李梢，1973年10月出生于醫(yī)學(xué)世家，清華大學(xué)教授、博士生導(dǎo)師、清華信息國家實驗室中醫(yī)藥交叉研究中心主任、生物信息學(xué)部副主任。在Molecular Systems Biology, Cancer Research等刊物發(fā)表論文100余篇，代表論文兩次被《自然中國》（Nature China）作為亮點報道，被國際千名醫(yī)學(xué)家（F1000）推薦為“必讀論文” ，被美國《華爾街日報》長篇報道，評為“2014世界中醫(yī)藥十大新聞” ，入選英國皇家化學(xué)會“Top 1%高被引中國作者”。由于在中醫(yī)藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)上的開拓性工作和成果，獲2012年國家杰出青年科學(xué)基金。兼任世界中醫(yī)藥學(xué)會聯(lián)合會網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)專業(yè)委員會會長、中國藥理學(xué)會網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)專業(yè)委員會副主任委員、中國研究型醫(yī)院學(xué)會生物標(biāo)志物專業(yè)委員會副主任委員。
人物經(jīng)歷
教育背景
北京中醫(yī)藥大學(xué)醫(yī)學(xué)博士（1998.9－2001.7）
皖南醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)碩士（繼承家族醫(yī)學(xué)-國家非物質(zhì)文化遺產(chǎn)）（1995.9－1998.7）
北京中醫(yī)藥大學(xué)醫(yī)學(xué)學(xué)士（1990.9－1995.7）
工作經(jīng)歷
清華大學(xué) 教授（2009.12至今）
清華大學(xué) 博士生導(dǎo)師（2008.9至今）
清華信息科學(xué)與技術(shù)國家實驗室（籌）中醫(yī)藥交叉研究中心主任（2017.9至今）
清華信息科技國家實驗室（籌）生物信息學(xué)研究部 副主任（2006.2至今）
清華大學(xué)自動化系、生物信息學(xué)教育部重點實驗室副研究員（2004.12－2009.11）
清華大學(xué)自動化系、生物信息學(xué)教育部重點實驗室講師（2003.8－2004.12）
清華大學(xué)自動化系、生物信息學(xué)教育部重點實驗室博士后（2001.9－2003.8）
科研方向
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)、生物信息學(xué)與中醫(yī)藥現(xiàn)代化
疾病分子網(wǎng)絡(luò)研究：分析表型與復(fù)雜生物網(wǎng)絡(luò)的整體關(guān)聯(lián)機(jī)制，研究炎癥與腫瘤、中醫(yī)寒熱證等病證的分子網(wǎng)絡(luò)和生物標(biāo)志
中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究：以疾病生物分子網(wǎng)絡(luò)為靶標(biāo)，研究中藥藥效物質(zhì)基礎(chǔ)和中藥方劑作用機(jī)理
主要成就
獲獎記錄
大挑戰(zhàn)2015·青年科學(xué)家（蓋茨基金會，科技部）
國家杰出青年科學(xué)基金（2012）
國家教學(xué)成果二等獎（2009）
國家科技進(jìn)步二等獎（2004）
茅以升北京青年科技獎（2009）
教育部新世紀(jì)優(yōu)秀人才支持計劃（2007）
全國優(yōu)秀博士學(xué)位論文（2003）
清華大學(xué)校先進(jìn)工作者（2008）
科研項目
1. 國家自然科學(xué)基金重點項目（2010-2013，負(fù)責(zé)人）：疾病生物分子網(wǎng)絡(luò)的系統(tǒng)建模與調(diào)控機(jī)理研究
2. 國家自然科學(xué)基金面上項目（2009-2011，負(fù)責(zé)人）：基于血管新生生物網(wǎng)絡(luò)的方劑多靶點協(xié)同作用研究
3. 國家自然科學(xué)基金重大研究計劃面上項目（2007-2009，負(fù)責(zé)人）：寒熱辨證的多層次信息挖掘及相關(guān)生物分子網(wǎng)絡(luò)
4. 國家高技術(shù)研究發(fā)展計劃探索導(dǎo)向項目（2006-2008，負(fù)責(zé)人）：疾病相關(guān)生物網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建分析的關(guān)鍵方法與技術(shù)
5. 國家科技支撐計劃課題（2006-2009，負(fù)責(zé)人）：中醫(yī)證候計算系統(tǒng)生物學(xué)方法的示范研究
6. 教育部科學(xué)技術(shù)研究重點項目（2004-2006，負(fù)責(zé)人）：細(xì)胞因子網(wǎng)絡(luò)仿真與中藥免疫調(diào)節(jié)模式研究
7. 全國優(yōu)秀博士論文作者專項資金（2004-2009，負(fù)責(zé)人）：中藥分子組合調(diào)節(jié)血管增生的理化與生物信息學(xué)研究
8. 國家自然科學(xué)基金青年項目（2003-2005，負(fù)責(zé)人）：基于神經(jīng)內(nèi)分泌免疫網(wǎng)絡(luò)仿真的寒熱證候整體規(guī)律研究
學(xué)術(shù)成績
2012年，清華大學(xué)李梢教授由于在中醫(yī)藥生物信息學(xué)、中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)上的開拓性工作和成果，成為2012年度中醫(yī)藥學(xué)科唯一的國家杰出青年基金獲得者，也是“中醫(yī)藥學(xué)研究新技術(shù)和新方法”領(lǐng)域首位國家杰青。
