mirbase數(shù)據(jù)庫，數(shù)據(jù)管理不再僅僅是存儲和管理數(shù)據(jù)，而轉(zhuǎn)變成用戶所需要的各種數(shù)據(jù)管理的方式。
正文
2014年6月26日，Sanger microRNA 序列數(shù)據(jù)庫（miRBase）升級至 21.0 版本。新版本miRNA數(shù)據(jù)庫升級距上一次數(shù)據(jù)庫的更新(mirRNA20.0 2013年6月25日發(fā)布)經(jīng)歷了一年的時間。新的miRBase21.0數(shù)據(jù)庫中，人、大鼠和小鼠的變化不大；人多了3個成熟的miRNA；小鼠多了9個成熟的miRNA；大鼠多了38個成熟的 miRNA。但是，其它物種（蝙蝠，馬，羊，眼鏡蛇屬和三文魚等物種）有了較大的更新。總計，新增了4196條發(fā)夾前體序列和5441條成熟miRNA。
2012年8月1日正式發(fā)布了。相比于以往版本的數(shù)據(jù)庫，19.0版數(shù)據(jù)庫進行了巨大的數(shù)據(jù)更新：miRNA發(fā)夾前體序列已升至21264條，新增3171條；成熟miRNA升至25141條，新增3625條；已發(fā)布的miRNA序列共涵蓋193個物種，相比于18.0版新增25個物種。新版數(shù)據(jù)庫對miRNA序列注釋和命名進行了系統(tǒng)的修正，miR*命名已經(jīng)終止使用，取而代之的是-5p和-3p的命名法。新增成熟體miRNA在動物中最具代表性的有Homo sapiens [人]新增121條，Mus musculus [小鼠]新增124條，Gallus gallus [雞]新增247條，Bos taurus [牛]新增79條。植物中增長最為顯著的是Malus domestica [蘋果]新增205條，Glycine max [大豆]新增160條，Populus trichocarpa [毛果楊]新增132條，Cucumis melo [甜瓜]新增117條，Oryza sativa [水稻]新增47條。第一次發(fā)布了煙草屬 tabacum [煙草] 165條成熟體miRNA。
miRBase序列數(shù)據(jù)庫是一個提供包括miRNA序列數(shù)據(jù)、注釋、預(yù)測基因靶標(biāo)等信息的全方位數(shù)據(jù)庫，是存儲miRNA信息最主要的公共數(shù)據(jù)庫之一。miRBase提供便捷的網(wǎng)上查詢服務(wù)，允許用戶使用關(guān)鍵詞或序列在線搜索已知的miRNA和靶標(biāo)信息，詳情請訪問。
2011年11月4日（北京時間），Sanger microRNA序列數(shù)據(jù)庫(miRBase)升級至18.0版。在新版本中，發(fā)夾前體序列升至18226條，新增1488條；成熟miR和miR*產(chǎn)物共21643條，新增1929條；新版本報道序列共涵蓋個168個物種。從之前的版本（17.0）開始，miRBase一直致力于對成熟序列進行重命名，用-5p/-3p命名法取代miR/miR*命名法。本次更新過程中大約對將近1400條成熟序列進行了重命名，涵蓋人、小鼠和線蟲3個物種。斑馬魚互補miRNA（miRNA complement）發(fā)生了很大的變化，依據(jù)Zv9基因組拼裝對收錄序列進行了合理的調(diào)整，刪除了26條斑馬魚序列，并新增了12條代表重復(fù)基因位點的序列。新增miRNA序列動物中最具代表性的有Homo sapiens [人]新增103條，Mus musculus [小鼠]新增21條，青鳉屬 latipes [青鳉]新增152條。植物物種中增長最為顯著的是Medicago truncatula [苜]新增260條，Glycine max [大豆]新增159條，Oryza sativa [水稻]新增90條，Arabidopsis thaliana [擬南芥]新增59條。
此外，新版本中首次收錄的物種共有15個。? 囊泡藻類：Phaeodactylum tricornutum [三角褐指藻] (13)
? 7個動物物種： Anolis carolinensis [綠安祿蜥] (282)， 大袋鼠屬 eugenii [尤金袋鼠] (2)，Sarcophilus harrisii [袋獾] (67)，Rhipicephalus microplus [微小扇頭蜱] (24)，Ascaris suum [豬蛔蟲] (97)，Glottidia pyramidata (1)，Terebratulina retusa (1)。? 6個植物物種：Cucumis melo [甜瓜](3)，Acacia auriculiformis [大葉相思] (7)，Acacia mangium [馬占相思] (3)，鼠尾草屬 sclarea [熏衣蘇草] (18)，Bruguiera cylindrica [柱果木欖] (4)，Bruguiera gymnorhiza [木欖] (4)。
? 病毒：Herpesvirus saimiri strain A11 (3)。
參考資料 >