葉爾羌汗國（Yarkand Khanate）是明正德九年至清康熙十九年間（1514-1680年）東察合臺汗國禿黑魯帖木兒汗的后裔薩亦德以葉爾羌（今新疆莎車縣）為中心建立的一個地方性政權，境內居住著畏兀兒人、吉利吉思人、月即別人及可薩人，其中畏兀兒人是統治民族。葉爾羌汗國國祚[zuò]166年，歷12代汗。
1347年，察合臺汗國分裂為東西兩部分，東部地區統治者阿黑麻汗去世后，其子滿速兒汗繼位，并聯和西部地區的馬合木汗（阿黑麻汗的兄長）打擊自己的弟弟薩亦德，以擴大自己的勢力。在交戰過程中，薩亦德擊敗原葉爾羌地區的統治者阿巴·癿[bié]（qié）乞兒，占領葉爾羌城，乘勝追擊至巴達赫尚（巴達克山），殺阿巴拜克，盡據六城，同年6月登上汗位，由此建立葉爾羌汗國。
此后，葉爾羌汗國歷代統治者發展經濟，壯大勢力，并多次以“圣戰”的名義討伐柯爾克孜族、巴達克山、博洛爾等地區，汗國于馬黑麻汗時期達到鼎盛。1600年，汗國疆域東至嘉峪關市前，與明朝接壤，西南以喀喇（lā）昆侖山為界，與烏斯藏的拉達克、博洛爾相鄰，西方與烏茲別克布哈拉汗國為鄰，與烏茲別克以費爾干納谷地為界，北以天山為界，與哈薩克族、吉利吉思、瓦剌（là）相鄰。
汗國晚期，政治持續動蕩，日漸衰微的汗權只能依附于國內兩支對立的伊斯蘭教勢力——黑山派和卓和白山派和卓，以柯爾克孜族人為代表的被統治者民族也加入到這一激烈的政教斗爭中。汗國最后一任統治者伊思瑪業勒汗在上位后，大力打擊白山派和卓勢力，該派首領阿帕克和卓逃至準噶爾汗國，并將國內的混亂局勢告知博碩克圖汗。1678年準噶爾首領噶爾丹介入扶植傀儡政權，1680年，準噶爾汗國攻入葉爾羌城，葉爾羌汗國宣告滅亡。
中國西域史學家魏良弢（tāo）評價葉爾羌汗國時期是新疆發展歷史中的重要時期，這一重要性突出表現在經濟方面和文化方面。經濟上，葉爾羌汗國時期處于復興和轉變階段，即由游牧非定居的生活方式轉向農業定居的生活方式，同時，由于優越的地理位置，汗國與外界聯系緊密，與中原王朝保持著較長時段的朝貢貿易往來。文化上，正是在這一時期，以喀什噶爾（今新疆喀什）為中心的伊斯蘭教文化政治區和以吐魯番市為中心的佛教文化政治區完成了伊斯蘭化的統一，為日后維吾爾民族的形成創造了條件。
建立背景
察合臺汗國（1222-1347年）是成吉思汗次子察合臺的封國。1347年，在軍事貴族的爭權奪利下，察合臺汗國正式分裂成東西兩部分，即禿黑魯·帖木兒汗及其后裔統治的東察合臺汗國和巴魯刺思部異密帖木兒及其后裔統治的帖木兒帝國。15世紀下半葉，東察合臺汗國又進一步分裂成三大部分，分別為羽奴思汗及其后裔控制的西部地區，也先不花二世汗及其后裔控制的東部地區及來自朵豁刺惕部異密家族的阿巴·癿乞兒及其后裔控制的向陽地。
羽奴思汗在也先不花汗去世后，占據了阿克蘇地區，隨后又帶領部族定居于迭失干地區，他大力發展農業，推崇定居生活的政策遭到部分人反對，這些人擁立其少子阿黑麻為汗，返回蒙古斯坦。在阿黑麻汗的經營下，蒙古斯坦各部重獲統一，他本人也成為東察合臺汗國東部地區的汗，并收復了畏兀兒，定都吐魯番盆地。1487年，羽奴思汗的長子，即阿黑麻汗的兄長馬合木繼承汗位，統治東察合臺汗國西部地區。1501年，阿黑麻汗命長子滿速兒監國，親自帶著兒子薩亦德速檀等人救援被月即別（烏茲別克）的昔班尼汗困住的馬合木汗，戰敗后歸國，不久病死，滿速兒正式即位。
