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中國數字植物標本館
來源:互聯網

中國數字植物標本館(英語:Chinese Virtual Herbarium,簡稱CVH)是一個中國植物標本及相關植物學信息的網站,由中華人民共和國科學技術部“國家科技基礎條件平臺”項目資助,中國科學院植物研究所主持,參與建設單位(共建單位/成員單位)達20余家。

簡介

中國數字植物標本館是由中國科學院生物標本館,植物研究所,昆明植物所,中國科學院華南植物園,版納中國科學院西雙版納熱帶植物園,沈陽應用生態所,中國科學院武漢植物園,西北高原生物所,成都生物所,新疆生地所,西北農林科技大學,廣西植物所,江蘇省植物所,廬山植物園四川大學,中山大學,南京大學,南開大學,武漢大學,內蒙古大學,廣西中醫藥大學研究所等共同創建。

“中國數字植物標本館是在科技部“國家科技基礎條件平臺”項目資助下建立的,其宗旨是為用戶提供一個方便快捷獲取中國植物標本及相關植物學信息的電子網絡平臺;中國科學院及其他部委(局)也為網站建設提供相關支持。

標本量

中國科學院植物研究所所長馬克平介紹,數字植物標本館分為4部分:數字化標本庫、植物數據庫、電子植物志、植物圖片庫。數字化標本庫目前收錄有200多萬號一般標本和3000號模式標本。植物數據庫提供中國植物名錄、植物文獻數據庫、中國干燥標本集等多項查詢。電子植物志包括中國植物志、西藏植物志、青海植物志、秦嶺植物志、四川植物志、海南植物志等。網站還上載了240科、1469屬、3784種,共計27300張植物彩色照片。標本館還設有主要國際干燥標本集以及相關數據的搜索引擎。

辦館目的

中國數字植物標本館建設的目的包括:1. 提供中國植物標本及相關植物學的全面和最新的信息,供專家及一般用戶上網查詢;2. 為國內同行間交流與合作提供平臺,并實現與國際接軌;3.提供政府及民間對植物多樣性保護和可持續利用的參考資料;4.促進參與標本館 的現代化管理建設進程。最終目標是把CVH建設成為中國植物標本信息及植物學科的國家型門戶網站。

“中國數字植物標本館”網站自二零零六年初開通以來,訪問量(點擊率)累計超過二百萬次,近期平均點擊率達到每天4.4萬次、6000人。CVH已經成為國內外同行認知度越來越高的專業網站。

目前CVH網站包含數據庫20余個,數據量達3.3TB。參與建設單位(共建單位/成員單位)達20余家,包括中國科學院和地方科學院及一些大學標本館,基本上包含了我國主要和重要的標本館。

建設發展

中國的生物多樣性豐富,據《中國植物志》記載,中國擁有3萬多個物種,52%為中國特有。中國科學院聯合國內其他研究機構建立了中國數字植物標本館。數字植物標本館自2004年開始建設,以20世紀的主要標本數據為基礎,2006年9月在網絡上推出第二版,第三版正在進一步開發中。

中國數字植物標本館還通過和英、美等國家相關機構的合作,完善標本館的數據建設和更新。馬克平說,中國數字植物標本館是國內自主開發、建設起來的,但在模式標本、植物學文獻庫以及世界植物志方面需要和國外進行合作。這些合作一方面實現世界植物研究方面的資源共享,另一方面使中國數字植物標本館一開始就能夠和國際研究接軌。

今年,中國數字植物標本館計劃收集100多萬號一般標本和8000多號模式標本。標本館的最終目標是將中國已有的1600多萬號標本全部數字化。

數據庫

1.標本信息

提供成員單位標本館所完成的數字化標本信息,包括一般標本及模式標本。每份標本信息包括標簽信息及圖像信息,前者包括標本采集人、采集日期、地點、生境與海拔以及鑒定信息和標本存放地點(標本館)等。

目前在CVH網上能查詢到中科院系統13家標本館標本,共計二百八十五萬份(筆)標本信息及一百五十五萬張標本圖像,缺乏圖像的記錄已在首頁予以標明。

網上模式標本6500份,僅包括中科院植物所標本館館藏的模式標本,包括裸子植物、毛科、蕁麻科山茶屬殼斗科等類群。信息均經過核實,還附有發表新種的原始文獻(PDF格式)以及高分辨率標本圖像。

