汪國華，哈爾濱工業(yè)大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院長聘教授、博士生導(dǎo)師。2013年度當(dāng)選教育部“新世紀(jì)優(yōu)秀人才支持計(jì)劃”。主持多項(xiàng)國家自然科學(xué)基金、國家863項(xiàng)目等。主要研究生物信息學(xué)、機(jī)器學(xué)習(xí)、人工智能等。
個(gè)人資料
汪國華，現(xiàn)任哈爾濱工業(yè)大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院教授、博士生導(dǎo)師，2013年度當(dāng)選教育部“新世紀(jì)優(yōu)秀人才支持計(jì)劃”，主持多項(xiàng)國家自然科學(xué)基金、國家863項(xiàng)目等。2008年以來在國內(nèi)外重要生物信息學(xué)期刊發(fā)表多篇SCI檢索國際期刊論文。
人物經(jīng)歷
2020年9月6日上午，東北林業(yè)大學(xué)信息與計(jì)算機(jī)工程學(xué)院院長汪國華教授應(yīng)吉林大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院邀請(qǐng)，在計(jì)算機(jī)樓A521作了題為“A new k-mer counting algorithm and application in poplar Genome analysis ”的學(xué)術(shù)報(bào)告。
工作經(jīng)歷
2016年12月--，哈爾濱工業(yè)大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院，長聘教授
2014年12月--，哈爾濱工業(yè)大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院，教授
2013年4月--，哈爾濱工業(yè)大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院，博士生導(dǎo)師
2009年9月至2014年12月，哈爾濱工業(yè)大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院，副教授
2004年7月至2009年9月，哈爾濱工業(yè)大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院，講師
1999年7月至2004年7月，哈爾濱工業(yè)大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院，助教
教育經(jīng)歷
2014年3月至2016年4月，美國約翰霍普金斯大學(xué)博士后
2006年11月至2008年11月，美國印地安那大學(xué)-普渡大學(xué)印第安納波利斯分校訪問學(xué)者
2003年9月至2009年9月，哈爾濱工業(yè)大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院，獲工學(xué)博士學(xué)位
2001年9月至2003年7月，哈爾濱工業(yè)大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院，獲工學(xué)碩士學(xué)位
1995年9月至1999年7月，哈爾濱工業(yè)大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院，獲工學(xué)學(xué)士
研究方向
生物信息學(xué)： 脫氧核糖核酸甲基化與轉(zhuǎn)錄因子相互關(guān)系；等位基因上基因表達(dá)調(diào)控模型等。
生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)：大規(guī)模基因組數(shù)據(jù)組裝，比對(duì)分析；單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析；基因組與臨床數(shù)據(jù)相結(jié)合與轉(zhuǎn)化研究。
生物醫(yī)學(xué)人工智能：基于人工智能方法的藥物設(shè)計(jì)，生物醫(yī)學(xué)圖像分析與推理。
科研經(jīng)歷
1. 國家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目“結(jié)合甲基化 DNA 的轉(zhuǎn)錄因子識(shí)別及其調(diào)控功能研究”，2018.1-2021.12
2. 國家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目“基于個(gè)體基因組單核酸突變的等位基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控模型研究”，2014.1-2017.12
3. 哈爾濱工業(yè)大學(xué)基礎(chǔ)研究杰出人才培育計(jì)劃“面向高通量數(shù)據(jù)的生物信息學(xué)方法研究”，2014.7-2016.7
4. 國家863項(xiàng)目“轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生物信息技術(shù)及產(chǎn)品研發(fā)”，2012.1-2015.12
5. 教育部新世紀(jì)人才計(jì)劃“面向個(gè)人基因組的生物信息學(xué)問題研究”，2014.1-2016.12
6. 博士后國際交流計(jì)劃派出項(xiàng)目“基因組中脫氧核糖核酸甲基化對(duì)疾病調(diào)控機(jī)制研究”，2014.4-2016.4
7. 中國博士后科學(xué)基金第五批特別資助“基于單核苷酸突變的等位基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控模型研究”，2012.6-2014.12
