合；在湟中區又匯入水峽河；至西寧市時，南川河、北川河、沙塘川分別從南北匯入。此后，湟水沿途流經平安、互助、樂都區等縣市，最終在享堂流入黃河的大通河中，成為其最大的支流。湟水全長為373.9千米，流域面積為3.29萬平方千米，多年平均年徑流量為46.5億立方米。由于湟水擁有豐富的水力資源和灌溉利用價值，沿岸區域成為了青海省主要的農業區域。同時，湟水還在其下游入口處流經蘭州市和永靖縣之間，并流入黃河八盤峽水庫。
土壤
土壤與植被相對應，東段北坡為灰鈣土帶—山地栗鈣土帶—山地黑土（陽坡）和山地森林灰褐土（陰坡）帶—高山草甸土（陽坡）和高山灌叢草甸土（陰坡）帶—高山寒漠土帶；南坡為灰鈣土帶—山地栗鈣土（陽坡）和山地森林灰褐土（陰坡）帶—高山草甸土（陽坡）和高山灌叢草甸土（陰坡）帶—高山寒漠土帶；西段北坡為棕荒漠土帶—山地灰鈣土帶—山地栗鈣土帶—高山寒漠土帶；南坡為灰棕荒漠土帶—高山棕鈣土帶—高山寒漠土帶。
在祁連山東緣高寒草甸的退化過程中，土壤凈氮礦化率和氨化速率逐漸下降，而硝化速率卻逐漸上升。此外，該地區土壤氨化作用強烈，導致土壤中的無機氮主要以態氮為主要形態。
近年來，高寒草甸正在經歷退化過程，這導致了植物群落結構的破壞，從而改變了土壤的理化性質。這種改變抑制了與氮素轉化相關的關鍵酶的活性，因此高寒草甸土壤氮礦化的速率逐漸下降。
生物
植物
植被垂直帶結構，山地東西部南北坡不盡相同。東段北坡植被垂直帶譜（自下而上）：荒漠帶（只有草原化荒漠亞帶）—山地草原帶—山地森林草原帶—高山灌叢草甸帶—高山亞冰雪稀疏植被帶。南坡：草原帶—山地森林草原帶—高山灌叢草甸帶—高山亞冰雪稀疏植被帶。西段北坡：荒漠帶—山地草原帶—高山草原帶—高山亞冰雪稀疏植被帶。南坡：荒漠帶—高山草原帶（限荒漠草原亞帶）—高山亞冰雪稀疏植被帶。
北坡
祁連山北坡位于河西走廊與青藏高原高原的過渡帶，具有典型的大陸性氣候特征。該地區的生態環境脆弱，主要的植被類型為荒漠和草原。在特定的地形地貌和氣候條件下，主要發育并形成了荒漠草原（1600～2450米）、典型草原（2450～2800米）和草甸草原（2800～3800米），植物以旱生和中生草本以及灌木為主。該地區的主要土壤類型為亞高山灌叢草甸土、山地灰褐土和山地栗鈣土等。該地區的物種豐富，天然植被以草地、灌木林地和喬木林為主。由于氣候、海拔和坡向等多種因素的影響，該地區存在明顯的垂直分異規律。主要植物如下表。
南坡
祁連山南坡位于祁連山中段腹地，面積約為2.4萬平方千米，是青藏高原向黃土高原的過渡地帶，具有特殊的地理位置和自然環境。該區域地貌以山地為主，地形復雜，海拔范圍介于2257米—5235米。氣候為大陸性高寒半濕潤山地氣候，太陽輻射強，氣溫日較差大，年均氣溫約為-5.9攝氏度，極端最高溫為30.5攝氏度，極端最低氣溫為-37.1攝氏度。
該區土壤類型主要有高山寒漠土、高山草甸土、高山草原土、山地草甸土、山地栗鈣土、山地灰褐土、黑鈣土、栗鈣土、草甸土和沼澤土等十大類，再根據不同土質分為淋溶高山草甸土、碳酸根高山草甸土等26個亞類。該區域土壤豐富多樣，為該地區的生態環境提供了堅實的基礎。主要植被類型如下表。
珍稀瀕危保護植物
根據《中國珍稀瀕危保護植物名錄(第一冊)》，本區域共計有國家二級保護植物兩種:星葉科和桃兒七屬；三級保護植物三種與一變種：黃芪、內蒙黃芪、羽葉丁香和馬尿脬。
據“國家重點保護野生藥材物種名錄”，本區域共計有國家二級保護藥材：甘草屬一種，即甘草；國家三級保護藥材七種:西伯利亞遠志、卵葉(單瓣)遠志、疏葉當歸、寬葉羌活、甘肅貝母、麻花秦艽、小秦艽。
據“國家重點保護野生植物名錄(第一批)”，本區域共計有二級保護植物五種，為短芒披堿草、三蕊草、紅花綠絨蒿、羽葉點地梅屬和山莨菪。
特有植物
祁連山國家公園（青海片區）內分布著436種中國特有植物，涵蓋50個科160個屬。其中蕨類植物有2科、3屬、5種；裸子植物有2科、4屬、5種；被子植物門有46科、153屬、426種。被子植物中的雙子葉植物綱有40科、120屬、342種，而被子植物中的單子葉植物有6科、33屬、84種。青海省特有植物中，分布著23種，隸屬于15個科20個屬，占中國特有植物的3.14%。
動物