在這場戰爭中，薩亦德不幸大腿中箭，被當地人送到阿黑昔城，但該城的監治官已經叛國，于是，他被投入獄中。一年后，昔班尼汗占領該城，并將薩亦德帶回國內，視之如己出。薩亦德趁昔班尼汗出征之際，逃至其叔父馬合木汗的駐地哲德干，后又投奔其弟，時任吉利吉思監治官的哈里勒速檀。此后四年間，薩亦德和哈里勒聯合對抗他們的兄長滿速兒汗和叔父馬合木汗，最終，薩亦德、哈里勒落敗，薩亦德又開啟了逃難生涯。
在逃難期間，薩亦德曾遭到葉爾羌統治者阿巴·癿乞兒部隊的襲擊，在走投無路之際，他決定逃往費爾干地區的安集延。在到達安集延之后，薩亦德被當地管理者監禁，幸運的是，費爾干的統治者札尼別速檀愿意放行，雖然札尼別之后又下令處死他，但薩亦德早就離開了安集延。此后，他一路喬裝打扮，風餐露宿，終于在1508年年底到達可不里（今阿富汗喀布爾），并受到統治者巴布爾的盛情款待。在這里居住了兩年多，1510年，薩亦德在巴布爾和當地蒙古異密的支持下，到安集延支援處于困境中的朵豁刺惕部異密賽亦德·馬黑麻。
1511年，薩亦德率軍來到安集延，與月即別速檀們、阿巴·癿乞兒的軍隊展開了一系列攻守戰，并大敗癿乞兒，同時，巴布爾占領撒馬爾罕，月即別速檀們當即從費爾干地區撤軍。1514年，月即別速檀們再次攻打費爾干，薩亦德率部進行戰略轉移，進兵喀什噶爾。由于喀什噶爾城不易攻取，薩亦德決定攻取英吉沙爾城。在此期間，吉利吉思部首領馬黑麻前來投奔，并自告奮勇去葉爾羌偵查癿乞兒的軍事部署。在得知阿巴·癿乞兒募軍不力后，薩亦德決定向葉爾羌進軍，但由于部分軍士秘密逃離，為振奮軍心，薩亦德還是決定先攻取英吉沙爾。在攻城期間，薩亦德和阿巴·癿乞兒互派偵查部隊，雙方偶遇展開作戰，薩亦德部隊勝利，并俘獲了英吉沙爾城主的兒子。在攻城第六天，薩亦德答應了英吉沙爾城主提出的條件，城主獻城投降。喀什噶爾的駐軍聽聞消息，棄城逃走，薩亦德乘勝向葉爾羌進軍。此時的葉爾羌城內一派混亂，阿巴·癿乞兒和其子賈汗吉兒·米兒不戰而逃，薩亦德順利占領葉爾羌城。
歷史變遷
汗國建立
1514年9月3日，薩亦德在葉爾羌城登上汗位，標志著葉爾羌汗國的建立。建國伊始，為鞏固汗位，獲得各部落支持，薩亦德汗允許軍隊在城內劫掠兩個月，并大力獎賞各部異密和將士。次年，薩亦德汗委派艾曼·火者速檀重建阿克蘇市，并擔任該地總督。1516年，薩亦德汗與滿速兒汗會晤，薩亦德汗自愿稱臣，該會晤不僅在形式上實現了東察合臺汗國的統一，而且有利于雙方和平發展。同年，為維持國家運轉，他決定在喀什噶爾集結軍隊，出征安集延，但因軍力不足，計劃擱置，改為在次年出征撒里畏兀兒。
此后，他又先后討伐吉利吉思首領馬黑麻，巴達克山米兒咱汗。1520年夏，薩亦德汗與滿速兒汗再次會晤，穩固雙方友好關系。兩年后，為獲取蒙古斯坦的草原資源，在部分將領的支持下，薩亦德汗打著“圣戰”的旗號，進軍蒙古斯坦，討伐當地的“異教徒”吉利吉思人，這場戰爭延續了五年之久，最終以失敗告終，并引起了統治集團內部的震蕩。1527年，薩亦德汗又以“圣戰”的名義令其子拉失德速檀出征博洛爾，次年得勝歸國。1529年，薩亦德汗第二次進入巴達克山地區，討伐當地的月即別人，此舉引起了巴布爾的不滿，雙方局勢緊張。1532年，薩亦德汗向烏斯藏發動“圣戰”，并派出馬黑麻·海答兒和他自己的兒子亦思干答兒速檀為先行部隊，在這場軍事行動中，克什米爾最終臣服于葉爾羌汗國，雙方結為姻親，薩亦德汗受到寒冷天氣以及高原反應的影響，1533年7月9日于歸國途中病逝。
繁榮發展