8. 第 49 批博士后基金面上項(xiàng)目“基于新一代測序數(shù)據(jù)的選擇性啟動(dòng)子預(yù)測及分析”，2011.3-2013.3
9. 國家自然科學(xué)基金青年項(xiàng)目“基于CHIP-SEQ數(shù)據(jù)的microRNA啟動(dòng)子區(qū)域預(yù)測及轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)分析，2009.1-2012.12
10. 黑龍江省歸國留學(xué)基金項(xiàng)目“基于微陣列數(shù)據(jù)的轉(zhuǎn)錄因子與microRNA調(diào)控功能研究”負(fù)責(zé)人，2009.1-2012.12
11. 國家863項(xiàng)目“基于微陣列數(shù)據(jù)的miRNA調(diào)控機(jī)制分析的關(guān)鍵方法與技術(shù)（項(xiàng)目編號(hào)2007AA02Z302）”副組長
主要任職
1. 哈爾濱工業(yè)大學(xué)計(jì)算機(jī)學(xué)院生物信息技術(shù)教研室副主任
2.國際期刊《ISRN Genomics》期刊編委
3.12th International Conference on 生物信息學(xué) of the Asia-Pacific Bioinformatics Network（InCoB2013）和12th Asia-Pacific Bioinformatics Conference（APBC2014）國際會(huì)議程序委員會(huì)成員
4.美國科學(xué)促進(jìn)會(huì)( The American Association for the Advancement of Science ，美國藝術(shù)與科學(xué)院 )會(huì)員
5.中國計(jì)算機(jī)學(xué)會(huì) (中國計(jì)算機(jī)學(xué)會(huì)夏培肅獎(jiǎng)) 高級(jí)會(huì)員，生物信息學(xué)專委委員，中國人工智能學(xué)會(huì)會(huì)員
6.中國計(jì)算機(jī)學(xué)會(huì)CCF YOCSEF哈爾濱市分論壇學(xué)術(shù)委員
7.《現(xiàn)代生物出版集團(tuán) Genomics》期刊 Associate Editor
8.《Biomedical research international》期刊特約編輯
9. InCoB2013、 APBC2014、 APBC2015、 ISBRA2018 國際會(huì)議程序委員會(huì)成員
10.《BMC Genomics》、《BMC System Biology》、《Current Bioinformatics》和《Computational and Mathematical Methods in Medicine》和《Oncotarget》等生物信息學(xué)期刊審稿人
表彰經(jīng)歷
2013 年，教育部“新世紀(jì)優(yōu)秀人才支持計(jì)劃”
2011 年，中國計(jì)算機(jī)學(xué)會(huì)“2011中國計(jì)算機(jī)學(xué)會(huì)夏培肅獎(jiǎng) 優(yōu)秀博士學(xué)位論文獎(jiǎng)提名”
2011 年，哈爾濱工業(yè)大學(xué)十三屆優(yōu)秀博士學(xué)位論文
2011 年，第十二屆黑龍江省自然科學(xué)技術(shù)學(xué)術(shù)成果獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)
2009 年，文章“Signal transducers and activators of transcription-1 (STAT1) regulates microRNA transcription in interferongamma-stimulated HeLa cells”在國際會(huì)議“Critical Assessment of Massive Data Analysis 2009” (CAMDA 2009)上獲得唯一獎(jiǎng)項(xiàng)“Best Presentation Award”
學(xué)術(shù)論文
SCI檢索索引國際期刊：
1. Zhu H, Wang G, Qian J. Transcription factors as readers and effectors of 脫氧核糖核酸 methylation. Nature Review Genetics. 2016;17(9):551-65 (影響因子： 40.282，中科院一區(qū)，他引： 35)
2. White DT#, Eroglu AU#, Wang G#, Zhang L, Sengupta S, Ding D, Rajpurohit SK, Walker SL, Ji H, Qian J, Mumm JS. ARQiv-HTS, a versatile whole-organism screening Platform enabling in vivo drug discovery at high-throughput rates. Nature Protocol. 2016 Dec;11(12):2432-2453 (并列第一作者，影響因子： 10.032 ，中國科學(xué)院星一區(qū)，他引： 4)
3. Wang G*, Luo X, Wang J, Wan J, Xia S, Zhu H, Qian J, Wang Y. MeDReaders: a database for transcription factors that bind to methylated 脫氧核糖核酸 Nucleic Acids Res. 2018;46(D1):D146-D151 (影響因子： 10.162，中科院一區(qū))