祁連山獨特的生態環境為野生動物提供了適宜的棲息場所，這里的各種生態系統中棲息著豐富的野生動物。據統計，這里陸棲脊椎動物有4綱、22目、52科、219種，占甘肅省陸棲脊椎動物總數（723種）的30.3%。其中，鳥類169種，占甘肅省鳥類總數（479種）的35.3%；獸類47種，占甘肅省獸類總數（163種）的28.8%；兩棲爬行類13種，占甘肅省兩棲爬行類總數（81種）的16.1%。
根據《國家重點保護動物名錄》，祁連山地區內共有51種國家級保護動物，其中14種屬于一級保護動物，37種屬于二級保護動物。此外，根據《中華人民共和國政府和日本國政府保護候鳥及其棲息環境協定》，在祁連山國家級自然保護區境內季節性棲息的候鳥達51種之多。
祁連山地勢復雜，垂直景觀變化明顯，野生動物的分布也呈現出垂直分布的特點，主要分為以下幾個帶：高山裸巖寒漠帶、高山草原草甸帶、高山灌叢草甸帶、山地森林草原帶、山地草原帶和荒漠半荒漠草原帶。在這些帶中，大多數哺乳動物和鳥類都聚集在高山草原草甸帶、高山灌叢草甸帶和山地森林草原帶。高山裸巖寒漠帶則只有一些高山特化物種如雪豹、巖雷鳥和白唇鹿等棲息其中。而山地草原帶和荒漠半荒漠草原帶則僅有西藏野驢、藏羚等少數荒漠動物的分布。
根據資料記載，解放初期祁連縣山野生動物數量豐富，分布廣泛。然而，自上世紀60年代開始，由于人類活動的干擾和破壞（如獵殺、過度放牧、毀林開荒等），野生動物棲息環境受到嚴重破壞，數量急劇下降，分布范圍也大幅度縮減。到80年代末，野生動物數量已經下降到歷史最低水平，特別是珍稀瀕危野生動物（如馬鹿、馬麝等）的數量減少嚴重，其中部分動物（如雪豹等）甚至處于滅絕的境地。直到80年代末期，國家頒布了《中華人民共和國野生動物保護法》，并批準成立祁連山國家級自然保護區，才使得祁連山珍稀瀕危野生動物得到有效保護。一些動物的數量開始回升，例如西藏野驢、巖羊、藍馬雞等；然而，仍有一些動物處于瀕危、滅絕狀態，例如馬麝、雪豹、野牦牛、白唇鹿等。
自然保護區
祁連山自然保護區是中國的一個國家級自然保護區，成立于1988年，位于甘肅省河西走廊的酒泉市和張掖市，占地272.2萬公頃。保護區的主要目標是保護水源涵養林和珍稀野生動物。該地區有58種獸類、140多種鳥類、13種兩棲爬行綱，其中包括國家重點保護的白唇鹿、蒙古野驢、野牦牛、盤羊、雪豹、斑尾棒雞等幾十種珍稀動物，也是麝的重要產地。祁連山自然保護區的森林分布在海拔1800米左右的落葉闊葉林、針葉林以及海拔3800米處，而在長江流域谷地甚至可達海拔4100米。由于其重要性，祁連山自然保護區是中國森林生態系統自然保護區的一部分，對于維護生態平衡和水源涵養發揮著重要作用。
重要支系
冷龍嶺
冷龍嶺位于中國祁連山東段，是甘肅省和青海省兩省的界山。它是河西內流區石羊河水系上游各支流和外流區黃河水系支流大通河寬谷間的分水嶺。地質構造為早古生代形成的走廊南山-冷龍嶺復背斜，形成了巨型的北西走向鐵、銅、錳、磷礦帶。這條山脈從西起海拔4353米的金瑤嶺（或錦羊嶺，又稱景陽嶺），到東至4303米的得泉山，長約225千米，是一條直陡而狹長的高峻山脈，海拔一般在4200米左右，冷龍嶺的最高峰位于青石嘴以北，海拔5254米，冰川遍布。冷龍嶺位于永昌縣東大河的上游，是高山草甸草原，夏季用作牧場。該地區有許多野生動物，如野牛、普氏野馬和盤羊等。
托來南山
托來南山地區位于青海省北部，是疏勒河、托勒河、薩拉河三條主要內陸河的源頭之一。它地處青藏高原東北緣，位于北祁連構造帶和中祁連隆起帶的接觸部位，構造格局主要是在喜馬拉雅山脈期形成的，以褶皺-沖斷構造為主，構造帶主要沿NWW-SEE方向延伸。該地區屬于高原大陸性氣候，全年日照時數在2440-3140小時之間。年降水量為300-500毫米，主要集中在7、8月份，雨熱同季，沒有絕對的無霜期。工業不發達，主要以采礦、冶煉、制藥、毛紡業為主。農牧業相結合，以畜牧為主，主要以種植油菜、稞麥和小麥為主要農作物。該地區牧業主要以養馬、養牛、養羊為主，馬匹數量眾多，馬匹質量也頗受省內外聞名。該地區森林覆蓋率在10%以上，同時擁有豐富的野生資源，如鹿、熊、黃芪、疏葉當歸、青海湖裸鯉和鯉魚等。
疏勒南山
疏勒南山位于祁連山中段，疏勒河之南，黨河、哈拉湖之北，在青海省省東起大通河源，向西延至黨河支流堯勒特溝附近出青海。該地區為季風氣候與干旱氣候的過渡地帶。疏勒南山地區1961-2018年的年均溫為-6.57攝氏度。其中，最熱月7月與最冷月1月的氣溫均值分別為5.76攝氏度與-20.00攝氏度。年均降水量為429毫米，其中5-8月份的降水占全年降水量的80%，導致疏勒南山冰川積累和消融都集中在暖季。