薩亦德汗的猝然病逝，激起國內政壇風云動蕩，拉失德速檀以雷霆手段處決了權臣賽亦德·馬黑麻，登上汗位。此后逐步除與賽亦德所屬的朵豁刺惕部異密勢力，解散其侄兒馬黑麻·海答兒的軍隊，放逐與其關系密切的汗室成員，如薩亦德汗的嫡妻、妹妹和亦思干答兒速檀，升馬黑麻·巴魯刺思為汗國最高異密以打擊阿里·塔海為首的保守勢力，并最終將阿里·塔海驅逐。同一時期，滿速兒汗首先違背盟約，先后兩次進兵阿克蘇地區，都被拉失德汗擊退，這些勝利標志著葉爾羌汗國不再臣服于東察合臺汗國。為了鞏固統治，拉失德汗一方面派遣諸子擔任總督，加強對地方的控制，另一方面調整對外政策，與西部宿敵月即別昔班尼王朝結成軍事聯盟，共同攻打哈薩克族人和柯爾克孜族人，并大獲成功，但最終也未能徹底征服蒙古斯坦地區，只在阿克蘇市和喀什噶爾駐兵威懾。在國家逐漸穩定之后，拉失德汗開始推進文化建設，他批準了王妃阿曼尼莎汗整理木卡姆的請求，并特別指明原宮廷首席樂師柯德爾汗主持這項龐大的工作，最終促成了木卡姆的體系化，為后人留下了一筆輝煌的精神財富。拉失德汗本人也多才多藝，尤其擅長詩歌創作。在《編年史》中，收錄了他創造的一首波斯文詩和一首突厥文詩。
1559年的一次巡游中，拉失德汗突然去世，在部分汗室成員、上層貴族和國內宗教勢力的支持下，拉失德汗次子阿不都哈林登上汗位，在前朝獲得權勢的巴魯刺思部異密勢力被打壓。阿不都·哈林汗在位時期，對內重視法律的制定實行，并大力支持伊斯蘭教發展，一方面促進了蒙古部族與當地土著的融合，另一方面也直接導致了歸屬伊斯蘭教納克什班底派的和卓家族的興起，逐漸從單純的世俗政權支持者轉變為操縱者；對外繼續實行拉失德汗的外交政策，與月即別昔班尼王朝保持友好同盟關系，多次征伐哈薩克族和柯爾克孜族，并于1570年歸并東察合臺汗國，使得汗國的疆域大為拓展。1591年，阿不都·哈林汗逝世于葉爾羌城。
阿不都·哈林汗逝世后，其五弟，時任喀什噶爾地區總督一職的馬黑麻速檀繼任汗位。馬黑麻汗統治時期，政治清明，經濟繁榮，貿易互通有無，人民安居樂業，被認為是汗國最強盛的時期，其突出體現還包括基本穩定下來的廣闊的疆域版圖。經學者魏良弢考證，1600年的葉爾羌汗國疆域東至嘉峪關前，控制著要地哈密地區，與明朝接壤，南以昆侖山脈、阿爾金山脈為界，與烏斯藏、蒙古屬部相鄰，西南以喀喇昆侖山脈為界，與烏斯藏的拉達克、博洛爾相鄰，西以月即別的阿賴山為界，與莫臥兒帝國相鄰，包括整個帕米爾高原及噴赤河西的希瓦，興都庫斯山北的瓦罕地區，北以天山為界，與哈薩克、吉利吉思、瓦剌相鄰。
走向滅亡
馬黑麻汗的繼位得到了黑山派和卓勢力的支持，后者也深受馬黑麻汗的器重，成為當時汗國伊斯蘭教中最強大的宗教勢力，并將權力的觸角伸到汗國各個領域。馬黑麻汗在世時，違背了“長者為汗”傳統，任命自己的兒子阿黑麻為喀什噶爾總督。在馬黑麻汗去世后（1609年），和卓沙迪扶持阿黑麻繼位，作為回報，阿黑麻汗大力賞賜和卓沙迪等重臣。然而，統治汗國東部地區的阿都刺因表示明確反對，成為最大的分裂勢力，地方首領和貴族叛亂頻發，阿黑麻汗最終也死于由沙家族發動的一場政變中。
1618年，在沙家族和宗教界的支持下，阿黑麻汗的堂兄弟忽來失速檀被登上汗位。喀什噶爾的總督，年僅14歲的拉提甫速檀決意消滅這些殺害阿黑麻汗的反叛者，在和卓勢力的幫助下，他取得了勝利，成為了葉爾羌汗國新的統治者。在其統治期間，汗國處于水深火熱之中，內有統治集團之間的爭權奪利，利用暗殺手段除去政敵，外有汗國東部統治者阿都刺因汗勾結哈薩克入侵阿克蘇以及虎視眈的瓦剌勢力。1630年，年僅26歲的拉提甫汗病逝，在位12年。
