新冠病毒檢測，指的是通過核酸、抗原或抗體等分子檢測手段對人體是否感染類SARS病毒或者患有新型冠狀病毒病（COVID-19）予以診斷。
病毒簡介
新型正冠狀病毒亞科屬于β屬冠狀病毒，基因特征與SARSr-CoV和MERSr-CoV有明顯區別。病毒對紫外線和熱敏感，56℃ 30分鐘、乙醚、75%乙醇、含氯消毒劑、過氧乙酸和三氯甲烷等脂溶劑均可有效滅活病毒。基于目前的流行病學調查和研究結果，潛伏期為1-14天，多為3-7天；傳染源主要是新型冠狀病毒感染的患者，無癥狀感染者也可能成為傳染源；主要傳播途徑為經呼吸道飛沫和接觸傳播，在相對封閉的環境中長時間暴露于高濃度氣溶膠情況下存在經氣溶膠傳播的可能，其他傳播途徑尚待明確；人群普遍易感。
標本采集
臨床標本
采集的臨床標本包括病人的上呼吸道標本（如鼻咽拭子、咽拭子等）、下呼吸道標本（如深咳痰液、肺泡灌洗液、支氣管灌洗液、呼吸道吸取物等）、糞便/肛拭子標本、抗凝血藥和血清標本等。為提高核酸檢測陽性率，應當盡量采集病例發病早期的呼吸道標本，留取痰液，實施氣管插管時采集下呼吸道分泌物，標本采集后盡快送檢。
標本采集、運送、存儲和檢測暫按二類高致病性病原微生物管理，按照《病原微生物實驗室生物安全管理條例》及《可感染人類的高致病性病原微生物菌（毒）種或樣本運輸管理規定》（衛生部令第45號）及其他相關要求執行。
標本種類
1.上呼吸道標本：包括鼻咽拭子、咽拭子等。
2.下呼吸道標本：深咳痰液、肺泡灌洗液、支氣管灌洗液、呼吸道吸取物等。
3.便標本：留取糞便標本約10克（花生大小），如果不便于留取便標本，可采集肛拭子。
4.血液標本：盡量集發病后7天內的急性期抗凝血藥，采集量5ml,建議使用含有乙二胺四乙酸二鈉抗凝劑的真空釆血管采集血液。
5.血清標本：盡量釆集急性期、恢復期雙份血清。第一份血清應盡早（最好在發病后7天內）釆集，第二份血清應在發病后第3～4周釆集。采集量5ml，建議使用無抗凝劑的真空釆血管。血清標本主要用于抗體的測定，不進行核酸檢測。
采集方式
1.鼻咽拭子：采樣人員一手輕扶被采集人員的頭部，一手執拭子，拭子貼鼻孔進入，沿下鼻道的底部向后緩緩深入，由于鼻道呈弧形，不可用力過猛，以免發生外傷出血。待拭子頂端到達鼻咽腔后壁時，輕輕旋轉一周（如遇反射性咳嗽，應停留片刻），然后緩緩取出拭子，將拭子頭浸入含2～3ml病毒保存液（也可使用等滲鹽溶液、組織培養液或磷酸鹽緩沖液）的管中，尾部棄去，旋緊管蓋。
2.咽拭子：被采集人員先用生理鹽水漱口，采樣人員將拭子放入無菌生理鹽水中濕潤（禁止將拭子放入病毒保存液中，避免抗生素引起過敏），被采集人員頭部微仰，嘴張大，并發“啊”音，露出兩側咽扁桃體，將拭子越過舌根，在被采集者兩側咽扁桃體稍微用力來回擦拭至少3次，然后再在咽后壁上下擦拭至少3次，將拭子頭浸入含2～3ml病毒保存液（也可使用等滲鹽溶液、組織培養液或磷酸鹽緩沖液）的管中，尾部棄去，旋緊管蓋。咽拭子也可與鼻咽拭子放置于同一管中。
3.鼻咽抽取物或呼吸道抽取物：用與負壓泵相連的收集器從鼻咽部抽取粘液或從氣管抽取呼吸道分泌物。將收集器頭部插入鼻腔或氣管，接通負壓，旋轉收集器頭部并緩慢退出，收集抽取的粘液，并用3ml采樣液沖洗收集器1次（亦可用小兒導尿管接在50ml注射器上來替代收集器）。
4.深咳痰液：要求病人深咳后，將咳出的痰液收集于含3ml采樣液的50ml螺口塑料管中。如果痰液未收集于采樣液中，可在檢測前，加入2～3ml采樣液，或加入痰液等體積的痰消化液。
5.支氣管灌洗液：將收集器頭部從鼻孔或氣管插口處插入氣管（約30cm深處），注入5ml生理鹽水，接通負壓，旋轉收集器頭部并緩慢退出。收集抽取的粘液，并用采樣液沖洗收集器1次（亦可用小兒導尿管接在50ml注射器上來替代收集）。
6.肺泡灌洗液：局部麻醉后將纖維支氣管鏡通過口或鼻經過咽部插入右肺中葉或左肺舌段的支管，將其頂端契入支氣管分支開口，經氣管活檢孔緩緩加入滅菌生理鹽水，每次30～50ml，總量100～250ml，不應超過300ml。
7.糞便標本：取1ml標本處理液，挑取黃豆粒大小的便標本加至管中，輕輕吹吸3-5次，室溫靜置10分鐘，以8000rpm離心5分鐘，吸取上清液進行檢測。