2013年，李梢課題組在中醫(yī)證候生物學(xué)研究上獲新進(jìn)展，連續(xù)發(fā)表了中醫(yī)證候生物標(biāo)志和舌苔微生物組的研究成果。
2014年，李梢課題組的六味地黃方網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究論文登上國際刊物封面。
2014年11月，美國《華爾街日報》以“古老療法的新資料”為題，用兩個版面刊發(fā)了一則頭條報道，其中重點介紹了李梢課題組的研究成果，該新聞入選“2014世界中醫(yī)藥十大新聞”。
2015年，李梢提出了中藥新作用機(jī)制模型——基于網(wǎng)絡(luò)靶標(biāo)的效應(yīng)開、關(guān)模型，為優(yōu)化中藥組方、促進(jìn)藥物研制提供了新思路。
2016年，李梢由于在中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)上的研究成果，入選英國皇家化學(xué)會“Top1%高被引中國作者”榜單。
2017年，李梢課題組在Cancer Research建立了消化道炎癌轉(zhuǎn)化的分子細(xì)胞系統(tǒng)多尺度計算模型，為揭示炎癌轉(zhuǎn)化規(guī)律、發(fā)展防控措施提供新途徑。11月，李梢課題組在胃炎寒熱證分子網(wǎng)絡(luò)、六味地黃網(wǎng)絡(luò)調(diào)節(jié)作用、中藥網(wǎng)絡(luò)靶標(biāo)模型方面的三項成果，得到美國NIH/NCI腫瘤補(bǔ)充與替代醫(yī)療研究戰(zhàn)略白皮書的引證和好評。
2018年4月，李梢課題組成果“打造大數(shù)據(jù)和人工智能時代的中醫(yī)藥“核芯”技術(shù)”亮相首屆數(shù)字中國建設(shè)峰會。
主要學(xué)術(shù)論文（*：通訊作者）
2017
1.Guo Y, Nie Q, MacLean A, Li Y, Lei J*, Li S*. Multiscale modeling of inflammation-induced tumorigenesis reveals competing oncogenic and onco-protective roles for inflammation. Cancer Research 2017;77(22):6429-6441
2.D Xi*, T Bao, Qi Chen, S Chen, Y Cheng, J Cullen, D Frank, J Friedberg, I Kronish, J Lee, M Levine, P Li, S Li, W Lu, J Mao, S Keefe, L Rubinstein, M Shah, L Standish, C Paller, E Chu. State of the Science: Cancer Complementary and Alternative Medicine Therapeutics Research—NCI Strategic Workshop Highlights of Discussion Report. JNCI Monographs 2017;52:lgx003
3.Zhang B, Wang X, Li Y, Wu M, Wang S, Li S*. Matrine is identified as a novel macropinocytosis inducer by a network target approach. Frontiers in Pharmacology (Accepted)
4.Lin X, Hu L, Gu J, Wang R, Li L, Tang J, Zhang B, Yan X, Zhu Y, Hu C, Zhou W, Li S, Liu J, Gonzalez F, Wu M, Wang H*, Chen L*. Choline Kinase Alpha mediates interactions between the Epidermal Growth Factor Receptor and mTORC2 in hepatocellular carcinoma cells to promote drug resistance and xenograft tumor progression. Gastroenterology 2017;152:1187–1202
5.Huang Q, Xu L, Qu W, Ye Z, Huang W, Lin J, Li S*, Ma H*. TLC Bioautography-guided Isolation of 抗氧化劑 Activity Components of Extracts from Sophora flavescens Ait. European Food Research and Technology 2017;243:1127-1136
2016
1.Li S*. Exploring traditional Chinese medicine by a novel therapeutic concept of network target. Chinese Journal of Integrative Medicine 2016;22(9):647-652 (Feature Article)
2.Qi Q, Li R, Li H, Cao Y, Bai M, Fan X, Wang S, Zhang B*, Li S*. Identification of the anti-tumor activity and mechanisms of nuciferine through a network 藥理學(xué) approach. Acta Pharmacologica Sinica 2016;37:963-972
3.Zhang Y, Mao X, Guo Q, Bai M, Zhang B, Liu C, Sun Y, Li S*, Lin N*. 神經(jīng)通路 of PPAR-gamma coactivators in thermogenesis: a pivotal traditional Chinese medicine-associated target for individualized treatment of rheumatoid 關(guān)節(jié)炎 Oncotarget 2016;7(13):15885-15900
