蛻皮動物（Ecdysozoa）是一大類原口動物，包括節肢動物門、線蟲動物門和幾個小門，最初由Auinaldo等人于1997年定義，主要根據是18S核糖體核糖核酸樹。而這個分類同時也被一系列形態學證據所支持，因為這個分類包括所有蛻掉外骨骼的動物（見蛻皮(ecdysis)）。與蛻皮動物接近的定義也曾經被Perrier在1897年和Seurat在1920年僅依據形態作出。
形態特征
蛻皮動物最顯著的共同特征是一個三層的表皮（英文cuticle），由有機化合物組成，能夠隨著動物生長周期性蛻掉。蛻皮動物由此得名。蛻皮動物缺乏運動纖毛，產生變形蟲樣精子，其胚胎不像其他原口動物一樣螺旋卵裂。蛻皮動物的一些分支還有其它一些共同特征，比如緩步動物門和線蟲動物都有一個三輻射對稱的咽(pharynx)。
內部分類
蛻皮動物包括如下門：節肢動物門、有爪動物門、緩步動物門、動吻動物門、鰓曳動物門、鎧甲動物門、線蟲動物門和線形蟲動物門；其它一些門類，比如腹毛動物門，曾被認為可能是其中的一員，但因其缺乏蛻皮動物的主要特征，現在通常被劃出。泛節肢動物的共同特征是具有分節的身體，原來以為由環節動物門演變而來，而與其一起組成分節動物(Articulata)。然而它們并不具有太多的共同特征，現在看來他們分別演化出了分節的特點。此外，從18S 核糖體核糖核酸樹來看，后口動物中的毛顎動物門可能與其余后口動物不同而屬于蛻皮動物。蛻皮動物中不屬泛節肢動物的成員曾經被組成 環神經動物(Cycloneuralia)，但通常被認為是并系群。
蛻皮動物為總門，包含9門：
葉足動物門(Lobopodia)：奇蝦 歐巴賓海蝎 微巨蜘蛛 埃謝櫛蠶 怪誕蟲等等。
緩步動物門(Tardigrada)：水熊蟲，緩步蟲等。
動吻動物門(Kinorhyncha)
鰓曳動物門(Priapulida)
鎧甲動物門(Loricifera)
線形蟲動物門(線形蟲動物門)：鈞蟲、絲蟲病、輪蟲、棘頭蟲等等。
簡介
蛻皮動物是指所有會產生蛻皮現象動物的總稱，其中還包括線蟲、節肢動物門和蠕蟲( Aguinaldo et al.1997)，兩個被研究得最為透徹的的分子生物學模式生物線蟲和果蠅都屬于蛻皮動物，在強大的遺傳學研究技術支持下，這兩種模式生物為生物學研究做出了巨大貢獻，其中涵蓋了從細胞基本原理到系統學分析等一系列主題，而且，這些研究對我們理解生物學的重要性毋庸置疑。雖然上面羅列了這些研究的意義，但越來越多的證據正在挑戰以下這些不言而喻的假說：這些研究結果能適用于大部分的無脊椎動物，或可以通過這些研究結果來推斷較簡單的祖先動物的代謝過程。相反，這些數據表明，現存的模式蛻皮動物的一些簡單特征是祖先復雜結構發生二次簡化的結果。
盡管一些蛻皮動物類群很少保留祖先的復雜性，但它們仍進化出迷人的復雜特征。例如，果蠅唐氏綜合征細胞粘附分子(Dscam)基因的內含子含量很高，在所有已鑒定的生物中剪接變異體數目最多(Schmucker et al.2000)。黑腹果蠅的Dscam能將特定的物質傳給遷移神經元，并協調同種抗原排斥，這是建立神經回路的重要前提。Dscam基因的轉錄產物在一些群體（包括甲殼亞門水蚤）中表現出較高的多樣性，表明Dscam基因可變剪接導致細胞多樣性的形成，這可能是節肢動物門擁有的一個基本功能(Brites et al.2008)。與此相反，脊椎動物中Dscam同源基因似乎并沒有出現廣泛的可變剪接，雖然它們似乎也存在有同種抗原相互作用現象（見綜述Hattori et al.2008）。
這個例子說明，在衡量動物的復雜性時，即使是基于定量分子分析，仍需要區分它們是保留了祖先的復雜特征還是二次得到的復雜特征。還不清楚這兩種變化方式的相互關系，因此判定某個物種或類群的復雜性時需要估計它們的進化起源時間。同樣值得注意的是，昆蟲和線蟲都具有非常高的多樣性，而且昆蟲是動物中物種最豐富的類群(Brusca and Brusca 2003)，盡管昆蟲丟失了一些復雜的特征，它們卻進化出了非常高的形態復雜性和多樣性。但是，在海洋環境中昆蟲的多樣性并不算很高，其他蛻皮動物類群（包括甲殼亞門和自由生活的線蟲）在海洋中豐度更高，然而適用于它們的悔洋模型和分子學數據仍然非常稀缺。
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