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李亦學
來源:互聯網

李亦學,男,博士生導師,廣州實驗室特聘研究員,國家生物數據中心體系粵港澳大灣區節點平臺首席科學家兼主任,中國科學院上海生命科學研究院營養與健康研究所生物醫學大數據中心主任,上海生物信息學會理事長,復旦大學泰州健康科學研究院科學顧問、生命科學家,上海交通大學教授,復旦大學遺傳學教育部協同創新中心前沿生物技術部主任。

1978年2月至1982年2月,李亦學就讀于新疆大學。1984年9月至1987年7月,李亦學在新疆大學攻讀碩士;1992年10月至1996年10月,李亦學獲海德堡大學理論物理博士學位。1996年10月至1997年2月,李亦學在斯圖加特大學從事博士后研究;1997年2月至2000年6月,李亦學在歐洲分子生物學實驗室進行博士后工作。2000年6月至2002年12月,李亦學任中國科學院上海生命科學研究院研究員。2002年2月至2023年12月,李亦學任上海科學院上海生物信息技術研究中心主任。2007年1月至2017年12月,李亦學任上海交通大學生命科學與技術學院生物統計學與生物信息學系系主任。2021年4月起,李亦學任廣州實驗室研究員。李亦學主要從事蛋白質組學、系統生物學研究,使用神經網絡、統計物理等方法從事與脫氧核糖核酸序列相關的軟件開發研究,特別發展了時間序列的統計相關算法等。研究方向涵蓋比較基因組學研究、基因編輯脫靶效應識別與臨床應用優化,主持構建新冠病毒進化網絡及生物醫學大數據操作系統"Bio-OS"。

李亦學曾獲全國五一勞動獎章上海市科教興市領軍人才、上海市勞動模范等榮譽。

人物經歷

1978年2月至1982年2月,李亦學就讀于新疆大學。1984年9月至1987年7月,李亦學在新疆大學攻讀理論物理碩士;1992年10月至1996年10月,李亦學獲海德堡大學理論物理博士學位。1996年10月至1997年2月,李亦學在斯圖加特大學從事博士后研究;1997年2月至2000年6月,李亦學在歐洲分子生物學實驗室進行博士后工作。

2000年6月至2002年12月,李亦學任中國科學院上海生命科學研究院研究員。2002年2月至2023年12月,李亦學任上海科學院上海生物信息技術研究中心主任。2007年1月至2017年12月,李亦學任上海交通大學生命科學與技術學院生物統計學與生物信息學系系主任。2021年4月起,李亦學任廣州實驗室研究員。

2021年8月1日,2021年中國科學院院士增選初步候選人名單公布,李亦學位列其中。

2023年7月,“人工智能與藥物設計”前沿學術論壇暨《人工智能與藥物設計》新書發布會在上海舉辦,李亦學以“生物大數據操作系統:數據密集型科研技術底座”為題,介紹了Bio-OS生物醫學大數據操作系統推動科學研究系統化和個性化的優勢和實際應用、基于第一性原理的病毒演化趨勢預測預警模型等研究成果。

2024年10月20日,第一屆國際智能醫學會議在上海召開,李亦學以《Employing deep learning technology to investigate the fitness-genotype landscape of 嚴重急性呼吸綜合征CoV-2 and gauge its transmission rates》為題探討了如何利用深度學習技術來研究SARS-CoV-2的適應度基因型景觀,并評估其傳播率。

2025年8月27日上午,人工智能賦能生物安全學術研討會在中國農科院植保所舉行,李亦學應邀做題為《人工智能&數據密集型科研范式及其應用》的專題報告。12月3日,中國科學院分子植物科學卓越創新中心林鴻宣院士團隊與上海交通大學林尤舜研究員團隊、廣州國家實驗室李亦學研究員團隊合作在國際權威學術期刊細胞》(Cell)上發表題為“A stepwise decoding mechanism for heat sensing in plants connects lipid remodeling to a nuclear signaling cascade”的研究論文。該論文研究破解了水稻感知并響應高溫的雙重“密碼鎖”,揭示了植物中的一個循序激活、協同串聯的熱信號感知機制,并通過對該機制的遺傳改良,成功培育出具有梯度耐熱性的水稻新株系,助力作物耐高溫分子育種,為應對全球變暖導致的糧食減產提供了新的解決方案。

研究領域

李亦學主要從事蛋白質組學、系統生物學研究,使用神經網絡、統計物理等方法從事與脫氧核糖核酸序列相關的軟件開發研究,特別發展了時間序列的統計相關算法等。研究方向涵蓋比較基因組學研究、基因編輯脫靶效應識別與臨床應用優化,主持構建新冠病毒進化網絡及生物醫學大數據操作系統"Bio-OS"。

主要作品

論文

參考資料:

專利

參考資料:

書籍

參考資料:

主要成就

申請發明專利8項,獲得軟件著作權15項,在基因編輯脫靶效應識別與臨床應用優化工作中主持數據建模分析工作,取得突破性成果;構建數理模型和生物信息學分析工具集,支撐不同生命調控過程的解析與新冠病毒進化網絡的構建。此外,李亦學主持開發生物醫學大數據操作系統“Bio-OS”,以降低臨床科研計算復雜度,支撐“智慧醫療數據密集型科研”范式的推廣,為廣大生物醫學研究人員提供更為便利的生物醫學大數據學習和分析平臺。作為通訊和共同通訊作者在包括Nature,Science,Nature Communications,細胞 Stem Cell,Cancer Cell,Genome Research,Genome Biology,Genome Medicine,Molecular System Biology,Molecular Biology & Evolution,PNAS在內的專業雜志共發表科學論文300篇以上,引用23000次以上,H因子75。

社會職務

復旦大學泰州健康科學研究院科學顧問,上海生物信息技術研究中心主任,中國科學院上海生命科學研究院生物信息中心主任,中科院系統生物學重點實驗室副主任。國家“十一五”863計劃生物與醫藥領域專家組成員,上海市科學教育興市領軍人才。國家蛋白質機器重點研究計劃、國家生物安全重點專項、國家常見多發病重點專項、國家生物與信息融合等重點專項專家組專家,上海交通大學教授,復旦大學遺傳學教育部協同創新中心前沿生物技術部主任。

所獲榮譽

參考資料:

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