4. Zou Q, Hu Q, Guo M, Wang G*. HAlign: Fast multiple similar DNA/核糖核酸 sequence alignment based on the centre star strategy. 生物信息學(xué) 2015 Aug 1;31(15):2475-81 (影響因子： 7.307，中科院一區(qū)，熱點(diǎn)論文，他引： 39)
5. Bhat-Nakshatri P, Wang G, Collins NR, Thomson MJ, Geistlinger TR, Carroll JS, 褐色 M, Hammond S, Srour EF, Liu Y, Nakshatri H. Estradiol-regulated microRNAs control estradiol response in breast cancer cells. Nucleic Acids Res. 2009; 37(14):4850-4861 (影響因子： 7.836，中科院一區(qū)，他引： 168)
6. Liu Y#, Balaraman Y#, Wang G#, Nephew KP, Zhou FC. 乙醇 exposure alters 脫氧核糖核酸 methylation profiles in mouse embryos at early neurulation. Epigenetics. 2009; 4(7):500-511. (并列第一作者，影響因子： 4.584，中科院二區(qū)，他引： 113)
7. Wang Y#, Wang G#, Yang B, Tao H, Yang JY, Deng Y, Liu Y. Reconstruct gene regulatory network using slice pattern model. BMC Genomics. 2009; 10 Suppl 1:S2. (co-first author) (并列第一作者，影響因子：4.206，中科院二區(qū)，他引：1)
8. Wang G, Wang Y, Feng W, Wang X, Yang JY, Zhao Y, Wang Y, Liu Y. Transcription factor and microRNA regulation in androgen-dependent and -independent prostate cancer cells. 現(xiàn)代生物出版集團(tuán) Genomics. 2008; 9 Suppl 2:S22 (影響因子： 3.759，中科院二區(qū)，他引： 30)
9. Wang G, Wang X, Wang Y, Yang JY, Li L, Nephew KP, Edenberg HJ, Zhou FC, Liu Y. Identification of transcription factor and microRNA binding sites in responsible to fetal 乙醇 Syndrome BMC Genomics. 2008; 9 Suppl 1:S19 (影響因子： 3.759，中國科學(xué)院星二區(qū)，他引： 11)
10. Bhat-Nakshatri P, Wang G, Appaiah H, Luktuke N, Carroll JS, Geistlinger TR, 褐色 M, Badve S, Liu Y, Nakshatri H. AKT alters genome-wide estrogen receptor alpha binding and impacts estrogen signaling in breast cancer. 摩爾 Cell Biol. 2008; 28(24):7487-7503 (影響因子：6.057，中科院二區(qū)，他引： 40)
11. Wang G*, Wang F, Huang Q, Li Y, Liu Y, Wang Y. Understanding Transcription Factor Regulation by Integrating Gene Expression and DNase I Hypersensitive Sites. Biomed Res Int. 2015;2015:757530 (影響因子： 2.476，中科院三區(qū))
12. Wang G*, Liu Y, Zhu D, Klau GW, Feng W. 生物信息學(xué) Methods and Biological Interpretation for Next-Generation Sequencing Data. Biomed Res Int. 2015; 2015:690873 (影響因子： 2.476，中科院三區(qū))
13. Zhao Y, Zou Q; Jiang Y; Wang, G*. A Graphic Processing Unit Web Server for Computing Correlation Coefficients for Gene Expression Data. Journal of Computational and Theoretical Nanoscience, 12(4), pp 582-584 (影響因子： 1.666，中科院三區(qū))
14. Wang G*, Qi K, Zhao Y, Li Y, Juan L, Teng M, Li L, Liu Y, Wang Y. Identification of Regulatory Regions of Bidirectional Genes in Cervical Cancer. bmc Medical Genomics. 2013;6 Suppl 1:S5 (影響因子： 2.873，中科院三區(qū)，他引： 8)
