王亞東，現任哈爾濱工業大學計算機科學與技術學院院長兼軟件學院院長，黑龍江省政協常委，民建黑龍江省第十屆委員會副主任委員，國家863計劃生物信息技術主題專家組專家（2001-2011），國家863計劃生物信息技術專題“十三五” 規劃專家組組長，黑龍江省生物醫學信息技術與系統工程研究中心主任，黑龍江省生物信息技術重點實驗室主任，中國人工智能學會理事，《生物信息技術》期刊編委。
任職情況
國務院學位委員會學科評議組成員
曾任國家863計劃生物和醫藥領域委員會專家（2006-2011）
曾任國家863計劃生物信息技術主題專家（2001-2006）
國家科技重點專項生物安全計劃專家組專家；
中國人類遺傳資源管理條例起草組專家
中國計算機學會理事
《生物信息學》期刊編委
國家“863”計劃重大項目“生物大數據開發與利用關鍵技術研究”首席科學家（2015-2017）
國家“863”計劃重大項目“數字化醫療工程”首席科學家（2011-2015）
2016年IEEE生物信息學和生物醫學國際會議主席（2016 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine Conference Chair）
2014年IEEE生物信息學和生物醫學國際會議共同主席（2014 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine Conference Co-Chair and Program Co-Chair）
黑龍江省生物醫學信息技術與系統工程研究中心主任
哈爾濱工業大學韓國SK生物醫學信息技術聯合實驗室主任?
教育經歷
1982.09-1986.03 黑龍江大學計算機科學與工程系獲理學學士
1986.09-1989.03 哈爾濱工業大學計算機科學與技術系獲碩士學位?
工作經歷
1989.03-1991.11 哈工大計算機科學與技術系 助教
1991.12-1996.06 哈工大計算機科學與技術系 講師
1996.07-2001.04 哈工大計算機科學與技術系 副教授
2001.05-至今 哈爾濱工業大學計算機科學與技術學院 教授
2005.06-至今 哈工大計算機科學與技術學院 博士生導師
2001.08-2001.12 哈工大計算機科學與技術學院 院長助理
2001.12-2010.11 哈工大計算機科學與技術學院 副院長
2011.01-2014.09 哈工大計算機科學與技術學院 院長?
2014.09-至今 哈工大計算機科學與技術學院院長、軟件學院院長
2022.07-民建黑龍江省第十屆委員會副主任委員。
研究方向
主要研究生物信息學、人工智能、知識工程、機器學習等。具體包括：基因組數據分析算法、數據可視化、知識挖掘與整合、網絡分析、生物醫藥領域搜索等。
2001年，王亞東教授在我國率先開展生物信息學的研究，成為我國第一批生物信息學專家；近十五年來，推動了我國863計劃一系列生物信息技術重大研究計劃的論證、規劃與實施工作；作為我國生物信息學領域的資深專家，有力地推動了我國生物信息技術的發展，并為我國基因組科學、計算機科學等相關領域的發展做出了重要貢獻。
科研項目
王亞東教授主持完成國家科技重大工程、國家863計劃項目、國家自然科學基金、國際合作項目等20余項；獲國家科技進步二等獎1項、省科技進步二等獎1項、省自然科學二等獎2項；國家863計劃重大項目“數字化醫療工程”（2011-2015）、“生物大數據開發與利用” （2015-2017）首席科學家。承擔的項目有：
生物大數據表述索引、搜索與存儲訪問技術，國家863計劃重大項目，2015.01-2017.12
物數字資源集成和信息服務關鍵技術研發, 國家863計劃項目，2014.01-2016.12
醫療物聯網關鍵技術研究與設備開發及驗證, 國家科技重大專項，2013.01-2015.12
醫療信息集成融合技術與系統開發, 國家863計劃項目，2011.01-2015.12
個人健康信息獲取與管理技術研究，國家863計劃項目，2012.01-2015.12
轉化生物信息學重大產品研制，國家863計劃項目，2012.01-2014.12
哈爾濱工業大學愛思開醫療信息技術聯合研究實驗室，國際合作項目，2011.01-2014.12
基于新一代測序數據的基因組拼接組裝算法研究 ，國家自然科學基金，2011.01-2015.12
基于個體基因組單核苷酸突變的等位基因轉錄調控模型研究，國家自然科學基金，2014.01-2017.12
基于多參考基因組的高通量測序片段映射方法研究，國家自然科學基金，2014.01-2016.12
基于生物數據融合的致病microRNA識別方法研究，國家自然科學基金，2012.01-2014.12
人類復雜疾病相關的非編碼區調控性單核酸變異預測研究，國家自然科學基金，2014.01-2016.12?