團結峰位于疏勒南山東南段，甘肅省和青海省的邊界上，北緯38°31′，東經97°46′處，是祁連山脈的最高峰，海拔高度為5827米（一說5808米），土名為宰吾結勒或崗則吾結。它是疏勒河上游谷地和哈拉湖盆地兩個內流水系分水嶺的最高點。此處地表被廣泛的冰雪所覆蓋，雪線高度超過4400米，有大面積的現代冰川存在。
大通山
大通山位于大通河與布哈河之間，是青海潮內陸水系與大通河外流水系的分水嶺。該山體大致呈西北-東南走向，西北起于察汗鄂博山，向東延伸并與達坂山相連，全長約300公里，寬度在50～60公里之間。海拔高度在3000～3500米以上，最高峰桑斯扎峰海拔4755米。該山屬于一個北西西向到北西向延伸的背斜褶皺帶，山體結構主要由古老震旦亞界海相砂質碎屑巖和碳酸鹽巖組成。地貌呈現明顯的垂直分層，海拔在3000～3600米的地區主要為湖積、洪積和沖積平原，且分布著優良的天然牧場。而在海拔3600～4000米的地區，地勢相對平緩，溝谷地帶較開闊，具有"U"形谷的特征，牧草生長旺盛，適合發展畜牧業。海拔在4000米以上的地區則以冰緣地貌為主，坡陡谷深，巖石裸露，且分布著冰川。布哈河、吉爾孟河、沙柳河、哈爾蓋河均發源于該山南麓，并匯入青海湖。
日月山
日月山位于青海省，是其內外流域水系分水嶺和農牧區天然分界線，歷來被稱為“草原門戶”和“西海屏風”。它橫跨湟源縣、海晏縣和共和三縣，北接大通山，東接拉脊山，呈西北-東南走向，全長約90千米，海拔一般約4000米。山的南側為倒淌河寬谷，屬于內流區的青海湖水系；山的北側受湟水干流及其眾多支流的切割，屬于外流區的黃河水系。自古以來，山的南部為耕種社會，北部為游牧部落，氣候和地勢劃然為二。阿勒大灣山（海拔4455米）和野牛山（海拔4832米）之間是日月山口，海拔約3470米，是由第三紀的橘紅色砂礫巖組成的夷平面，并有薄層山麓堆積覆蓋。歷來是內地赴西藏大道的咽喉，唐朝時期曾設立唐與吐蕃贊普分界碑。
烏鞘嶺
自古以來，烏鞘嶺為河西走廊的東大門和咽喉地，古絲綢之路的天然關隘和軍事要地，地理位置十分重要。它是中國東部農業區與西部綠洲灌溉農業區及牧區的自然分界線，同時也是莊浪河和古浪河上游的分水嶺。位于甘肅省天祝藏族自治縣的中北部，是祁連山東段的雷公山（海拔4326米）和毛毛山（海拔4070米）之間的低海拔部分，海拔為3562米。山口的平均海拔超過3000米，附近保存著古代的安遠驛古驛道和漢長城、明長城的遺址。蘭新鐵路、甘新公路和連霍高速都經過這座山口。由于山口位于中生代后期形成的河西構造系的龍首山-青石嶺隆起帶東側的武威-洮河沉降帶，所以地勢相對較低，并且有一系列北北西走向的中新生代盆地和河谷，分水嶺地層為上三疊統硬砂巖互層和大理石，并且存在中基性火山巖。烏鞘嶺的年平均氣溫為-0.2攝氏度，1月平均氣溫為-12.2攝氏度，7月平均氣溫為11.3攝氏度，平均年降水量為411.3毫米。山地植被主要為高山草甸，局部陰坡上有稀疏的針葉林和灌叢。河谷緩坡多被開墾為旱地耕作。
人類活動
早期文明
根據考古發現，舊石器時代晚期距今約3萬年前，青海省地區的先民已經在這片廣袤的土地上繁衍生息。20世紀80年代對柴達木盆地進行的考古發掘證明，大約在二三萬年前，這里的氣候比現在更溫暖、更潮濕，環境適宜于成群的食草類動物生活在疏林草原中。當時的居民主要靠狩獵謀生。因此可以推斷，早在舊石器時代晚期，整個青海高原的草原生態環境比現在優越得多，祁連山地區也不例外。青海地區新石器時代的代表是繼馬家窯文化之后的青銅器時代各種文化，其中以卡約文化最為典型。
歷史沿革
在漢代之前，祁連山南麓是羌族的牧地。到了秦末漢初，原本居住在河西走廊的部分月氏人遭受匈奴的嚴重打擊，逃到南山（今祁連山）一帶，被稱為“小月氏”。從劉徹河西建郡開始，就進行了大規模移民來實行邊境屯墾和開發。從魏晉開始，尤其是在十六國至南北朝時期，祁連山南麓先后經歷了前涼、前秦、后涼、南涼、西秦、北涼、吐谷渾等政權的交替統治。唐朝末期，祁連山南麓被河湟吐蕃斯啰的青唐政權所控制。南宋寶慶三年（1227年），成吉思汗的蒙古軍占領了青海省北部地區。紹定二年（1229年），成吉思汗的第三個兒子孛兒只斤·窩闊臺繼位后，將青海、甘肅省及河西走廊原屬于西夏的領土劃歸給其次子闊端，封他為西涼王，又稱永昌王。他在門源回族自治縣地皇城灘建造了一座避暑行宮，名為“斡爾朵城”。這個地方也叫黃城灘、大草灘，曾經是匈奴和回鶻人的牧地。