4.Zhang Y, Mao X, Guo Q, Lin N, Li S*. Network 藥理學(xué)based approaches capture the essence of 漢語詞類 herbal medicines. Chinese Herbal Medicines 2016;8:107-116
2015
1.Li S*. Mapping ancient remedies: applying a network approach to traditional Chinese medicine. Science 2015;350(6262 Suppl):S72-S74 （傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)增刊）
2.Wu M, Lu P, Shi L*, Li S*. Traditional Chinese patent medicines for cancer treatment in China: a nationwide medical insurance data analysis. Oncotarget 2015;6(35):38283-38295
3.Zu S, Chen T, Li S*. Global optimization-based inference of chemogenomic features from drug-target interactions. 生物信息學(xué) 2015;31(15):2523-2529
4.Zhang B, Lu C, Bai M, He X, Tan Y, Bian Y, Xiao C, Zhang G, Lu A*, Li S*. Tetramethylpyrazine identified by a network 藥理學(xué) approach ameliorates methotrexate-induced oxidative organ injury. Journal of Ethnopharmacology 2015;175:638-647
5.Zhang Y, Bai M, Zhang B, Liu C, Guo Q, Sun Y, Wang D, Wang C, Jiang Y, Lin N*, Li S*. Uncovering pharmacological mechanisms of 吳語tou decoction acting on rheumatoid 關(guān)節(jié)炎 through systems approaches: drug-target prediction, network analysis and experimental validation. Scientific Reports 2015; 5: 9463
6.Li Y, Li R, Ouyang Z, Li S*. 草本 network analysis for a famous TCM doctor’s 方劑 on treatment of rheumatoid arthritis. Evidence-Based Complementary and Alternative Medicine 2015: 451319
7.Su B, Luo T, Zhu J, Fu J, Zhao X, Chen L, Zhang H, Ren Y, Yu L, Yang X, Wu M, Feng G, Li S, Chen Y*, Wang H*. Interleukin-1β/IRAK-1 inflammatory signaling contributes to persistent Gankyrin activation during hepatocarcinogenesis. Hepatology 2015;61(2):585–597
2014
1.Liang X, Li H, Li S*. A novel network 藥理學(xué) approach to analyse traditional herbal formulae: the Liu-wei-di-huang Pill as a case study. Molecular BioSystems 2014,10(5):1014-1022 (封面論文)
2.Wang L, Wang Y, Hu Q, Li S*. Systematic analysis of new drug indications by drug-gene-disease coherent subnetworks. CPT: Pharmacometrics and Systems 藥理學(xué) 2014;3:e146, 9 pages
3.Liang X, Li H, Tian G, Li S*. Dynamic microbe and molecule networks in a mouse model of 結(jié)腸炎associated colorectal cancer. Scientific Reports 2014;4,4985
4.Li S*, Fan T, Jia W, Lu A, Zhang W. Network 藥理學(xué) in traditional 漢語詞類 medicine. Evidence-based Complementary and Alternative Medicine 2014:138460 (Editorial)
5.Li H, Zhao L, Zhang B, Jiang Y, Wang X, Guo Y, Liu H, Li S*, Tong X*. A network 藥理學(xué) approach to determine active compounds and action mechanisms of Ge-Gen-Qin-Lian decoction for treatment of Type 2 糖尿病 質(zhì)證based Complementary and Alternative Medicine 2014:495840