拉提甫汗去世后，阿克蘇市總督速檀阿黑麻動身前往葉爾羌，繼承汗位。喀什噶爾總督馬合木決定奪取汗位，發動叛亂，并于1632年順利登上汗位，在位近3年，就死于和卓沙迪發動的一場秘密政變中。按照蒙古傳統，速檀阿黑麻汗得以再次繼位，但由于他損害了速檀馬合木汗的武將們的既得利益，后者紛紛轉向汗國東部統治者阿布都拉哈汗麾下。此后，阿不都拉哈汗發動第一次喀什噶爾戰役，和卓沙迪為了以備不測，開始拉攏阿不都拉哈汗。1638年，在黑山派的幫助下，阿不都拉哈汗幾乎兵不血刃地進入葉爾羌城，汗國的分裂局面就此結束，進入阿不都拉哈汗統治時期。
阿不都拉哈汗即位不久，便擊退了瓦剌的軍隊，攻下庫車，南征博洛爾和巴達克山，西征費爾干，并主動出擊吉利吉思，與其激戰于阿克賽（今托什干河與納林河之間的地區），最終大獲全勝，史稱“阿克賽進軍”。在內政方面，阿不都拉哈汗為鞏固汗位，并不十分偏重某一勢力，而經常以新貴代替舊寵，這一做法招致了某些貴族的不滿，他們趁阿不都拉哈汗朝圣出城，迎接喀什噶爾總督尤勒巴爾斯速檀，試圖發動政變，但最終失敗。尤勒巴爾斯速檀并沒有氣餒，他繼續積蓄力量，聯合白山派和卓勢力對抗中央政權和黑山派和卓勢力，并利用阿不都拉哈汗多疑的性格，削弱其倚靠的勢力。1667年，聽聞尤勒巴爾斯速檀即將進攻葉爾羌，阿不都拉哈汗以前往圣地麥加朝圣為由倉皇出走，此后，尤勒巴爾斯速檀稱汗。
尤勒巴爾斯汗統治時期，國內政局動蕩，由于黑山派早前受到打壓，此時的政治斗爭已經脫離黑山派與白山派兩大和卓勢力之爭，而轉向準噶爾汗國兩派政治勢力之爭。準噶爾汗國的僧格支持尤勒巴爾斯汗，而其政敵厄勒丹臺什支持伊思瑪業勒汗。在一次政治斗爭中，尤勒巴爾斯汗被殺，其子阿不都·拉提夫繼位。伊思瑪業勒汗趁機攻打葉爾羌城，于1670年成功入城，成為新的統治者，黑山派重掌政權。白山派首領阿帕克和卓逃至克什米爾，之后又進入西藏自治區，在阿旺羅桑嘉措阿旺羅桑嘉措的幫助下覲見了準噶爾汗國的博碩克圖汗，他聽取了阿帕克和卓的建議，趁葉爾羌汗國國亂之際，進軍喀什噶爾和葉爾羌城。1680年，葉爾羌城破，伊思瑪業勒汗及汗室成員被俘，送往伊犁哈薩克自治州，葉爾羌汗國滅亡，歸并準噶爾汗國。
民族融合
葉爾羌汗國時期，伊斯蘭教在汗國內部迅速發展，來自蒙古高原的察合臺汗國后裔與新疆南部綠洲的土著居民基本都成為伊斯蘭教教徒，并開始相互認同。在政治、宗教統一的基礎上，原本熱衷于游牧生活的蒙兀兒人逐漸轉向定居生活，雙方開始通婚，狹隘的地方意識逐漸被瓦解，共同的民族心理意識萌生，現代意義上的維吾爾族開始形成，并在汗國滅亡后繼續向前發展。
政治制度
繼承制度
葉爾羌汗國繼承了蒙古部落傳統，由忽里臺大會決定并宣布汗位繼承者，參會者包括王室成員，各部異密，中央官員。隨著伊斯蘭教勢力的崛起，伊斯蘭教上層人士也參與到忽里臺中。汗位繼承一般遵循“長者為汗”的原則，即選擇最年長的速檀為汗。
分封制度
葉爾羌汗國遵循草原部落的家產觀念，將汗國分封給汗族成員，稱總督。總督們對封地享有完全的統治權，汗不得干涉，但這一權力并不世襲。為了加強對地方的控制，汗從中央派出手握軍權的阿塔利克擔任總督的老師，起監督作用，后又派出阿奇木，管理地方軍政，派出哈孜，負責審理地方法律案件。此時的總督分為兩種，一種割據一方，如吐魯番的巴拜汗，一種有名無實，完全喪失治理權，如伊思瑪業速檀。
職官制度
汗國建立后，因統治階層的需要，一套比較完整的職官制度建立起來并不斷適應著政治和社會的變化。汗國早期，軍事貴族的影響較大，汗國內部實行軍民合一制度，帶有突厥化、伊斯蘭化色彩的異密、別吉、伯克等官稱出現，他們掌控著汗國軍隊，并常常兼理行政。隨著汗權的穩定和加強，中央官制日漸完善。此外，伊斯蘭教的繁榮發展，由游牧生活向農業定居生活的過渡，氏族部落的加速解體，募兵制的興起諸多變化都影響著國家政治，并體現在官制中。
