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核糖開關
來源:互聯網

核糖開關(riboswitches)是位于信使核糖核酸(mRNA)上的一些非編碼區序列,它們能夠折疊成特定的構象,并通過這些構象的改變應答于體內的一些代謝分子,從而調節mRNA轉錄。核糖開關通過改變二級結構或高級結構來改變其與下游信使RNA的相互作用狀態,進而調控信使RNA所編碼基因的功能。這種調控機制主要存在于真細菌類生物體中,但也在植物或真菌中有所發現。

結構

核糖開關主要由兩部分組成,分別是感受外界配體的適體域(aptamer 蛋白質結構域 AD)和調控基因表達的結構域-表達平臺(expression platform EP)。適體域與特定的配體特異性結合,引起適體域構象的變化,這種變化進而影響到表達平臺的構象,從而調控基因的表達。

調控機制

核糖開關的調控機制可以在轉錄水平和翻譯水平發揮作用:

1. 轉錄水平的調控:主要是通過控制終止子和抗終止子的形成來調控基因的表達。

2. 翻譯水平的調控:通過控制剪力功能來影響mRNA的翻譯過程。

分布

雖然核糖開關的調控機制在真細菌中最為常見,但研究也發現了少數核糖開關存在于植物或真菌中。這表明核糖開關作為一種基因表達調控元件,在不同生物體中具有廣泛的適應性和進化意義。

特征

核糖開關并非總是作為單個調控單位發揮功能,有時整個核糖開關或者兩個傳感結構域會彼此相鄰排列。例如,很多甘氨酸核糖開關由兩個甘氨酸傳感器組成,兩者為一端短小的連接臂隔開,而且還能與第三者相互作用。此外,具有不同特征的核糖開關串聯在一起的意義是很明顯的:僅當兩種適配性化合物同時共存于一個細胞中時,這種串聯型核糖開關才會調節基因的表達,因此屬于一種雙輸入的邏輯門控開關。

參考資料 >

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