科研成果
1. 全球首創個人基因組瀏覽器Personal Genome Browser（PGB）哈爾濱工業大學生物信息學研究團隊研發了全球首創的個人基因組瀏覽器（PGB）。用戶使用該系統可簡潔、直觀地瀏覽自己的個人基因組，實現認知自己基因組的夢想。該系統為世界提供了首個個人基因組數據可視化框架；同時，其集成了數十個基因型健康表型知識庫，提供基于個人基因組的健康風險預測，成為個性化健康的支撐平臺。該系統受到國際同行的高度評價：“You do a lot of great works to the world！”
2. 全球首創家系基因組瀏覽器（FGB，Family Genome Browser）在個人基因組瀏覽器基礎上，哈爾濱工業大學生物信息學研究團隊研發了世界首個家系基因組瀏覽器（FGB）。用戶使用該系統可同時瀏覽一個家族的基因組；該系統提供了基因組變異分析、基因組全新變異（de novo mutation）檢測、基因組重組識別等基因組分析工具。該系統受到國際同行的高度評價：“This is an important and valuable contribution and authors use state-of-the-art software engineering.”
3. 基于圖索引的高通量測序片段比對算法deBGA哈爾濱工業大學生物信息學研究團隊研發了基于圖索引的高通量測序片段比對算法deBGA。該算法創新性地建立了基因組的圖結構組織和索引，并在此基礎上設計實現了基于基因組圖索引測序片段快速比對方法。該算法利用基因組圖索引，有效地解決了大量測序片段向大量參考基因組比對的難題，并大幅降低了測序片段比對的時間代價，使高通量測序片段比對的速度相較于當前主流算法提升了數十倍。該算法獲得了國際同行的高度評價：“該工作向實現基于群體參考基因組的快速序列比對邁出重要一步，這將有望實現長期以來反復討論但尚未實現的融合已知變異信息的序列比對方法。”
4. 面向海量基因組序列的索引算法deBWT哈爾濱工業大學生物信息技術團隊研發了針對海量基因組數據的BWT索引建立算法deBWT。該算法采用基于de Bruijn圖分支路徑的創新性數據結構，有效解決了BWT索引建立過程中長重復后綴（suffix with long common prefix）的比較問題，并突破了基于增量策略（incremental approach）的BWT索引構建算法難以并行化的瓶頸，形成了高速、高度可并行化的BWT索引構建算法與系統。該算法獲得了國際同行的高度評價：“此項工作是基因組索引方面一項出色的理論貢獻，其產生的影響將不止于廣泛應用于基因組索引，也將延伸至其他相關應用中。”
承擔課程
生物信息學導論（本科生課程）
知識工程（研究生課程）
論文論著
在《Bioinformatics》(SCI,IF 5.766)、《Nucleic Acids Research》(SCI,IF 9.202)、《現代生物出版集團 Bioinformatics》(SCI,IF 2.435)、《Human Mutation》(SCI,IF 5.089)、《BMC Genomics》(SCI,IF 4.40)等國際著名期刊發表論文150余篇。
Teng Mingxiang et al.?Wang Y. regSNPs: a strategy for prioritizing regulatory single 核苷酸 substitutions.?生物信息學 2012?
Liu B, Guo H, BrudnoM,?Wang Y*. deBGA: read alignment with de Bruijn Graph-based seed and extension.?Bioinformatics, 2017?
Liu B, Jiang T, Yiu SM, Li J,?Wang Y*. rMFilter: acceleration of long read-based structure variation calling by chimeric read filtering.?Bioinformatics. 2017?
Liu B, Gao Y,?Wang Y*. LAMSA: fast split read alignment with long approximate matches.?生物信息學 2017?
Liu B, Zhu D,?Wang Y*. deBWT: parallel construction of Burrows-Wheeler Transform for large collection of genomes with de Bruijn-branch encoding.?Bioinformatics, 2016?
Liu B, Guan D,?Wang Y*. rHAT: fast alignment of noisy long reads with regional hashing.?生物信息學, 2016,32(11):1625-1631?
Yongzhuang Liu, Jian Liu, Jianguo Lu, Jiajie Peng, Liran Juan, Xiaolin Zhu, Bingshan Li,?Wang Y*. Joint detection of copy number variations in parent-offspring trios.?生物信息學, 2015: btv707.?
Jiajie Peng, Tao Wang, Jixuan Wang,?Wang Y*, Jin Chen*. Extend Gene 本體論 based on gene network data.?Bioinformatics.?2016, Pages 1185–1194?
L Juan, Y Liu, Y Wang, M Teng, T Zang,?Wang Y*. Family genome browser: visualizing genomes with pedigree information.?生物信息學, 2015: btv151.?
Liu Y, Li B, Tan R, Zhu X,?Wang Y*. A gradient boosting approach for filtering de novo mutations in parent-offspring trios.?Bioinformatics. 2014 Mar 10?
Jiang Yue,?Wang Y*, Brudno Michael. PRISM: Pair-read informed split-read mapping for base-pair level detection of insertion, deletion and structural variants.?生物信息學 2012?
任免信息
2017年5月17日，在民建黑龍江省九屆一次全委會議上，選舉王亞東為民建黑龍江省第九屆委員會副主任委員。
2022年7月1日，中國民主建國會黑龍江省第十次代表大會圓滿完成各項議程在哈爾濱市閉幕。會議選舉王亞東為民建黑龍江省第十屆委員會副主任委員。
參考資料 >
民建黑龍江省第十次代表大會閉幕.東北網－黑龍江日報.2022-07-02
雙基地教授.哈爾濱工業大學（威海）計算機科學與技術學院.2022-07-02