政教結合
早在東察合臺汗國禿黑魯·帖木兒汗統治時期，統治集團就接受并大力宣傳伊斯蘭教中的蘇菲派。在葉爾羌汗國建立后，賽亦德汗宣布伊斯蘭教為國教，并以納克什班底教派蘇菲為師，汗國由此開始伊斯蘭化。伊斯蘭教的傳入對汗國政治、經濟、文化方面都產生了重要影響。在政治方面，伊斯蘭教教法成為立法的主要依據，宗教人士成為獨立的社會階層，擁有獨立的官職體系具備組織、規范教徒行為，依照伊斯蘭教教法處理民事、刑事案件，解釋伊斯蘭教教法的權力。統治者也開始使用“蘇丹”這一極具伊斯蘭教色彩的稱呼。另外，由于實行導師制度，不僅是普通平民，上層統治者也熱衷于拜師，導致政治和宗教開始結合。在經濟方面，國內部分教徒將土地贈予伊斯蘭寺院、學校，稱為瓦各夫土地。在社會方面，麻扎朝拜的風氣開始盛行，麻扎即所謂“伊斯蘭教圣墓”，麻扎朝拜即對“圣墓”進行朝拜的宗教活動。由于汗國上下對宗教的狂熱，麻扎的規模趨向大型化，其中最為著名的麻扎即白山派和卓墓地，俗稱的香妃墓。在文化方面，汗國內的文學、歷史、音樂、舞蹈等都不可避免地帶有伊斯蘭教文化的色彩，如神秘主義、圣徒崇拜、遁世主義。
除了以上所述，宗教對葉爾羌汗國歷史的影響之大，尤其表現在黑山派和白山派的政教之爭中。黑山派和卓和白山派和卓同屬西域和卓家族，都是中亞伊斯蘭教蘇菲派納克什班底教派領袖瑪哈圖木·阿雜木的后裔，他們在宗派儀規上并不存在根本不同，但縱觀葉爾羌汗國歷史，卻基本處于敵對狀態。16世紀中葉，在瑪哈圖木·阿雜木去世后，圍繞著宗教領導權，其長子伊禪·卡朗和幼子伊斯哈克·瓦里展開斗爭，這便是白山派和黑山派矛盾的開端。16世紀60年代，伊斯哈克進入葉爾羌汗國統治下的天山以南地區傳教。在阿不都·哈林汗時期，這一活動遭到限制，直到馬黑麻汗時期，黑山派勢力才完全站穩腳跟，并開始急速發展，進而插手政治，其中以和卓沙迪對汗國政權的操縱最為突出。黑山派的權勢滔天當然會引起蘇丹的不滿，阿布都拉哈汗時期，白山派勢力開始迅速崛起，并與黑山派發生正面沖突，激烈的政教斗爭對汗位的繼承造成極大影響，并進而引起社會的動蕩。最終，汗國在黑山派和白山派和卓勢力爭斗不止的背景下，被趁虛而入的準噶爾汗國所滅，甚至在汗國滅亡之后，兩派之爭仍在繼續。
外交往來
與東察合臺汗國
在葉爾羌汗國建立之前，汗國的建立者薩亦德汗與東察合臺汗國的統治者滿速兒汗之間存在矛盾和紛爭，但薩亦德汗在建國后，卻冰釋前嫌，主動與滿速兒汗進行會晤，并自愿稱臣，附屬于東察合臺汗國。這一和平的態勢并沒有維持太久，在薩亦德汗去世之后，滿速兒汗便主動打破了盟約，進犯阿克蘇地區，汗國新的統治者拉失德汗的兩次成功保衛標志著葉爾羌汗國的獨立。在葉爾羌汗國日漸發展的同時，東察合臺汗國國力日漸衰退，疆域局限于吐魯番盆地、察力失和哈密市三地，兩國之間的關系重歸穩定。據《編年史》記載，在馬黑麻汗還是阿克蘇市總督時，想將東察合臺汗國沙汗的女兒搶來做他的妻子，最終失敗，但這一行為招來了沙汗的抱負，他攻破阿克蘇城，俘獲馬黑麻汗，在阿不都哈林汗的請求下，馬黑麻汗才得以回國。1570年，阿不都·哈林汗派遣瑣非速檀、馬黑麻速檀、阿卜撒亦速檀和忽來失速檀強占吐魯番，東察合臺汗國歸并進了葉爾羌汗國。在馬黑麻汗統治時期，任命阿都刺因速檀為吐魯番市總督。
與中原王朝