2013
1.Li R, Ma T, Gu J, Liang X, Li S*. Imbalanced network biomarkers for traditional Chinese medicine 綜合征 ingastritis patients. Scientific Reports 2013;3:1543
2.Li S*, Zhang B. Traditional Chinese medicine network 藥理學(xué): theory, 方法學(xué) and application [中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)：理論、方法與應(yīng)用]. Chinese Journal of Natural Medicines 2013;11(2):110-120
3.Zhang B, Wang X, Li S*. An integrative 臺地 of TCM network pharmacology and its application on an herbal 公式, Qing-Luo-Yin. 質(zhì)證based Complementary and Alternative Medicine 2013:456747
4.Zhang B, Liu L, Zhao S, Wang X, Liu L, Li S*. Vitexicarpin acts as a novel angiogenesis inhibitor and its target network. Evidence-based Complementary and Alternative Medicine 2013:278405
5.Wang T, Gu J, Yuan J, Tao R, Li Y, Li S*. Inferring 神經(jīng)通路 crosstalk networks using gene set co-expression signatures. Molecular BioSystems 2013;9(7):1822-1828
2012
1.Jiang B, Liang X, Chen Y, Ma T,Liu L, Li J, Jiang R, Chen T, Zhang X*, Li S*. Integrating next-generation sequencing and traditional tongue diagnosis to determine tongue 涂層 microbiome. Scientific Reports 2012;2:936
2.Zhao S, Li S*. A co-module approachfor elucidating drug-disease associations and revealing their molecular basis. 生物信息學(xué) 2012;28(7):955-961
3.Chen Y, Gu J, Li D, Li S*. 時間course network analysis reveals TNF-alpha can promote G1/S transition of cell cycle in vascular endothelialcells. Bioinformatics 2012;28(1):1-4
4.Gu J*, Li S*. Towards integrative annotating the 細(xì)胞type specific gene functional and signaling map in vascular endothelial cells. Molecular BioSystems 2012;8:2041-2049
5.Kanawong R, Ajayi T, Ma T, XuD, Li S*, Duan Y*. Automated tongue feature extraction for ZHENG classificationin traditional Chinese medicine. Evidence-based Complementary and Alternative Medicine 2012;912852:1-14
2011
1.Li S*, Zhang B, Zhang NB. Network target for screening synergistic drug combinations with application to traditional Chinese medicine. BMC Systems Biology 2011;5(S1):S10 (F1000推薦論文)
2.Yao X, Hao H, Li Y, LiS*. Modularity-based credible prediction of disease genes and detection of disease subtypes on the phenotype-gene heterogeneous network. BMC SystemsBiology 2011;5:79
3.Lu L, Li Y, Li S*. Computational identification of potential microRNA network biomarkers for the progression stages of gastric cancer. International Journal of 數(shù)據(jù) Mining and 生物信息學(xué) 2011;5:519-31
4.李梢. 網(wǎng)絡(luò)靶標(biāo)：中藥方劑網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究的一個切入點。中國中藥雜志 2011;36:2017-2020
2009-2010
