本寺創于唐朝元和十五年（820年），初名凈慧禪寺，又名玉泉山，清晚期又稱凈慧講寺，因地處舊屬五十一都（今浙江省文成縣大峃鎮垟樹村）第七甲玉泉山，觀者堪稱其地盡得江山佳氣，譽為九龍法界，寺域匯聚甲山、甲水、甲史、甲佛、甲殿、甲僧、甲鐘七甲勝景，故俗稱七甲寺。
規模
七甲寺原建規模宏大，分圣門、金剛殿、大雄寶殿、三圣殿四幢，邊有僧房六十余間，占地7000平方米，屬漸南罕見名山古剎，據寺內遺存碑銘記載，該寺曾經三廢四興，歷盡滄桑，唐代李純元和庚子十五年（820年），由施照和尚募緣創建，唐廣明庚子元年（880年）因兵亂而焚毀，不久閩僧石屋游此，觀其圣跡非凡，于唐乾寧間繼在此重建僧院，宋朝端拱乙丑二年（989年）復建大殿，大中祥符戌申元年（1008年），修整圣門。元末復遭遣亂而毀壞。明宣德年間復建，正德辛未六年（1511年）當山住持法林徒弟能全、能亮募緣修建，延到清代乾隆癸已三十八年（1773年），相傳佛因法現身，見紛至募緣重建金剛殿，愛新覺羅·颙琰八年，大學巡檢司官孟裕視其殿宇破損，於癸亥年（1803年）再度修建，光緒三十三年（1907年）諦閑法師主持修葺[qì]，但至十年內亂的1972年間，殿宇全遭拆毀，遺址辟之為田。
近代發展
中國共產黨十一屆三中全會后，政通人和，普天咸呈瑞兆，1984年，天臺正宗第四十六世住持僧釋了識，倡持募緣復建三圣殿，1985年春，邑里眾舉周大森等為首事，釋了識偕周日夜操勞，僑屬胡克勝、華僑胡從庫等解囊資助，十方百姓紛紛募資和投工獻料，共攢資十余萬元，同年十二月之朔告成大雄寶殿，大殿為木構重檐歇山造，高14.8米，面寬七開間，計24米，進深十三檁[lǐn]七柱，計15米，寶殿中，奉本師釋迦牟尼，高9米多，兩側塑十八羅漢，正殿影壁，塑童子參觀音為主尊的“八十四”堆山，計有一百一十七尊，鑒于匠者與有識之士博采歷代寺觀營建法式之精魂，復建大殿益顯壯觀宏偉。
1987年12月，縣人民政府以文政字（87）第174號文件公布七甲寺為縣級文物保護單位，規定原殿址重點保護區7000平方米等，受《中華人民共和國文物保護法》保護。
現今住持七甲寺上達下照法師，現任普陀山海島佛學院講師及研究生導師、浙江溫州市妙果寺住持、浙江文成縣佛教協會會長，法師從事天臺縣、凈土、禪宗（特別是“永嘉縣禪”）、密法的修學和研究，發表多篇專著。
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