糞便標本處理液可自行配制：1.211gTris，8.5g氯化鈉，1.1g氯化鈣或1.47g含結晶水的氯化鈣，溶解至800ml去離子水中，用濃鹽酸調節pH為7.5，以去離子水補充至1000ml。也可使用HANK’S液或其它等滲鹽溶液、組織培養液或磷酸鹽緩沖液溶解便標本制備便懸液。如患者出現腹瀉癥狀，則留取糞便標本3～5ml，輕輕吹打混勻后，以8000rpm離心5分鐘，吸取上清液備用。
7.肛拭子：用消毒棉拭子輕輕插入肛門3～5cm，再輕輕旋轉拔出，立即放入含有3～5ml病毒保存液的15ml外螺旋蓋采樣管中，棄去尾部，旋緊管蓋。
8.血液標本：建議使用含有乙二胺四乙酸二鈉抗凝劑的真空釆血管采集血液標本5ml，根據所選用核酸提取試劑的類型確定以全血或血漿進行核酸提取。如需分離血漿，將全血1500～2000rpm離心10分鐘，收集上清于無菌螺口塑料管中。
9.血清標本：用真空負壓采血管采集血液標本5ml，室溫靜置30分鐘，1500～2000rpm離心10分鐘，收集血清于無菌螺口塑料管中。
其他材料：依據設計需求規范采集。
標本包裝
標本采集后在生物安全二級實驗室生物安全柜內分裝。
1.所有標本應放在大小適合的帶螺旋蓋內有墊圈、耐冷凍的樣本采集管里，擰緊。容器外注明樣本編號、種類、姓名及采樣日期。
2.將密閉后的標本裝入密封袋，每袋限一份標本。樣本包裝要求要符合《危險品航空安全運輸技術細則》相應的標準。
3.涉及外部標本運輸的，應根據標本類型，按照A類或B類感染性物質進行三層包裝。
標本保存
用于病毒分離和核酸檢測的標本應盡快進行檢測，能在24小時內檢測的標本可置于4℃保存；24小時內無法檢測的標本則應置于-70℃或以下保存（如無-70℃保存條件，則于-20℃冰箱暫存）。血清可在4℃存放3天，-20℃以下可長期保存。應設立專庫或專柜單獨保存標本。標本運送期間應避免反復凍融。
標本送檢
標本采集后應盡快送往實驗室，如果需要長途運輸，建議采用干冰等制冷方式進行保藏。
核酸測定
檢測方法
新型冠狀病毒感染的常規檢測方法為實時熒光RT-PCR。任何類SARS病毒的檢測都必須在具備條件的實驗室由經過相關技術安全培訓的人員進行操作。本指南中的核酸檢測方法主要針對新型冠狀病毒基因組中開放讀碼框1ab（openreadingframe1ab，ORF1ab）和核殼蛋白（nucleocapsidprotein，N）。
滿足條件
1.同一份標本中新型冠狀病毒2個靶標（ORF1ab、N）實時熒光RT-PCR檢測結果均為陽性。如果出現單個靶標陽性的檢測結果，則需要重新采樣，重新檢測。如果仍然為單靶標陽性，判定為陽性。
2.兩種標本實時熒光RT-PCR同時出現單靶標陽性，或同種類型標本兩次采樣檢測中均出現單個靶標陽性的檢測結果，可判定為陽性。
核酸檢測結果陰性不能排除新型冠狀病毒感染，需要排除可能產生假陰性的因素，包括：樣本質量差，比如口咽等部位的呼吸道樣本；樣本收集的過早或過晚；沒有正確的保存、運輸和處理樣本；技術本身存在的原因，如病毒變異、PCR抑制等。
檢測項目
推薦選用針對類SARS病毒的ORF1ab、N基因區域的引物和探針。
靶標一（OR一級方程式錦標賽ab）：
正向引物（F）：CCCTGTGGGTTTTACACTTAA
反向引物（R）：ACGATTGTGCATCAGCTGA
熒光探針（P）：5'-FAM-CCGTCTGCGGTATGTGGAAAGGTTATGG-BHQ1-3'
靶標二（N）：
正向引物（F）：GGGGAACTTCTCCTGCTAGAAT
反向引物（R）：CAGACATTTTGCTCTCAAGCTG
熒光探針（P）：5'-FAM-TTGCTGCTGCTTGACAGATT-TAMRA-3'
核酸提取和實時熒光RT-PCR反應體系及反應條件參考相關廠家試劑盒說明。
結果判斷
陰性：無Ct值或Ct≥40。
陽性：Ct值<37，可報告為陽性。
灰度區：Ct值在37-40之間，建議重復實驗，若重做結果Ct值<40，擴增曲線有明顯起峰，該樣本判斷為陽性,否則為陰性。
注：如果用的是商品化試劑盒，則以廠家提供的說明書為準。
抗體檢測
抗體檢測是看血液里面是否有新冠病毒的抗體，新冠病毒感染3至5天后，IgM抗體可以出現陽性，提示近期急性感染；IgG抗體陽性則表示過去有過感染，已經有了免疫力。
參考資料 >
新型冠狀病毒肺炎防控方案（第五版）.烏蘭察布市衛生健康委員會.2022-12-14
新冠病毒核酸檢測、抗體檢測及結果解讀.今日頭條-光明網.2022-12-14