葉爾羌汗國與中原王朝的外交從整體上來說是和平的，雙方在官方層面保持著通貢往來，民間貿易亦十分頻繁，但仍舊不時會有領土之爭。如在阿不都·哈林汗時期，為了穩定吐魯番盆地的局勢，他下令鎮壓了當地親明勢力，并趁機進犯甘州等地。明清鼎革之際，葉爾羌汗國與中原王朝仍舊保持著通貢貿易。順治帝元年（1644年）三月，崇禎于京城自縊而亡。五月，清軍擊敗農民軍。十月，順治帝進入北京。阿布都拉哈汗聽聞此消息，立即將清朝奉為正統，遣使通貢。順治帝欣然同意，并規定仍舊按照明朝的通貢制度與汗國進行貿易往來，兩國之間正式建立外交關系。然而，葉爾羌汗國統治下的區域并不太平，哈密市、吐魯番的部分土著居民參與進了反清武裝中，嚴重影響了兩國之間往來。在叛亂平定之后，雙方重新修復關系。在準噶爾汗國勢力興起，吞并了葉爾羌汗國之后，汗國的原屬區域仍舊與清朝保持著正常的朝貢關系。康熙帝在位時，試圖以支持逃散的原葉爾羌汗國王室成員報仇的方式來對付噶爾丹殘余勢力，但最終未有成果。此后，在康熙、乾隆等皇帝的努力下，清朝的對疆政策不斷完善，最終成功將新疆納入版圖。
與準噶爾汗國
準噶爾汗國是衛拉特分支準噶爾部在新疆地區建立的草原游牧政權，于1679年成立，定都伊犁。葉爾羌汗國晚期，國家內部發生了嚴重的政教紛爭，新任統治者伊思瑪業勒汗支持黑山派，白山派首領阿帕克和卓逃至克什米爾，后在達賴喇嘛的幫助下覲見了準噶爾汗國的博碩克圖汗，他得知了葉爾羌國內的混亂，便計劃進軍喀什噶爾和葉爾羌城。1680年，葉爾羌城汗國滅亡，歸并準噶爾汗國。但準噶爾汗國并沒有在此進行直接統治，而是保留原有的政治制度，扶植出身察合臺汗國后裔的速檀作為代理人，如阿卜都·里什特汗，還有他的二弟馬哈麻特·額敏汗，在這兩位汗統治期間，他們與和卓阿帕克之間發生了激烈沖突，阿卜都·里什特汗，馬哈麻特·額敏汗被殺。在策妄阿拉布坦繼承了準噶爾汗國汗位后，一改此前的政策，轉而利用和卓家族來掌控時局。
社會經濟
社會經濟結構
據米爾咱·海答兒所述，早期的葉爾羌汗國內存在著四類不同的人群：一是定居居民，他們大多從事農業生產，或經營手工業，并向汗交稅。二是游牧民，他們逐水草而居，以牛馬為主要財產，平時不繳納賦稅，但在戰時要隨軍出征，并通常以部落的形式存在。在汗國晚期，隨著氏族部落的解體，這類人群漸漸融入定居居民中。三是士兵，他們從游牧民中獨立出來，日常不再放牧，而代之以軍事訓練，是國家的常備軍，享有一定的特權。四是官吏和宗教人士，他們在政治和經濟方面擁有強大的實力，屬于統治階級。
土地制度
據魏良弢研究，葉爾羌汗國大體存在國有土地、私有土地、瓦各夫土地三類土地。其中，國有土地由佃農耕種，他們耕種的收獲大部分上交國家，受到嚴重的剝削，相對的，國家財政則獲益頗多。私有土地在所有土地中占比最大，其所有者需要向國家繳納十分之一的稅。瓦各夫土地即伊斯蘭教寺院、墓地和學校擁有的土地，這些土地享有無需交稅的特權，是宗教勢力發展的經濟基礎。
農業和畜牧業
葉爾羌汗國時期的農業已有所發展，并以天山南部及東部的吐魯番市、哈密市為農業最發達的地區。其中，天山南部的綠洲地區十分有利于發展農業，當地的農產品主要有糧、棉、麻及瓜、果等。總的來說，汗國的農業具有如下特點：一是農田與林園相結合，二是林園與集鎮相結合，即有田必有林，有鎮必有園，綠洲周邊則是隔壁沙漠，三是重視水利灌溉，在吐魯番、哈密等地，當地居民很早便掌握了鑿井汲水的技術。
農業雖然成為了葉爾羌汗國的主要經濟部門，但畜牧業仍舊占據著比較重要的地位。汗國最優質的放牧區域是天山北部的別失八里。歷代統治者十分重視畜牧業發展，如立國的薩亦德汗便曾擬定一個往天山北部擴張以發展畜牧業的計劃，但終因外部勢力的興起而失敗。除了家養牲畜外，牧民偶爾也會進行狩獵，虎、豹、貂、雕等動物都是他們狩獵的目標。