民族及文化
在河西走廊南側綿延起伏600千米的祁連山中，生活有10多個少數民族，這些民族在發展過程中形成了獨特的民族文化。該區域總人口約11萬人，由藏族、漢族、回族、蒙古族、土族、撒拉族、裕固族等多民族共同組成的，藏族占總人口數的60%左右。
裕固族和藏族是祁連山區的兩個主要少數民族。裕固族分布在祁連山的中西部，而藏族主要分布在東部的天祝藏族自治縣和西部的馬蹄、祁豐鄉。這兩個民族的文化是祁連山區最典型的少數民族文化，也是生態旅游中開發利用最廣泛的文化。在祁連山。祁連山國家公園各生態旅游景區展現了各種少數民族文化的獨特魅力，包括裕固族和藏族獨特的飲食、住所、歌舞、體育運動方式及服飾、習俗和飲食文化，還有位于山巔的瑪尼堆、坐落于半山腰的宏偉藏傳佛教寺廟和分布在草原上的牧民帳篷。它們展現了各民族特色紛呈的歷史文化傳承。
工程建設
荒漠一綠洲草地農業系統
系統耦合是指在生態系統內部自由能的積累、系統會聚和超循環系統的發展過程中形成的一種新的高級系統，即耦合系統。這種新系統的出現方便了現代系統分級管理。非平衡態和自由能作為超循環的驅動力是普遍存在的，因此超循環系統耦合的可能性也是普遍存在的。
該地區采用荒漠一綠洲草地農業系統，這是一種高級耦合系統，由前植物生產層、植物生產層、動物生產層和外生物生產層耦合而成，具有巨大的生產潛力。然而，這種生產潛力的發揮需要市場的發展和科學的管理。該系統存在兩種耦合類型，即水平耦合型和垂直耦合型。以綠洲子系統為核心，它帶動山地子系統和荒漠子系統，產生系統耦合效應，使生產潛力得到充分釋放。作為草業系統的一部分，它還可能與其他草業系統耦合，形成更高級的耦合系統，如大農業系統等。
礦產資源開發
礦產資源方面，北祁連有塊狀硫化物銅多金屬礦床、菱鐵－鏡鐵礦、赤鐵礦磁鐵礦，東段有黃鐵礦型銅礦，西段有矽卡巖型的鎢礦床，南祁連有巖漿銅礦床、鉻鐵礦礦床和大型造山型金礦床。肅北蒙古族自治縣和酒泉南山一帶有黑鎢礦脈石英和鎢礦，是中國西部鎢礦蘊藏豐富的地區之一。另外還有金川縣超大型銅Ni-PGE礦床，南祁連拉水峽一帶也可能是南側金川式礦床的重要找礦選區。
錳礦
甘肅省發現了31處錳礦床（礦點），其中有10處估算資源量達到334級以上，這些礦床均為中小型或以下規模。甘肅錳資源儲量居全國第15位，累計探明基礎儲量為221千噸，資源量為1983千噸，資源儲量為2204千噸。但是，這些礦床依然存在著地理分布不均、成因復雜、規模小、礦石品位不高等問題，不過這些礦床的選別性較好。
鎢礦
祁連地區是甘肅鎢礦的重要開采區域。通過成礦條件分析，北祁連、南祁連和中祁連都存在豐富的鎢礦儲量，有著極為明朗的成礦前景。北祁連西段是規模型鎢礦床的聚集地，其中塔兒溝鎢礦、小柳溝鎢礦和西柳溝鎢礦都達到了大型規模，其中小柳溝鎢礦已經被甘肅新洲礦業有限公司開采。經過工業擴大試驗和生產實踐表明，該區域黑鎢礦和白鎢礦都是易選礦石。近年來，隨著商業勘查費用的大量投入，世紀鎢礦、貴山鎢礦、祁寶鎢礦以及祁青鉬礦都在小柳溝鎢礦的外圍發現，而干巴河腦鎢鉬礦則在西柳溝鎢礦的外圍被發現。
金礦
在寒山、紅柳峽 一帶，都有著非常龐大的金礦儲量。在祁連地區開展的第二 輪成礦遠景區規劃中可以看出，祁連地區共有四級金礦成礦 帶 7 個、五級金礦成礦帶 14 個、遠景區 16 個。南祁連山地區內主要的金礦床包括賈公臺金礦、烏力溝金礦、黑刺溝金礦、雞叫溝金礦、且爾干德金礦、東硐溝金礦和狼查溝金礦，以及其他一系列金礦點。截至目前，累計探明的金資源量可達60余噸，金礦床類型為中低溫熱液型。在北祁連地區，車路溝含礦斑巖體分布于玉門市昌馬鄉車路溝金礦至昌馬金礦一帶，呈巖株狀產出，面積約為10平方千米。該巖體侵入于下奧陶統陰溝群中，該地層下部主要為凝灰巖和含火山角礫凝灰巖，上部主要為安山巖和安山玄武巖等，受到巖體侵入的影響，巖石發生了明顯的褪色和蝕變現象。巖體由花崗閃長斑巖、石英閃長玢巖和英云閃長斑巖組成。該巖體是該地區最主要的賦礦圍巖，在巖體與地層接觸處或巖體內部斷層中，產生了車路溝金礦床、昌馬金礦床、捷達坂金礦床及碾子溝金礦點等多處金礦床（點）。