15. Wang G, Wang Y, Shen C, Huang Y, Kuang K, Huang T, Nephew K, Li L, Liu Y. 核糖核酸 Polymerase II binding patterns reveal genomic regions involved in microRNA gene regulation. PLoS ONE. 2010;5(11): e13798 (影響因子： 4.092，中科院三區(qū)，他引： 27)
16. Wang G, Wang Y, Teng M, Zhang D, Li L, Liu Y. Signal transducers and activators of transcription-1 (STAT1) regulates micro核糖核酸 transcription in interferon γ – stimulated HeLa cells. PLoS ONE. 2010; 5(7):e11794 (影響因子： 4.092，中國科學(xué)院星三區(qū)，他引： 9)
17. Zou Q, Li X, Jiang Y, Zhao Y, Wang G*. BinMemPredict: a Web server and software for predicting membrane protein types. Current Proteomics. 2013; 10(1): 2-9 (影響因子： 0.635，他引：23，中科院四區(qū))
18. Qu K, Han K, Wu S, Wang G, Wei L. Identification of 脫氧核糖核酸-Binding Proteins Using Mixed Feature Representation Methods. Molecules. 2017 Sep 22;22(10) (影響因子： 2.861，中科院三區(qū))
19. Liu S, Zibetti C, Wan J, Wang G, Blackshaw S, Qian J. Assessing the model transferability for prediction of transcription factor binding sites based on chromatin accessibility. BMC 生物信息學(xué) 2017 Jul 27;18(1):355 (影響因子： 2.448，中科院二區(qū))
20. Zhao Y, Wang F, Chen S, Wan J, Wang G. Methods of MicroRNA Promoter Prediction and Transcription Factor Mediated Regulatory Network. Biomed Res Int. 2017;2017:7049406 (影響因子：影響因子： 2.476，中科院三區(qū))
21. Peng J, Bai K, Shang X, Wang G, Xue H, Jin S, Cheng L, Wang Y, Chen J. Predicting disease-related genes using integrated biomedical networks. BMC Genomics. 2017 Jan 25;18(Suppl 1):1043 (影響因子： 3.729，中國科學(xué)院星二區(qū)，高被引論文，他引： 6)
22. Campochiaro PA, Hafiz G, Mir TA, Scott AW, Zimmer-Galler I, Shah SM, Wenick AS, Brady CJ, Han I, He L, Channa R, Poon D, Meyerle C, Aronow MB, Sodhi A, Handa JT, Kherani S, Han Y, Sophie R, Wang G, Qian J. Pro-permeability Factors in Diabetic Macular Edema; the Diabetic Macular Edema Treated With Ozurdex Trial. Am J Ophthal摩爾 2016;168:13-23(影響因子： 5.052，中科院二區(qū))
23. Zou Q, Li J, Song L, Zeng X, Wang G. Similarity computation strategies in the microRNA-disease network: a survey. Brief Funct Genomics. 2015 Jul 1. pii: elv024 (影響因子： 4.098，中科院二區(qū)，高被引論文，他引： 51)
24. oliver VF, Jaffe AE, Song J, Wang G, Zhang P, Branham KE, Swaroop A, Eberhart CG, Zack DJ, Qian J, Merbs SL. Differential 脫氧核糖核酸 methylation identified in the blood and retina of AMD patients. Epigenetics. 2015;10(8):698-707 (影響因子： 4.394，中科院二區(qū)，他引： 8)
25. Wan J, oliver VF, Wang G, Zhu H, Zack DJ, Merbs SL, Qian J. Characterization of tissue-specific differential DNA methylation suggests distinct modes of positive and negative gene expression regulation. BMC Genomics. 2015 Feb 5;16:49 (影響因子： 3.729，中科院二區(qū)，他引： 30)