手工業
葉爾羌汗國的手工業發展繁榮，品類眾多，其突出代表包括：紡織、刺繡和編織行業；天山南部的采礦和冶煉行業，如喀什噶爾的寶石、金銀，和田的美玉；金屬制造業，如用于軍事作戰的盔甲、馬甲以及簡單的火器；天山南部的釀造業，如當時的特色飲料，多飲即醉的馬奶。以葉爾羌城為首的龐大輝煌的建筑以及普通居民居住的土木結構的房屋也反映了當時汗國手工業的發展水平。
商業
葉爾羌汗國向外輸出的商品主要為玉石，其中最優質的當屬和田河中開采出的和田玉籽料。汗國國內國際貿易繁榮，橫貫汗國的國際商路有數條，如由阿克蘇市至印度斯坦的商路，就經過葉爾羌、巴達克山、克什米爾等地。此外，汗國與明朝之間存在朝貢貿易的關系，據《大明會典》記載，哈密市、吐魯番盆地等地向將馬、駝、玉石、青金石、速來蠻石、把咱石、金剛鉆、梧桐堿、鐵器、鐵刀、鑌鐵、各色靶小刀、鐵角皮、羚羊角、紅絹道布、柳青撒哈剌禪衣、鞍子、撒袋、花手巾、諸禽皮等物入貢明朝，而明朝也將彩鍛、絹布、絲綢等物賜予汗國。在進京之后，貢使往往被允許購買一定數量的茶葉、瓷器、布匹等物，帶回國內。由此，汗國的某些商人甚至會冒充貢使以牟重利。此外，葉爾羌汗國與明邊境城鎮、及北部某些國家也存在著常態化的貿易往來，雙方以農牧產品和手工品為主要貿易產品。除了正常貿易外，汗國內也存在發放高利貸的現象，一定程度上體現了汗國經濟和貿易發展的繁榮。
錢幣
據《拉失德史》記載，早在薩亦德統治時期，便開始以他的名號鑄造錢幣，以宣示汗位的合法性。葉爾羌汗國錢幣俗稱雅爾瑪克，是一種紅銅質無穿打壓錢幣，雖傳世不多，但已有學者做了一定的收集整理。張建功將收集到的品質上乘的錢幣按照形制分為三類，一是厚餅型（圖1-15）。這類錢幣呈餅塊狀，又大又厚，直徑在15-18.5毫米，平均厚度3.3毫米左右，重量在4.9-5.8克，是最重的一類錢，分為無回歷紀年和有回歷紀年兩種。二是薄餅型（圖16-23），這類錢幣也呈餅塊狀。但小而輕薄，直徑最大為14.5毫米，最小為10.8毫米，平均厚度2.4毫米，平均重量2.4克。三是圓柱型（圖24-31），亦稱“筷子頭幣”，因其形如截斷的一小段筷子而得名。其形狀不甚規整，長短、粗細不一，直徑10-12毫米，長度7-9毫米，重量在5.5克左右，其上銘文圖案較樸素，甚至沒有文字。這類“筷子頭幣”為汗國錢之別種，以奇、稀見稱，有人認為可能是葉爾羌汗國內流通的零錢，上有明顯的流通痕跡。
在汗國內，流通的錢幣除了銅幣外，還有金幣和銀幣，目前已出土幾枚銀幣，但暫未出土金幣。而零星出不統一土的銅幣多是采用當地土法提煉的銅料，以希臘傳統的打壓法制成，因含有雜質，故呈紫紅色，鑄造工藝既不精巧，形制也并不統一，明顯帶有印度北部土邦錢幣的痕跡，一定程度上說明了葉爾羌汗國與印度莫臥兒帝國之間的聯系。研究銅幣上的圖案，既有帶有獨特伊斯蘭教韻味的石榴紋、新月紋，又有展現當時農業生產狀況的植物紋。
城市
葉爾羌城（今新疆莎車縣）是葉爾羌汗國的都城，也是汗國的經濟、政治、文化中心。葉爾羌城的土城墻建于1472年，高8米，頂部寬6米。如今，古城中還保留著葉爾羌汗國王陵、加滿清真寺、莎車城墻遺址等葉爾羌汗國時期的重要歷史文化遺存。
除了葉爾羌城外，汗國內還有一個極其重要的城市，即喀什噶爾（今新疆喀什），汗國的陪都。它位于古代絲綢之路北、中、南線的西端總交匯處，是中西交通樞紐和商品集散地，經濟發達，城市繁榮，因此，葉爾羌汗國的歷代統治者極其重視對喀什噶爾的管理。