科考勘測
祁連山的現代研究工作始于二十世紀三十年代，涉及森林和野生動物、地質地貌、土壤和氣象等方面。最早開展研究的學者包括陳宗器（1930年的《西北之地理環境與科學考察》）、劉慎愕（1934年的《中國北部及西部植物地理概論》和1936年的《中國南部及西部植物概論》）、周映昌（1930年的《中國西部夭然植物初步研究》和《中國西部天然林初步研究》）、以及郝景盛（1942年的《甘肅西南之森林》）。這些研究對推動和促進我國植物生態學和野生動物研究以及祁連山的研究起到了積極作用。
在二十世紀五十年代到六十年代中期，國家和政府對西北地區進行了大規模的科學考察和研究工作。其中，李博、張耀甲、陳慶誠等專家以及由專家組成的中科院蘭州冰川凍土研究所祁連山冰川利用研究隊、中科院青海、甘肅綜合考察隊、林業部第三森林經理大隊等對祁連山野生動物、植物及其生態、自然地理、地質地貌、水文、土壤、氣象等自然科學領域開展了較深入系統的研究。主要研究成果包括1957年的《甘肅疏勒河下游植被概況》、1966年的《甘肅祁連山東段一些高山植物形態、生態特征的觀察》、1958年的《河西走廊的自然景觀》、1959年的《柴達木盆地托拉海河西地區的自然景觀》、1963年的《祁連山國營托勒牧場植被的分布與演替》、1965年的《試論甘肅省河西地區的草場類型及其利用問題》、1959年的《河西地區水文地質研究》、1963年的《祁連山的氣壓系統》、1963年的《河西走廊綜合自然區劃》以及1964年的青海甘肅獸類調查報告等。
在二十世紀六十年代末到七十年代末期，祁連山的研究很少，差不多中斷。但在1970年代末期，張掖祁連山水源林研究所的成立打破了祁連山科學研究的停滯。從那時起，祁連山的林業科學研究工作開始有計劃、有步驟地全面展開。
2021年6月18日至7月20日，中國地震局第二監測中心組織科考骨干力量，啟動青藏高原東北地區緣祁連山東段GNSS加密觀測系統布設及科考工作。
環境問題和保護
環境問題
冰川和凍土融化
受全球氣候變暖影響，中原地區特別是西北干旱區的冰雪和多年凍土數量和分布面積明顯減少。祁連山地區同樣受到影響。祁連山冰川普遍面臨物質虧損狀態，面積不斷縮小。根據兩次冰川編目的對比，1956年至2010年期間，祁連山冰川面積總計減少了420.81平方千米（減少了20.88%）。其中，509條冰川已經消失，面積為55.12平方千米。冰川的變化在祁連山地區呈現出明顯的經度地帶性分異，東段冰川退縮速度較快，而中西段冰川面積減少較慢。在過去的40年中，凍土分布面積也逐漸減少。研究表明，1970年代至1980年代、1980年代至1990年代和1990年代至2000年代，凍土的減少速率分別為4.1%、5.3%和13.4%。同時，凍土分布范圍的減少速率呈逐漸增加的趨勢。
土壤林地退化
祁連山區是一個復雜的生態系統，以森林為主體，涵蓋著草地和灌叢等景觀。由于氣候、地形、土壤和水文等因素的相互作用，景觀呈現斑塊狀分布，且森林通常位于“冰源水庫”和河流水系之間，對于涵養調節水源具有重要作用。自祁連山國家級自然保護區成立以來，禁止大規模人工采伐，使得自然林得到了有效保護，而人工林的面積不斷擴大。然而，森林面積的顯著增加可能會消耗更多水資源，減少流域徑流輸出，進而影響下游地區的經濟和生態穩定。此外，長期實施的封山育林和退耕還林（還草）活動，導致人工林的人為干擾較小，使得森林的密度和林冠閉度都比較高。這種現象可能導致深層土壤的旱化，從而影響水源涵養的能力。
草地退化
祁連山保護區的草地面積占總面積的37.2%，對保護生物多樣性、保持水土和維護生態平衡有著重要作用和價值。草原退化通常由環境因素和人為因素兩個方面綜合作用導致，但在祁連山地區，草原退化主要受到人類活動的影響。隨著人口劇增和對畜牧業的高度依賴，草畜矛盾問題愈發突出，特別是祁連山東段溫性草原區位于農牧交錯帶，受人為干擾因素較大，草地的開墾率較高，從而導致生態退化過程。過度放牧不僅導致草地退化，也創造了適合鼠類侵入的條件，進一步加劇了草地的退化程度。
水資源管理
