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物理作圖
來(lái)源:互聯(lián)網(wǎng)

物理作圖是一種用于確定遺傳標(biāo)記在基因組上位置和距離的技術(shù),通常使用物理尺度(如核苷酸堿基對(duì)的基因)來(lái)標(biāo)注這些標(biāo)記。物理作圖的結(jié)果可以與遺傳圖譜相比較,兩者互為補(bǔ)充,共同服務(wù)于基因組圖譜的研究。

原理

物理作圖的基本原理是以物理尺度(如堿基對(duì)的基因)來(lái)標(biāo)明各種遺傳標(biāo)記在基因組上的位置和距離。

方法

限制性酶圖譜

這種方法主要針對(duì)脫氧核糖核酸分子長(zhǎng)度在50kb以下的片段,但對(duì)于大于50kb的DNA分子,則需要選擇稀有切點(diǎn)的內(nèi)切酶進(jìn)行酶切。具體操作包括使用識(shí)別多個(gè)核苷酸的內(nèi)切酶,如NotI,以及選擇其酶切位點(diǎn)基因組中出現(xiàn)頻率較低的內(nèi)切酶。

熒光原位雜交

熒光原位雜交技術(shù)(FISH)是另一種常用的物理圖譜構(gòu)建方法。該技術(shù)通過(guò)熒光標(biāo)記的探針與DNA分子雜交,在顯微鏡下直接觀察染色體上的雜交信號(hào)。探針可以使用熒光或同位素標(biāo)記,而染色體上出現(xiàn)雜交信號(hào)的位置即代表探針脫氧核糖核酸在染色體上的圖譜位點(diǎn)。實(shí)驗(yàn)過(guò)程中,首先制備有絲分裂中期的細(xì)胞片,然后將染色體變性成單鏈狀態(tài),隨后加入變性后的DNA探針并進(jìn)行保溫處理,最終記錄結(jié)果。在FISH中,一個(gè)克隆的DNA片段即可作為雜交的探針。

序列標(biāo)簽位點(diǎn)

序列標(biāo)簽位點(diǎn)(STS)法也是一種常見(jiàn)的物理圖譜構(gòu)建方法。這種技術(shù)利用已知序列作為標(biāo)簽的位點(diǎn)作為探針,與基因組DNA雜交,從而繪制出物理圖譜。作為STS,該序列應(yīng)具有兩個(gè)特點(diǎn):一是序列已知,便于PCR檢測(cè);二是基因組中只有一個(gè)位點(diǎn),不存在重復(fù)。

參考資料 >

物理作圖方法和標(biāo)準(zhǔn).百度文庫(kù).2024-10-26

限制酶圖譜.《中國(guó)大百科全書(shū)》第三版網(wǎng)絡(luò)版.2024-10-26

熒光原位雜交.知乎專欄.2024-10-26

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