人口
據魏良弢估計，葉爾羌汗國中期，即阿不都·哈林汗和馬黑麻汗統治時期（1559-1609年）的農業人口大概有40萬人，且主要集中在喀什噶爾、葉爾羌、和田、阿克蘇市等地區，游牧人口應有大約3萬人，主要分布在天山南麓的河谷牧場，帕米爾高原、昆侖山脈等山地牧場，汗國總體人數在50萬人左右。
文學藝術
史學
葉爾羌汗國時期史學的代表作包括《拉失德史》和《編年史》。
《拉失德史》的作者是來自朵割刺惕家族的米兒咱·馬黑麻·海答兒（Mizra 穆罕默德 Haidar Dughlat，1499-1551），與薩亦德汗、拉失德汗是同時期的人，且與薩亦德汗關系密切，助其創立了葉爾羌汗國，并在汗宮內居住達24年之久，輔佐朝政，謀劃征伐。因此，他根據自己的親身經歷寫成了《拉失德史》。該書完成于汗國第二代君主拉失德汗統治時期，此時的朵割刺惕家族已經沒落，米爾咱·海答兒則統治著克什米爾。該書共分兩編，第一編是正史，記述了自禿黑魯帖木兒登基（1347年）到拉失德汗處死作者叔父賽亦德·馬黑麻（1533年）為止的歷史，第二編是作者的經歷和所處時代的歷史，即自作者降生（1499年）到其第二次進入克什米爾（1541年）的歷史，篇幅比第一遍多上一倍，保存著當時政治、軍事、社會的生動史料，還收錄了一些帝王的行為典范。馬黑麻·海答兒稱此書是獻給拉失德汗的，故稱《拉失德史》。該書原本用波斯文寫成，后被翻譯為突厥文，并留存至今，英國學者羅斯將其翻譯為英文并出版，新疆社會科學院民族研究所根據英譯本翻譯成漢譯本，由王治來先生校注，并于1985年和1986年由新疆人民出版社分為兩冊出版，書名改為《中亞蒙兀兒史——拉失德史》。
《編年史》的作者是沙·馬合木·楚刺思，其祖先是跟隨薩亦德汗進軍喀什噶爾的異密，其家族在馬黑麻汗、阿黑麻汗統治時期（1592-1618年）地位上升。作者曾親眼目睹汗位頻繁更迭和準噶爾汗國軍隊的入侵，葉爾羌漢國的滅亡，因此，該書對于汗國后期政教斗爭的激烈和社會矛盾的尖銳著墨較多。總的來說，該書接續著《拉失德史》而寫，前半部分摘自《拉失德史》，后半部分則是作者編寫，基本史料來自口頭闡述和親身經歷，全書記述了從拉失德汗登基到伊思瑪業勒汗統治中期的歷史。該書只有一個傳世的波斯文抄本，俄羅斯學者阿基穆什金將后半部分進行校訂，并翻譯為俄文出版。
樂舞
木卡姆是維吾爾民族的重要的非物質文化遺產，這是一種集音樂、舞蹈、詩歌于一體的文化表現形式，起源于漢唐時期的西域樂，并最終定型于葉爾羌汗國時期。學界普遍認同，第二代蘇丹拉失德汗，王后阿曼尼莎汗及宮廷首席樂師柯迪爾汗對規整木卡姆貢獻巨大，其中，拉失德汗提供了有力的支持，阿曼尼莎和柯迪爾汗等人則全力搜集、整理散佚民間的木卡姆，并最終得到16套木卡姆，至今只流傳有12套，故稱“十二木卡姆”。
十二木卡姆即十二套樂章，每一樂章由若干小曲組成，每一小曲皆有歌詞，并以愛情為主要題材，表現了人民群眾對黑暗統治的痛恨和對光明幸福的追求。木卡姆的傳承多是師徒形式的口耳相傳，主唱者彈奏沙塔爾，輔唱者以手鼓相配合，是婚禮、節日慶典上的助興節目。
君主年表
葉爾羌汗國國祚凡166年，歷12代汗。
相關作品
參考資料 >
中國歷史常用術語中英對照-明清.創譯.2024-04-02
新疆喀什噶爾古城景區管委會揭牌-中新網.中國新聞網.2024-04-02
美人之死.豆瓣電影.2024-04-02
阿曼尼薩罕.豆瓣電影.2024-04-02