近幾十年來，祁連山區氣溫總體上升，與全球氣候變暖趨勢一致。然而，全球氣候變暖對河西內陸干旱區的影響具有明顯的地域差異。在祁連山東部地區，出山徑流呈現明顯的下降趨勢；而在祁連山中部地區，雖然山區降水量略有增加，但氣溫升高導致的冰雪融水增加并未明顯提高出山徑流量；而在祁連山西部，山區流域降水量增加和氣溫升高的情況下，出山徑流呈現出明顯上升趨勢。除全球氣候變暖的影響外，祁連山區的特殊地理環境和人為因素也對出山徑流產生了復雜的影響。因此，可以說，人為對山區水資源的管理和調控面臨著諸多困難和挑戰。
生物多樣性減少
祁連山地區的生物多樣性正面臨著嚴重的威脅。由于人類活動和自然環境變化等多種因素的影響，野生動物的棲息地遭到了破壞，導致野生動物的種群數量急劇下降，其活動范圍逐漸縮小，數量也明顯減少。許多珍稀動物如雪豹、野牦牛、馬鹿、馬麝和獵隼都面臨著滅絕的危險。同時，該地區的冬蟲夏草圖、黃芪、黨參、雪蓮花、秦艽、紅景天等珍稀資源的儲量也明顯減少。
祁連山地區面臨諸多環境問題，其中原因主要有以下幾個方面。首先，自然因素加劇了生態環境變化。氣候干燥加劇導致中冰川結構融化速度增加，加劇了生態系統變化。其次，歷史的開發活動與現行政策存在沖突。70年代后批建的產業發展與現行環境保護方法相比，往往更加強調經濟發展而忽略環境保護，導致祁連山生態系統的破壞，引發水土流失和地質災害，恢復周期長，投入巨大。第三，區域民生與生態承載力之間的矛盾突出，打破了保護區的生態系統平衡，甚至有些地方處于嚴重超載狀態，加劇了土地荒漠化、水土流失等一系列惡性循環。最后，綜合生態監測系統不完備。目前對基本現狀數據的全面監測與掌握不足，且祁連山當地的職能部門缺乏溝通交流和共享工作，盡管采集了一定的數據，但無法進行有效聯動，制約了祁連山區域環境工作的開展。
環境保護
相關政策
1992年12月11日青海省第七屆人民代表大會常務委員會第二十五次會議通過《青海省湟水流域水污染防治條例》，2021年7月1日根據2018年3月30日青海省第十三屆人民代表大會常務委員會第二次會議《關于修改<青海省實施《中華人民共和國節約能源法》辦法>等十部地方性法規的決定》第二次修正通過最新版本。
2017年11月30日，甘肅省第十二屆人民代表大會常務委員會第三十六次會議通過《甘肅祁連山國家級自然保護區管理條例》。
2012年3月28日青海省第十一屆人民代表大會常務委員會第二十八次會議通過《青海省飲用水水源保護條例》，2021年7月1日根據2018年3月30日青海省第十三屆人民代表大會常務委員會第二次會議《關于修改<青海省實施《中華人民共和國節約能源法》辦法>等十部地方性法規的決定》修正通過最新版本。
保護績效
經過近年來的整改整治，祁連山自然保護區的草地面積明顯擴大，區域環境質量也得到持續改善，生態修復和環境保護的成效顯著。自2017年開始，甘肅省對祁連山地區進行了生態環境監測和第三方評估，通過強化資源保護宣傳、完善相關管理條例等方式對祁連山地區生態環境進行有效保護。監測數據表明，祁連山區域的植被生長狀況總體得到改善，明顯改善區域占保護區總面積的比例增加了37.5%；植被指數、植被覆蓋度、植被生產力均呈顯著提升趨勢，分別增長了10.88%、7.81%和14.8%；水、氣、土等環境質量指標均達到國家考核標準。
2023年02月02日，甘肅省生態環境廳發布《2022年祁連山地區環境質量狀況》，報告顯示2022年，祁連山地區涉及的5市11縣（區）細顆粒物（PM2.5）年均濃度為24微克/立方米，達到年二級標準；可吸入顆粒物（PM10）年均濃度為54微克/立方米，達到年二級標準；優良天數比例為87.8％。祁連山國家級自然保護區生態保護狀況指數NEI為59.63，生態環境保護狀況良好。
2025年，甘肅省開展祁連山保護區保護管理成效評估，根據初步評估結果，祁連山不同種群野生動物數量持續恢復，雪豹數量增至350—500只，巖羊、豺等伴生物種數量增長20%。普氏野馬、賽加羚羊、野駱駝等瀕危野生動物繁育、野化放歸有序推進，生態鏈協同復蘇。
風景名勝
自然景觀
黑河大峽谷
黑河大峽谷全長866千米，平均海拔4200米以上，其中有70千米的區域尚未被人類穿越，是一片神秘的地帶。黑河從峽谷中流淌而過，經過青海省、甘肅省，最終流入內蒙古自治區額濟納旗境內的居延海，因此被稱為河西走廊的主要河流。黑河大峽谷內地貌壯麗，巖峰聳立，怪石嶙峋，景色獨特。有時峽谷狹窄，河流湍急，峭壁陡峭，如同絕境；有時則寬闊開闊，坡度平緩，河灘寬闊，宛如別有洞天。氣候變化多樣，生物資源豐富。