分布式標本信息檢索系統:目前CVH的標本信息是通過集中式實現共享查詢的,其主要缺陷是更新周期長,存儲壓力大。我們正在試驗的分布式標本信息查詢系統已有5家標本館(稱CVH分館)參與,共有100多萬份標本信息實現實時更新,并由成員單位通過FTP自主管理其分館,有效地發揮成員單位的積極性。

2.《中國植物志》數據庫

包括全套《中國植物志》79卷(除第一卷外)125冊圖書的PDF文件,可通過科名和植物名稱(學名、中名)查詢到志書文字及圖版。最近完成的檢索文件復核補充工作使數據庫更全面準確地反映植物志的內容,除正名(accepted name)外,討論部分的學名也可查到。數據庫記錄數:45000余條。

3.彩色圖庫

上傳到CVH網站上的植物彩色照片共計五萬余張,屬于269科5700種,為近年來眾多志愿者自野外拍攝所得,范圍涉及在全國34個省(區、市)的野生植物。下階段將逐步建立彩圖鑒定專家系統,以提高照片鑒定準確性。

至此,用戶輸入學名或中名可關聯性查詢到標本、植物志及彩色圖片三大數據庫,這也是CVH的主要數據庫。

4.其他相關數據庫

為方便用戶使用標本信息,“中國數字植物標本館”網站還提供其他大量相關的(植物學)數據庫,如標本采集地名與標本館數據、分類研究人員及其研究論文題錄等。這些數據庫或源自實際工作經驗的總結、或直接轉自權威工具書并經過專家審核。

1)《中國植物圖鑒》數據庫

為該書全套五冊正編及兩冊補編共7本書的全文檢索。可通過科名和植物名稱(學名及中名)查詢到書中正文文字及圖畫。數據庫記錄數:9057條。

2)地方植物志及其統一查詢

提供12套地方志的數字化文檔(PDF文件),可通過統一關聯查詢任何1-12種植物志信息,包括西藏自治區秦嶺遼寧省貴州省浙江省海南省等省(區/市)及地區植物志。下階段計劃實現《中國植物志》與地方植物志的關聯查詢。數據庫記錄數:47112條。

3) “三種主要志書屬名數據庫”

提供查詢中國維管植物屬名在《中國植物志》、《中國植物圖鑒》和FLORA OF CHINA中的位子,包括卷冊及頁碼。這三套志書(圖鑒)是目前研究中國植物的主要參考書。該數據庫的復核工作已于最近完成,增加了新近出版 FLORA OF CHINA注冊內容,并修改(修訂)數百條記錄,使數據更準確全面。數據庫記錄數:3504條。

4)植物名稱及分布數據庫

通過該庫可以快速查詢到中國種子植物名稱及分布信息(到省級)等簡單信息。資料主要來源于《中國植物志》和 已出版的Flora of China,可以認為是《中國植物志》的名錄修訂。目前數據庫記錄數:34056條。

5)模式標本名錄及其原始文獻數據庫

該數據庫以收集中國原生植物(Native 植物界)名稱模式標本及其發表原始文獻資料為宗旨,無論其模式標本采集地及保藏地在國內或國外、該名稱何時于何種刊物發表都盡量予以收錄。每條記錄包括植物名稱(學名、中名)、發表刊物,模式標本采集地點和生境、年代及標本采集人和采集號,以及標本存放地點(標本館)。大部分資料以外文形式出現。數據庫資料來源于國內外多種書刊,其中標本館代碼依 Holmgren et al.1990. Index Herbariorum和傅立國等1993《中國植物標本館索引》(中國江蘇科學技術出版社)。縮寫代號HT: Holotype, IT: Isotype, T: Type。目前數據庫記錄數:30705條。

6)植物名稱作者(命名人)數據庫

據統計,至今為止,中國植物命名作者多達五千余人,其中命名兩個及兩個以上名稱的有近3500人。本數據庫就是基于這3500人的資料建立的,每條記錄包括作者全名及標準縮寫、工作/出生/生卒年代、專長類群等。中國作者(共919條目)還附有中文名及工作單位。本數據庫依據國內外多種書刊資料編輯而成,其中人名拼寫標準主要依據Brummitt & Powell 1992, Authors of 植物界 Names。類群代碼為:A:藻類;B:苔蘚植物;C:孢子植物;F:化石植物;M:真菌和地衣;P:蕨類;S:種子植物。目前數據庫記錄數:3481條。

7)中國植物分類學文獻要覽(1949-1990)