1.Zhao S, Li S*. Network-based relating pharmacological and genomic spaces for drug target identification. PLoSONE 2010;5(7):e11764 (Nature China 亮點論文)
2.Li S*, Zhang B, Jiang D, Wei YY, Zhang NB. 草本 network construction and co-module analysis for uncovering the combination rule of traditional Chinese herbal formulae. BMC 生物信息學(xué) 2010;11(S11):S6
3.Yan H, Zhang B, Li S*, Zhao Q*. A formal model for analyzing drug 組合 effects and its application in TNF-alpha-induced NFkappaB 神經(jīng)通路 BMC Systems Biology 2010;4:50
4.Ma T, Tan C, Zhang H, Wang M,Ding W, Li S*. Bridging the gap between traditional Chinese medicine and systems biology: the connection of Cold Syndrome and NEI network. Molecular BioSystems 2010;6:613-619
5.Gu J, Chen Y, Li S*, Li Y*. Identification of responsive gene modules by network-based gene clustering and extending: application to inflammation and angiogenesis. BMC Systems Biology 2010;4:47
6.Huang Y, Li S*. Detection of characteristic sub pathway network for angiogenesis based on the comprehensive pathway network. BMC 生物信息學(xué) 2010;11(S1):S32
7.Yao BP, Li S*. ANMM4CBR: acase-based reasoning method for gene expression 數(shù)據(jù) 分級 Algorithms for Molecular Biology 2010;5:14
8.Li S, Lu A*, Wang Y. Symptomatic comparisonin efficacy on patients with benign prostatic hyperplasia treated with two therapeutic approaches. Complementary Therapies in Medicine 2010;18:21-27
9.Li S. Network systems underlying traditional Chinese medicine 綜合征 and herb formula (Invited review). Current 生物信息學(xué) 2009;4(3):188-196
10.李梢. 中醫(yī)證候生物分子網(wǎng)絡(luò)標(biāo)志的構(gòu)想與研究. 中醫(yī)雜志 2009;50(9):773-776
2008
1.Wu X, Jiang R, Zhang MQ, Li S*. Network-based global inference of human disease genes. Molecular Systems Biology 2008;4:189 (Nature China 亮點論文)
2.Zhang J, Ma T, Li YD, Li S*. dbNEI2.0: building multilayer network for drug-NEI-disease. 生物信息學(xué) 2008;24:2409-2411
3.Kang G, Li S*, Zhang JF. Entropy-based model for interpreting life systems in traditional 漢語詞類 medicine. Evidence-based Complementary and Alternative Medicine 2008;5(3):273-279
4.Wu M, Ma C, Wu Y, Li S*. Simultaneous LC analysis of five bioactive alkaloids in an anti-angiogenesis herbal formula, Qing-Luo-Yin. Chromatographia 2008;68:579-585
2007
1.Li S*, Zhang Z, Wu L, Zhang X, Li Y, Wang Y. Understanding ZHENG in traditional Chinese medicine in the context of neuro-endocrine-immunenetwork. IET Systems Biology 2007;1(1):51-60
2.Li S*, Fang YH. Modelling circadian rhythms of protein KaiA, KaiB and KaiC interactions in 藍(lán)菌門 Biological Rhythm Research 2007;38(1):43-53
3.李梢. 基于生物網(wǎng)絡(luò)調(diào)控的方劑研究模式與實踐. 中西醫(yī)結(jié)合學(xué)報 2007;5(5):1-5
4.李梢. 中醫(yī)藥計算系統(tǒng)生物學(xué)與寒熱證候研究. 世界科學(xué)技術(shù)-中醫(yī)藥現(xiàn)代化 2007;9(1):105-111
