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剪接體
來源:互聯網

剪接體(英文:spliceosome)定義:由核小核糖核酸(snRNA,U1、U2、U4、U5、U6等)和蛋白質因子(約100多種)動態(tài)組成、識別RNA前體的剪接位點并催化剪接反應的核糖核蛋白復合體。只與SMT蛋白理解與糖性一致。

簡介

它是在剪接過程的各個階段隨著snRNA的加入而形成的。也就是說在完整的pre-mRNA上形成的一個剪接中間體。剪接體本身需要一些小核RNA參與。這些小核RNA不會翻譯出任何蛋白,但對于調控遺傳活動起到重要作用。

與核糖體

剪接體的裝配同核糖體的裝配相似。依靠核糖核酸-RNA、RNA-蛋白質、蛋白質-蛋白質等三方面的相互作用。可能比核糖體更復雜,要涉及snRNA的堿基配對,相互識別等。

由多個核蛋白聚集而成,具有識別mRNA前體的5'剪接位點、3'剪接位點和分支點的功能。

研究進展

完善分子生物學中心法則

為何這兩篇文章如此重要?

在分子生物學上,“中心法則”是描述細胞最基礎也最核心的生命活動基因表達的一套規(guī)律,于1957年由英國生物學家弗朗西斯·克里克提出,對中心法則各個環(huán)節(jié)中重要生物大分子的組成、結構和功能的研究從來都是生命科學家們追逐的前沿熱點。中心法則的發(fā)現與闡述伴隨著多個諾貝爾獎的產生。而20多年過去了,其中公認最艱難的部分就是核糖核酸剪接的清晰結構和復雜機理。

在所有真核生物中,基因表達分三步進行,分別由RNA聚合酶(RNA polymerase)、剪接體(Spliceosome)、和核糖體(Ribosome)執(zhí)行。首先,儲存在遺傳物質脫氧核糖核酸序列中的遺傳信息必須通過RNA聚合酶的作用轉變成前體信使RNA(precursor messenger RNA,簡稱pre-mRNA),這一步簡稱轉錄(transcription);其次,前體信使核糖核酸由多個內含子和外顯子間隔形成,必須通過剪接體的作用去除內含子、連接外顯子之后才能轉變?yōu)槌墒斓男攀筊NA,這一步簡稱 剪接(splicing);第三,成熟的信使RNA必須通過核糖體的作用轉變成蛋白質之后才能行使生命活動的各種功能。描述這一過程的規(guī)律被稱為生物學的中心法則,其在生命科學領域具有核心重要性。

其中,RNA聚合酶和核糖體的結構解析曾分別獲得2006年和2009年的諾貝爾化學獎。而剪接體是一個巨大而又復雜的動態(tài)分子機器,其結構解析的難度被普遍認為高于核糖核酸聚合酶和核糖體,是世界結構生物學公認的兩大難題之一。

施一公告訴《賽先生》:“我們的工作揭示了基因剪接的結構基礎,可以把大部分生化數據連在一起,能夠很好地解釋過去的數據,也可以預測將來的實驗結果,但未來還要繼續(xù)推進這一項基礎研究工作,得到一系列的結構之后才能把中心法則的基因剪接全過程描述清楚。”

從施一公研究組發(fā)表的這兩篇論文可以看出,他們解析的基因剪接體是好幾個主要剪接體的共有結構。施一公表示,下一步的工作重點是把不同剪接體相互間不同的地方看清楚,從而闡述內含子被去除,外顯子被接在一起的分子機制。

一直以來,對剪接體的結構解析是分子生物學里最熱門的研究之一。其中最有力的競爭者是劍橋大學分子生物學實驗室的日裔學者Kiyoshi Nagai博士,此前該領域近一半的工作都與他有關。而他所在的實驗室也是現代結構生物學和分子生物學的奠基之處,這里曾走出14名諾貝爾獎得主。

6月24日,Nagai研究組的一篇論文于《自然》網站在線發(fā)表,其工作將剪接體所涉及的一個中心復合物tri-snRNP的分辨率提高到了5.9個埃米,一度引起轟動。而此前人類對基因剪接體的認識精度只有29個埃米。1埃米為10^(-10)m,即把1米分成十億份,其之微小可以想見,因此Nagai的最新工作被稱為近原子尺度的結構研究。

而施一公團隊此次得到的結果不僅將精度由5.9個埃米提高到了3.6個埃米,而且其解析對象是真正的剪接體,而不是Nagai團隊所取得的參與剪接體組裝過程的復合物,從而第一次在近原子分辨率上看到了剪接體的細節(jié)。

長久以來,剪接體的結構解析一直被認為是最值得期待的結構生物學研究。因為許多人類疾病都可以歸咎于基因的錯誤剪接或針對剪接體的調控錯誤。據知人類35%的遺傳紊亂是由于基因突變導致單個基因的可變剪接引起的。還有一些疾病的起因是剪接體蛋白的突變影響了許多轉錄本的剪接。還有一些癌癥也與剪接因子的錯誤調控有關。

但盡管如此,施一公強調說:“這是一個基礎研究層面的發(fā)現,和應用差距甚遠。現在我們還不想談應用,這會誤導大家。”

在施一公看來,這次獲得的剪接體的高分辨三維結構和分子作用機制是一項生命科學基礎研究的重大突破,但基礎研究工作還未完成,需要進一步細化。即便基礎研究做完了,也與治療遺傳疾病的實際應用有很大距離。“因為不能說根據我們的剪接體結構就能直接發(fā)現引致疾病發(fā)生和治療的方法。這項工作的核心意義是讓人類對生命過程和機理有了更進一步的了解。”施一公說。

注意問題

但是,他們沒有看到的也許比看到的更重要。盡管研究人員在試管中檢測剪接時看到了剪接體機器裝配自己的復雜過程,但是研究組研究生活細胞中的剪接體時發(fā)現剪接發(fā)生在機器形成之前。這與先前已經知道的細胞優(yōu)化它們的工作量的方式相一致。

學科

生物化學與分子生物學_基因表達與調控

來源

《生物化學與分子生物學名詞》(第二版)

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