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《惟物論的系統醫學》一書分“生命宇宙篇”、“中醫原理篇”、“經方用法篇”、“溫病篇”、“傷寒論原文讀法篇”、“傷寒論方解篇”、“雜癥治法篇”、“時方用法篇”八個部分。生命宇宙篇 本《周易風水》之河圖，用現代十二科學說明中醫，本身關系運動真相、宇宙與人類生命的關系，進而取得中醫學根本上極大功效的學術。中醫原理篇 本《黃帝內經》于實用，可以信從取法的陰陽五行六氣四時寒暑二十四節令之大氣變化，與生理病理醫理之實際著落，認識標準之精義，其精華，以整個系統，約而歸納，用惟物理論闡發之。經方用法篇 即治療處方之標準方法。古方雖多，歸納為六個公式，以符臟腑五行六氣運動之原理。次以六方分辨陰陽對待之治法。再后十方由前六方之單、進而為醫學整理《傷寒論》的基礎說法，各方之后，又有推論的范圍極廣，更引申結合病情變化加減的方法。溫病篇 逐一列舉相類之各癥，分辨了傷寒與溫病之綱領，解釋經文及其禁忌，并分述了溫病、濕熱、暑病、霍亂、水瀉、痢疾、瘧疾、白喉、熱傷風、秋燥、時行感冒、小兒病十二門。由于彭子益先生崇尚清代名醫王孟英溫病思想，曾對《王孟英醫案》進行注疏，本書未見醫案注疏部分，實乃憾事矣。傷寒論原文讀法篇 分為上中下三編：凡原文之屬于營衛臟腑與少陽病經本體各病各氣，列為上編；原文屬于本體復雜的事實，列為中編；原文之由本體發生種種變化各氣，列為下編。此外傳經另立一篇，疑難各章另立一篇，類證另立一篇……
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