26. Campochiaro PA, Hafiz G, Mir TA, Scott AW, Sophie R, Shah SM, Ying HS, Lu L, Chen C, Campbell JP, Kherani S, Zimmer-Galler I, Wenick A, Han I, Paulus Y, Sodhi A, Wang G, Qian J. Pro-permeability Factors After Dexamethasone Implant in Retinal Vein Occlusion; The Ozurdex for Retinal Vein Occlusion (ORVO) Study. Am J Ophthal摩爾 2015 Oct 16. pii: S0002-9394(15)00604-2 (影響因子： 5.052，中國科學(xué)院星二區(qū)，他引： 6)
27. Zhang D, Wang G, Wang Y. Transcriptional regulation prediction of antiestrogen resistance in breast cancer based on RNA polymerase II binding data. BMC 生物信息學(xué) 2014;15 Suppl 2:S10 (影響因子： 2.435，中科院二區(qū)，他引： 1)
28. Zhu S, Wang G, Liu B, Wang Y. Modeling exon expression using histone modifications. PLoS ONE. 2013; 8(6): e67448 (影響因子： 3.234，中科院三區(qū)，他引： 4)
29. Cheng L, Wang G, Li J, Zhang T, Xu P, Wang Y. SIDD: A Semantically Integrated Database towards a Global View of Human Disease. PLoS One. 2013;8(10):e75504 (影響因子： 3.234，中科院三區(qū)，他引： 10)
30. Jiang Q, Wang G, S Jin, Y Li, Wang Y*. Predicting human microRNA-disease associations based on support vector machine. International Journal of Data Mining and 生物信息學(xué). 2013; 8(3):282-293 (影響因子： 0.495，他引： 22，中科院四區(qū))
31. Juan L, Wang G, Radovich M, Schneider BP, Clare SE, Wang Y, Liu Y. Potential roles of microRNAs in regulating long intergenic noncoding RNAs. BMC Medical Genomics. 2013;6 Suppl 1:S7 (影響因子： 2.873，中科院三區(qū)，他引： 40)
32. Teng M, Wang Y, Kim S, Li L, Shen C, Wang G, Liu Y, Huang T, Nephew KP, Balch C. Empirical Bayes model comparisons for differential methylation analysis. Comparative and Functional Genomics, 2012:376706 ( 影響因子： 1.747，中科院四區(qū)，他引： 1)
33. Zhu S, Jiang Q, Wang G, Liu B, Teng M, Wang Y. Chromatin structure characteristics of pre-miRNA genomic sequences. BMC Genomics. 2011 Jun 25;12:329 (影響因子： 4.397，中科院二區(qū)，他引： 5)
34. Shen C, Huang Y, Liu Y, Wang G, Zhao Y, Wang Z, Teng M, Wang Y, Flockhart DA, Skaar TC, Yan P, Nephew KP, Huang TH, Li L. A modulated Empirical Bayes Model for Identifying Topological and Temporal Estrogen Receptor alpha Regulatory Networks in Breast Cancer. BMC Syst Biol. 2011;5(1):67 (影響因子： 2.982，中科院二區(qū)，他引： 16)
35. Patel JB, Appaiah HN, Burnett RM, Bhat-Nakshatri P, Wang G, Mehta R, Badve S, Thomson MJ, Hammond S, Steeg P, Liu Y, Nakshatri H. Control of EVI-1 oncogene expression in metastatic breast cancer cells through micro核糖核酸 miR-22. Oncogene. 2011; 30(11):1290-1301 (影響因子：7.357，中科院一區(qū)，他引： 63)
36. Jiang Q, Hao Y, Wang G, Juan L, Zhang T, Teng M, Liu Y, Wang Y. Prioritization of disease microRNAs through a human phenome-microRNAome network. BMC Syst Biol. 2010; 4 Suppl 1:S2 (影響因子： 3.148，中科院二區(qū)，他引： 90)
