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細胞區室（英語：cellular compartment，亦稱為細胞腔隙）是細胞生物學中使用的名詞，包括所有真核生物的細胞質中封閉的部分，它們多被單層或雙層的磷酸甘油酯所包圍。細胞區室化允許生物膜將細胞內不同的空間分隔，形成各種各樣的細胞器。這種分隔容許不同區室中有不同的pH值、不同的電勢及酶系統等，并容許細胞在同一時間內進行不同的代謝活動。
基本介紹
絕大多數的細胞器均被視為是細胞區室，例如：線粒體、葉綠體（光合生物）、過氧化物酶體、溶酶體、內質網、細胞核及高爾基體。更小的元素，如囊泡，和有時甚至是微管等也計算在內。一般認為細胞區室化并不存在于原核生物的細胞內，但隨著諸如羧酶體（carboxysome）及對細菌的微區室（bacterial microcompartment）的研究顯示原核生物也有能力去對細胞器進行區室化。
類別
在真核生物細胞內，可以識別出4種主要的細胞區室：
1. 包括細胞核在內的核室
2. 在內質網的膜之間的空間中（內膜系統）
3. 細胞器
4. 細胞質
功能
細胞區室化不僅允許細胞內部形成不同的微環境，而且由于內膜系統的存在，令多種的細胞器互相聯系起來。這種聯系使得各細胞器之間能有序地進行有關物質交換、能量與信息傳遞等各種活動。這樣的組織結構極大地提高了細胞的效率和復雜性，使得細胞能夠同時進行多種代謝活動，而這些活動在空間上是分隔的，但在功能上卻是相互依賴的。
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