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三域系統是由卡爾·烏斯(Carl Woese)在1977年提出的細胞生命形式分類，將原核生物分成了兩大類，起初稱為真細菌（Eu細菌界）和古菌（Archaebacteria）。Woese依據16S rRNA序列上的差別，認為這兩類生物和真核生物一起從一個具有原始遺傳機制的共同祖先分別演化而來，因此將三者各置為一個“域”（Domain），作為比“界”高一級的分類系統，并分別命名為細菌域（細菌界）、古菌（古菌）和真核生物（Eukarya）。
然而，rRNA樹有可能將演化太快的類群放錯位置（比如微孢子蟲）。有人認為生物的根應該在真細菌之內，很多真細菌的類群在古菌之前分支出來，很晚古細菌和真核生物才彼此分開。
簡介
Woese依據16S rRNA序列上的差別﹐認為這兩組生物和真核生物從一個具有原始遺傳機制的共同祖先分別進化而來﹐因此將三者各劃為一類﹐作為比界高的分類系統，稱作“域”(Domain)或者“總界”(Superkingdom)。1990年，Carl Woese為了避免把古細菌也看作是細菌的一類，又把 三域目前這三域改稱為細菌(細菌界)﹑古菌(古菌)和真核生物(Eukarya)。
然而﹐核糖核酸樹有可能將進化太快的類群放錯位置(比如微孢子蟲)。有人認為生物的根應該在真細菌之內﹐很多真細菌的類群在古菌之前分支出來﹐很晚古細菌和真核生物才彼此分開。
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