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阻遏蛋白（repressor protein），也稱為抑制子，是一種脫氧核糖核酸或核糖核酸結合蛋白，它通過與操縱子或相關的沉默子結合來抑制一個或多個基因的表達。在原核生物中，阻遏蛋白通過阻止RNA聚合酶與啟動子的連接來抑制基因轉錄成信使RNA，而在真核生物中，盡管不常見，它們主要存在于簡單生物體中，并通過與激活因子直接相互作用來發揮作用。
工作原理
阻遏蛋白能夠識別特定的操縱基因，即操縱子是阻遏蛋白的結合位點。當操縱序列結合阻遏蛋白時，會阻礙RNA聚合酶與啟動序列的結合，或使RNA聚合酶不能沿脫氧核糖核酸向前移動，從而阻遏轉錄過程，介導負性調節。這種機制可抑制與操縱基因相聯系的基因群，也就是操縱子的mRNA合成，從而減少或阻擋基因表達。
除了DNA結合阻遏蛋白外，還存在可以與核糖核酸結合的阻遏蛋白，它們與mRNA結合并阻止mRNA轉譯為蛋白質。這種對基因表達的阻擋或減低稱為抑制。如果存在誘導物，即啟動基因表達的分子，則它可以與阻遏蛋白相互作用并將其與操縱子分離，使得RNA聚合酶能夠轉錄信息，表達基因。此外，共阻遏蛋白是一種分子，它可以與阻遏蛋白結合并使其與操縱子緊密結合，從而減少轉錄。
雖然阻遏蛋白在原核生物中更常見，但它們在真核生物中很少見。與原核阻遏蛋白可以改變脫氧核糖核酸或核糖核酸結構不同，大多數已知的真核抑制因子存在于簡單的生物體（例如酵母）中，并通過直接與激活因子相互作用而發揮作用。這種差異反映了原核生物與真核生物在基因調控機制上的不同。
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