37. Wang X, Wang K, Radovich M, Wang Y, Wang G, Feng W, Sanford JR, Liu Y. Genome-wide prediction of cis-acting RNA elements regulating tissue-specific pre-mRNA alternative splicing. BMC Genomics. 2009; 10 Suppl 1:S4 (影響因子： 4.206，中科院二區(qū)，他引： 8)
38. Jiang Q, Wang Y, Hao Y, Juan L, Teng M, Zhang X, Li M, Wang G, Liu Y. miR2Disease: a manually curated database for microRNA deregulation in human disease. Nucleic Acids Res. 2009; 37(Database issue):D98-104 (影響因子： 7.836，中科院一區(qū)，高被引論文，他引： 494 )
39. Wang X, Wang G, Shen C, Li L, Wang X, Mooney SD, Edenberg HJ, Sanford JR, Liu Y. Using RNase sequence specificity to refine the identification of 核糖核酸protein binding regions. BMC Genomics. 2008; 9 Suppl 1:S17 (影響因子： 3.759，中科院二區(qū)，他引： 6)
其它國際期刊及會(huì)議文章：
40. Teng M, Wang Y, Wang G, Jung J, Edenberg H, Sanford J, Liu Y. Prioritizing single-核苷酸 variations that potentially regulate alternative splicing BMC Proceedings, 2011; 5(Suppl 9):s40
41. Jiang Q, Wang G, Wang Y. An approach for prioritizing disease-related micro核糖核酸s based on genomic data integration. The 3rd International Conference on BioMedical Engineering and Informatics (BMEI'10). 2010. p2270-2274 (EI 檢索)
42. Jiang Q, Wang G, Zhang T, Wang Y. Predicting human microRNA-disease associations based on support vector machine. 2010 IEEE International Conference on 生物信息學(xué) and Biomedicine (BIBM'10). 2010. p467-472
43. Jiang Q, Hao Y, Wang G, Zhang T, Wang Y. Weighted network-based inference of human microRNA-disease associations. The 5th International Conference on Frontier of Computer Science and Technology. 2010. p431-435 (EI 檢索)
44. Wang X, Teng M, Wang G, Zhao Y, Han X, Feng W, Li L, Sanford J, Liu Y, xIP-seq platform: an integrative framework for high-throughput sequencing data analysis. 2009 Ohio Collaborative Conference on Bioinformatics, OCCBIO 2009. p26-31 (EI 檢索)
45. Wang X, Wang K, Wang G, Sanford J, Liu Y. Model-based prediction of cis-acting RNA elements regulating tissue-specific alternative splicing. 8th IEEE International Conference on 生物信息學(xué) and BioEngineering, BIBE 2008. p1-6 (EI 檢索)
46. Chen AB, Hamamura K, Wang G, Xing W, Mohan S, Yokota H, Liu Y. Model-based comparative prediction of transcription-factor binding motifs in anabolic responses in bone. Genomics Proteomics 生物信息學(xué) 2007; 5(3-4):158-165.
47. Guo-hua Wang, Ya-Dong Wang, Mao-Zu Guo. An 本體論based method for similarity calculating between concepts in the semantic web. Proceedings of the fifth International Conference on Machine Learning and Cybernetics 2006. p1538-1542 (EI 檢索)
參考資料 >
計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)專家講座系列報(bào)道（汪國華）-吉林大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院.吉林大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院.2022-01-25