祁連山國家公園
祁連山國家公園位于甘肅、青海兩省交界處的祁連山北麓，地處青藏、蒙新、黃土三大高原交匯地帶，是國家重點生態功能區之一。該公園總面積為5.02×104平方千米，包括5處國家級自然保護地和3處省級自然保護地。其中國家級自然保護地包括甘肅祁連山國家級自然保護區、甘肅鹽池灣國家級自然保護區、甘肅天祝三峽國家森林公園、青海仙米國家森林公園和青海祁連黑河源國家濕地公園。該地區的地形主要為高山和盆地，海拔在4000～5000米之間，屬于高原大陸性氣候，年平均氣溫在4攝氏度以下，降水主要集中在5-9月，年降水量在400毫米左右。由于地形和氣候特征的影響，該地區生態系統獨特，分布有森林、草原、荒漠、濕地和冰川等景觀。此外，該地區還廣泛分布著黑河、八寶河、托勒河、疏勒河、黨河、石羊河、大通河等河流，野生動植物資源豐富，是中國西部生態的安全屏障。
人文景觀
山丹軍馬場
山丹馬場位于祁連山冷龍嶺北麓的大馬營草灘（史稱漢陽大草灘），這里地域廣闊，土壤肥沃，水源充足，牧草豐盛，是天然的駐牧場所。
在先秦兩漢之前，這里曾是烏孫、大月氏、匈奴等游牧民族的天然牧場，他們在這里駐牧和相互紛爭。漢元鼎四年（公元前113年），劉徹“夢駿馬生渥洼水中”，遂作《天馬歌》，下詔設苑馬寺負責馬政，在河西各郡分設牧師苑（牧馬場），漢陽大草灘即為其中最大的牧馬場。自此，這里成為歷代皇家軍馬養殖基地，經久不衰。杜甫有詩《房兵曹胡馬》贊曰：“胡馬大宛名，鋒棱瘦骨成。竹劈雙耳峻，風人四蹄輕。”馬場草原承載了漢武帝牧馬強軍的征戰夢；成就了無數征戰將士“金戈鐵馬”“馬革裹尸”的英雄夢和諸多馬背草原民族期盼牧草興旺，牛羊肥壯，生活幸福安康的草原夢，因此有“馬場夢”之稱。直到新中國成立前，國民黨政府管理的山丹軍牧場還有馬匹11800多匹。新中國成立后，采取飛播牧草的方式，恢復草場，建置軍馬場，牧養良馬。1967年，山丹軍馬場還為毛澤東、彭德懷、賀龍選送過坐騎。時至今日，這里仍享有亞洲第一大馬場的美譽。
麥昆哇爾瑪大型藏寨古建筑群
在上阿壩藏族羌族自治州安斗鄉、甲爾多多到中阿壩、下阿壩的安羌鄉、查理鄉等廣袤地區，遍布著土房藏寨建筑群。其中，縣城附近的安昆哇爾瑪大型藏寨土建筑群是整個藏區罕見的大型古建筑群。
據傳，麥昆、哇爾瑪大型臧寨建筑群歷史悠久，早在唐朝貞觀年間，藏王松贊干布與文成公主進藏時就曾在此停留數月。今天，麥昆哇爾瑪大型藏寨古建筑群主要分布在麥昆鄉齊卡洛村和哇爾瑪鄉鐵窮村等平坦的河谷地帶。遠遠望去，數以千計的平頂土房建筑像神秘的放射狀條帶般點綴在這里，形成一個龐大的建筑群落。藏寨之間溪流蜿蜒，周圍麥浪滾滾，隨風蕩漾。這里有金黃的稞麥、胡豆、豌豆，還能看到古老的二牛抬杠等耕作方式，同時牛耕、馬耕、驢耕、機耕并存。
相關文化
神話傳說
黑河大峽谷
據傳說，馬步芳在西寧市修建公館期間，曾砍伐六萬棵樹木，并希望將它們順水漂到西寧。然而，下游的人卻一個木頭都沒有等到。經過一番細致的搜尋，人們發現在黑河中段存在一段類似于黑洞的地方，樹木在這里被卷入水中后便消失無蹤，再也找不到了。
祁連卓爾山與牛心山
傳說一：據傳，卓爾山和祁連山的鎮山之山——牛心山（阿咪東索），是一對傳說中的情侶。傳說卓爾山（宗姆瑪釉瑪原）是一位龍界公主，她在一次偶然的邂逅中愛上了守護這里的山神——英武非凡的阿咪東索。她為了嫁給阿咪東索，冒犯了龍王，并選擇留在人間，與阿咪東索隔河相望，不離不棄。兩人默默守候在八寶河兩岸，共同護佑著祁連山的山山水水。
傳說二：相傳遠古時期，祁連山曾是一片汪洋大海，妖魔四起。傳說中的格薩爾王得知此情況后，從印度專門派出了一位山神前來降妖魔、疏通海洋，并帶領四大王管轄祁連山。據說，牛心山主峰是這位山神的所在地，周圍四峰則是四大天王。另外一位山神專門管轄海洋，使其永遠不泛戰鼓之聲。兩位山神疏通汪洋，散播金銀，使珍禽異獸成群，讓蘑菇和大黃遍布山林，金銀銅鐵遍地。由此，“祁連八寶”在傳說中聲名遠揚。
傳說三：宗姆瑪釉瑪原是一位龍界公主，她在一次偶然的邂逅中愛上了守護這里的山神——英武非凡的阿咪東素。她為了嫁給阿咪東素，沖破了天規和各種阻礙，并選擇留在人間與阿咪東素隔河相望，不離不棄。不過，據傳為此付出了代價，她變成了現在的卓爾山。
詩詞
月明飲馬長城窟，雪深射虎祁連山。——揭傒斯《題邢先輩西壁山水圖》