一般地,查詢20世紀50年代以前中國植物學文獻時可查詢E.D.Merrill & E.H.Walker 《東亞植物學文獻目錄》(1938)及其補編(1960),90年代以后資料的查詢則多利用各種網絡資源。本數據庫填補了50年代至90年代之間的空白,它主要涵蓋中國大陸學者1949-1990年間發表的植物系統學文獻,內容包括作者姓名、論著題目及發表書刊等。本庫資料主要來源于《中國植物系統學文獻要覽》(陳心啟等1993,廣東科技出版社)。目前數據庫記錄數:6879條。

8)標本采集地新舊地名對照數據庫

在我國,二十世紀初以前標本采集地的名稱,現今常有改變而不再使用。在這種情形下,很有必要通過對舊時和現在地圖的核對及參考相關采集資料,來制作新舊地名對照表,建立新舊地名數據庫,包括舊地名的經緯度數據,以供標本查詢及分類學研究之用。我們根據中國植物分類學家研究經驗,總結出包括11個省(市)2000多條采集地新舊地名對照記錄。每個舊地名盡可能包括其舊外文名、位置(經緯度),并標明該地名在現今縣級行政區的名稱、國家標準代碼和經緯度。目前數據庫記錄數:2048條。

9)中國植物標本館數據庫

本數據庫信息基本于《中國植物標本館索引》(傅立國等,1993)一書,共收錄全國300余家標本館,并于最近對其中幾十家主要標本館信息進行了更新。每家標本館信息包括標本館名稱和地址、聯系人及聯系方法,館藏特色及收藏目標,以及主要研究人員信息等。

5.植物鑒定指南性資料

本部分數據庫包括交互式檢索表(又稱電子檢索表)和植物形態術語圖說等,目的是為用戶提供從植物特征識別和標本鑒定,到上述的標本及圖像比對,一直到物種形態特征描述和國內分布等一站式服務。

1)電子檢索表

這是一種互動的計算機程序,使用者不斷地向這個程序里輸入標本或活植物的性狀,那些不具有這些性狀的分類群將被排除掉,直到只剩下一個分類單元。它是系統植物學、生物編目與保護的一種非常好的鑒定工具。本檢索表提供檢索中國種子植物270余個科的電子路徑。

2)科屬詞典數據庫

該庫轉接自成員單位網站,其信息來自侯寬昭主編、吳德鄰等人修訂的《中國種子植物科屬詞典》(第二版),共收集我國種子植物276科,3109屬,重點描述我國種子植物的科、屬形態、地理分布、屬種統計、主要經濟用途等。該書是我國植物學專業書籍銷量最大的圖書。其電子詞典制作的目的是為了方便用戶對植物多樣性學信息的獲取。

3)“植物鑒定和描述形態術語圖解”數據庫

包括種子植物形態術語1133條,涵蓋了植物鑒定和描述所使用的絕大部分術語,涉及根、莖、葉、花、花序、果實等植物器官。每個條目包括中、英文術語及其中英文釋義四部分內容。選詞標準規范,釋義準確、簡明扼要,大部分術語還配有一至多幅精美的線描圖(共1297幅),圖畫特征明顯,對于讀者理解術語的含義大有裨益。本庫資料主要來源于Harris & Harris 1994, 植物界 Identification Terminology :An Illustrated Glossary (王宇飛等人譯,2001. 科學出版社)一書。

4)“國家重點保護野生植物名錄(第一、二批)”數據庫

第一批名錄已于一九九九年發布執行,第二批名錄經數年討論仍未正式發布,但已基本擬定,故一并列出,供用戶參考。兩個名錄共計約1900種(其中蘭科約占2/3)。該庫可查詢到植物名稱(中名、學名)、科名、批次及保護等級、國內分布(到省級)、海拔高度等信息。

6.科普及孢子植物欄目(分館)

1)苔蘚植物分館和蕨類植物分館

兩者均分列中國植物名錄、植物志、名詞解釋、植物照片、專家介紹及學科通訊等相關資料,利于專門用戶查訪。

2)科普分館

主要是基于植物物種多樣性開發的科學普及常識。其中“標本館常規技術”和“常用藥用植物”兩個欄目是我們特地為“中國數字植物標本館”所編寫的。前者包括“標本采集和壓制”、“標本裝訂”、“用檢索表鑒定植物”和“植物名稱知識介紹”等標本館常用的專業技術;后者則選錄了全國范圍內常藥用植物百余種加于介紹。每種內容包括名稱、來源、原植物形態特征及功能主治等。每種植物還配有一幅精美的彩色圖畫。

此外“中國數字植物標本館”還辟有“網站建設介紹”、“信息反饋”和“相關網站”等欄目,其宗旨是為用戶提供全面而便捷的信息服務。

索引

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參考資料 >

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