2006
1.Li S*, Wu LJ, Zhang ZQ. Constructingbiological networks through combined literature mining and microarray analysis: a LMMA approach. 生物信息學(xué) 2006;22:2143-2150
2.Li S*, Wang R, Zhang Y, Zhang X, Layon AJ, Li Y, Chen M. Symptom combinations associated with outcome and therapeutic effects in a cohort of cases with 嚴(yán)重急性呼吸綜合征 American Journal of Chinese Medicine 2006;34(6):937-947
3.壯族 YL, Li S*, Li YD. dbNEI: a specific database for neuro-endocrine-immune interactions. Neuroendocrinology Letters 2006;27:53-59
2005以前
1.Li S*, Lu A, Li B, Wang Y. Circadian rhythms on hypothalamic-pituitary-adrenal axis hormones and cytokines ofcollagen induced 關(guān)節(jié)炎 in 鼠科 Journal of Autoimmunity 2004;22(4):277-285
2.Li S*, Lu A, Wang Y, Li Y. Suppressive effects of a Chinese herbal medicine Qing-Luo-Yin extract on the angiogenesis of 膠原蛋白 induced 關(guān)節(jié)炎 in 家鼠屬 American Journal of Chinese Medicine 2003;31(5):713-720
3.李梢. 從維度與階度探討中醫(yī)證候的特征及標(biāo)準(zhǔn)化方法. 北京中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報 2003;26(3):1-4
4.李梢，王永炎，季梁，李衍達(dá) 復(fù)雜系統(tǒng)意義下的中醫(yī)藥學(xué)及其案例研究. 系統(tǒng)仿真學(xué)報2002;14(11):1429-1432
發(fā)明專利：
1. Li S, Zhang NB, Zhang B. Method of Network-Based Identification of Multicomponent Synergy and Compositions for Use as Effective Component of Anti-Angiogenesis Medicines. 授權(quán)美國發(fā)明專利. 專利號：US Patent: 12/436,844
2. 李梢，趙世文. 基于蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)的藥物靶標(biāo)確定和/或藥物功能確定方法。申請中國發(fā)明專利、PCT專利。申請?zhí)枺?01010218468.X
3. 李梢，張寧波，張博. 基于基因網(wǎng)絡(luò)的藥物組合協(xié)同作用確定方法。授權(quán)中國發(fā)明專利. ZL200810239284.4
4. 李梢，吳敏。一種具有抗血管新生協(xié)同作用的中藥有效成分組合。授權(quán)中國發(fā)明專利. 專利號：ZL200610114226.X
社會職務(wù)
參考資料：
所獲榮譽
2020年12月，榮獲“2020年度中國全面小康十大杰出貢獻(xiàn)人物”。
人物評價
李梢在建立中醫(yī)藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)理論與關(guān)鍵技術(shù)，促進(jìn)胃癌極早期防治、中藥精準(zhǔn)研發(fā)等方面作出了系統(tǒng)的創(chuàng)造性貢獻(xiàn)。——清華大學(xué)自動化系
李梢在網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)與傳統(tǒng)醫(yī)藥研究上做出了開創(chuàng)性貢獻(xiàn)。——歐洲科學(xué)與藝術(shù)學(xué)院
參考資料 >
國家杰出青年科學(xué)基金名錄.國家自然科學(xué)基金委.2013-04-28
證候生物學(xué)研究又獲新進(jìn)展.生物行.2013-04-28
清華大學(xué)李梢課題組采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法研究中醫(yī)藥取得新進(jìn)展.國家自然科學(xué)基金委員會.2018-02-06
李梢教授在美國《科學(xué)》雜志增刊提出中藥新作用機(jī)制模型.中國中醫(yī)藥網(wǎng).2015-12-15
李梢教授入選英國高被引中國作者榜.中國中醫(yī)藥網(wǎng).2016-05-21
美國國家癌癥研究所雜志發(fā)布腫瘤補(bǔ)充與替代醫(yī)學(xué)研究報告，我國專家研究中藥方法獲認(rèn)可.中國中醫(yī)藥報.2018-02-05
李梢教授個人主頁.清華大學(xué).2012-07-12
李梢.清華大學(xué)自動化系.2024-08-12
“2020年度中國全面小康十大杰出貢獻(xiàn)人物”揭曉.中國小康網(wǎng).
自動化系李梢教授當(dāng)選英國皇家生物學(xué)會會士.清華大學(xué)新聞網(wǎng).2024-08-12
清華大學(xué)自動化系教授李梢當(dāng)選為歐洲科學(xué)與藝術(shù)學(xué)院院士.清華大學(xué).2024-08-12