物色祁連山前路，又似逾妝渡隴水。——陸文圭《跋牧馬圖》
熟看境色非人間，祁連山下想如此。——劉克莊《蘇李泣別圖》
祁連山下烽如月，無定河邊陣是云。——王穉登《出塞》
只今墮在萬里外，日光那到祁連山。——艾性夫《昭君出塞圖》
現代文化
歌曲《祁連山》，由知名歌手翟惠民演唱，收錄于《遺罪千秋》專輯中。
2022年1月12日，甘肅省作品《祁連山國家公園》入選2021年第三季度優秀國產紀錄片榜單。《祁連山國家公園》是甘肅省首部以純野生動物為主題的紀錄片，呈現了祁連山國家公園內眾多一級保護動物如雪豹、黑頸鶴、野牦牛和白唇鹿等的故事。該片標志著甘肅本土自然類紀錄片領域的一個新突破。該片于2021年9月29日和30日在央視紀錄片頻道首播。
裕固族的作家文學中，隨時可以看到“祁連山”命名的作品，詩歌如賀繼新的《永恒的祁連山》《祁連山的風采》，妥清德的《祁連山中》《祁連山腹地》，強成江的《祁連山斷章》《祁連山峰》，賀雪忠的《我贊美您，祁連山》《風中的祁連草原》；散文如鐵穆爾的《失我祁連山》《蔚藍色的山脈——祁連山筆記》，達隆東智的《雪落騰格里》(騰格里即祁連山)等。而以祁連山各種風景命名的篇章更是數不勝數，詩歌如白文林的《隆暢河邊》《黑駿馬·牧人·草原》，賀中的《皇城》，妥清德的《疏勒河》《黑河，許多野雉隱藏在密林里》，強成江的《夏日的紅灣寺》《丹霞斷章》，賀雪忠的《紅石窩，永遠的豐碑》《神奇的丹霞》《夢中的海子湖》，巴戰龍的《聆聽母親河》《跟他到草原上去吧》，蘇柯靜想的《美麗肅南我的家》《走進馬蹄》《心中的夏日塔拉》，蘭永武的《又見馬群》《黃昏羊群》，董瀟紅的《海牙溝風景》《雪蝴蝶》，杜曼·扎斯達爾的《孔崗木之秋》；散文如鐵穆爾的《星光下的烏拉金》《長滿狗牙草的冬窩子》《焦斯楞的呼喚》，安玉冰的《隆暢河的回憶》《走進七一冰川》；小說如杜曼·納姆加的《山地民謠》《深山·歲月·獵人》，達隆東智的《古老的冬營地》《悠悠牧草地》等。
相關事件
2025年10月6日，青海門源回族自治縣人民政府發布通告，禁止在祁連山區冷龍嶺探險、穿越、徒步。通告稱：近期，發現部分徒步探險愛好者私自進入門源縣祁連山區冷龍嶺區域開展徒步探險活動，由于該區域平均海拔超過4000米，且天氣多變、地形復雜，加之連續降雪，危險性極大。為保障人民群眾生命安全，嚴禁任何組織和個人在門源縣祁連山區冷龍嶺區域開展徒步穿越活動；各旅行社、俱樂部、民間組織等社會團體不得以探險、穿越、科考、攀登雪山等為名，組織團隊和個人進入該區域，以及門源回族自治縣其他明確標識禁止進入的區域，開展徒步穿越、登山、探險、露營等活動；對擅自進入門源縣祁連山區域開展探險、穿越、徒步活動的組織和個人，造成的一切后果將被依法追究相關法律責任。
參考資料 >
“夢幻海北”文旅資源推介之 “天境祁連”篇——【?祁連山】.海北藏族自治州人民政府.2025-04-30
“夢幻海北”景區（點）推介 之 “天境祁連”篇——【?祁連山】.海北文旅微信公眾平臺.2026-01-08
來山丹，叩響河西走廊的門閂.中國國家地理微信公眾平臺.2026-01-08
新調整的《國家重點保護野生動物名錄》公布.中華人民共和國中央人民政府.2023-04-18
中華人民共和國野生動物保護法（2022年修訂版）.益陽市人民政府.2023-04-18
青海省地方志-志鑒成果庫.青海省地方志.2023-05-15
【省科技廳】祁連山東段科考工作啟動. 青海省人民政府網.2023-05-16
青海省生態環境廳.青海省生態環境廳.2023-05-15
甘肅祁連山國家級自然保護區管理條例.甘肅省生態環境廳.2023-05-15
青海省生態環境廳.青海省生態環境廳.2023-05-15
祁連山生態保護成效顯著.人民網.2023-04-25
2022年祁連山地區環境質量狀況.甘肅省生態環境廳.2023-05-15
讓綠水青山常在——我省努力將祁連山打造為生態保護典范.甘肅省人民政府.2025-08-19
山丹軍馬場:亞洲第一大馬場.山丹縣人民政府.2023-05-15
麥昆哇爾瑪大型藏寨古建筑群景區旅游攻略.阿壩縣人民政府.2023-05-15
作品《祁連山國家公園》入選優秀國產紀錄片.中國甘肅網.2023-04-23
青海門源發布通告：禁止在祁連山區冷龍嶺區域 開展探險、穿越、徒步活動.抖音短視頻.2025-10-09