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多肽合成
來源:互聯(lián)網(wǎng)

多肽合成是一個重復添加氨基酸的過程,合成方向從C端(羧基端)向N端(氨基端)進行;從1963年Merrifield發(fā)展成功了固相多肽合成方法以來,現(xiàn)在大多采用固相合成,從而大大的降低了每步產(chǎn)品提純的難度;為了防止副反應的發(fā)生,合成柱和添加的氨基酸的側(cè)鏈都是預先被保護,只有羧基端處于游離,并且在反應之前必須先用化學試劑活化它。固相合成方法有兩種,即Fmoc和tBoc,由于Fmoc比tBoc存在很多優(yōu)勢,現(xiàn)在大多采用Fmoc法合成,但對于某些短肽,tBoc因其產(chǎn)率高的優(yōu)勢仍然被很多企業(yè)所采用;多肽合成的過程需要操作人員直觀監(jiān)測,同時合成后可進行在線切割(切割試劑TFA的強腐蝕性對反應器材質(zhì)有了極大限制),這些要求限制反應器以玻璃材質(zhì)最為適用。具有特定順序的合成多肽,不能采用任意聚合的方法,只能采用逐步縮合的定向多肽合成方法,先將不需要反應的氨基或羧基用適當?shù)幕鶊F暫時保護起來,然后再進行連接反應,以保證多肽合成的定向進行。

多肽的定義

多肽是一種與生物體內(nèi)各種細胞功能都相關(guān)的生物活性物質(zhì),它的分子結(jié)構(gòu)介于氨基酸和蛋白質(zhì)之間,是由多種氨基酸按照一定的排列順序通過肽鍵結(jié)合而成的化合物。多肽是涉及生物體內(nèi)各種細胞功能的生物活性物質(zhì)的總稱,常常被應用于功能分析、抗體研究、尤其是藥物研發(fā)等領(lǐng)域。

多肽合成技術(shù)

1963年,Merrifield首次提出了固相多肽合成方法(SPPS),由于其合成方便,迅速,成為多肽合成的首選方法,而且?guī)砹硕嚯挠袡C合成上的一次革命,并成為了一支獨立的學科——固相有機合成,固相合成的發(fā)明同時促進了肽合成的自動化。世界上第一臺真正意義上的多肽合成儀出現(xiàn)在1980年代初期。

液相合成

基于將單個N-α保護氨基酸反復加到生長的氨基成份上,合成一步步地進行,通常從合成鏈的C端氨基酸開始,接著的單個氨基酸的連接通過用DCC,混合炭酐,或N-carboxy酐方法實現(xiàn)。Carbodiimide方法包括用DCC做連接劑連接N-和C-保護氨基酸。重要的是,這種連接試劑促接N保護氨基酸自己炭基和C保護氨基酸自由氨基間的縮水,形成肽鏈,同時產(chǎn)出N,N?/FONT>-dyaylcohercylurea副產(chǎn)物。然而,此方法因其導致消旋的副反應,或在強堿存在時形成5(4H)-oxaylones和N-acylurea而受到影響。慶幸地是,這些副反應能最小化,但是還不能完全消除。方法是加入象HoSu或HoBT這樣的連接催化劑,此外,此方法也可用于合成N保護氨基酸的活性衍生物。依次產(chǎn)生的活性酯將自發(fā)與任何別的C保護氨基酸或肽反應形成新的肽

多肽合成儀的種類

多肽合成儀是指用來合成多肽的儀器,因為多肽合成的步驟很繁瑣,又很耗時,多家公司開發(fā)了自動多肽合成儀。一般分為兩類,一類是針對數(shù)量少但合成量大的生產(chǎn)型應用,典型代表是美國ABI公司的ABI336型多肽合成儀,其反應器轉(zhuǎn)動方式有別于前兩代的多肽合成儀,即反應器上方相對固定,而下方作圓周360度快速旋轉(zhuǎn),帶動反應器里的固液兩相從底部向上作螺旋運動,一直達到反應器的最上方;另外一類多肽合成儀針對于藥物研發(fā)、基因研究等科研性應用,典型代表是德國Intavis AG公司的ResPep SL和MultiPep RS系列,可以同時提供固相合成和膜合成的應用,并能自動幫助客戶進行圖譜篩選同時完成高通量的多肽合成工作。

多肽合成儀的分類

多肽合成儀的問世大大促進了多肽科學的發(fā)展。反過來,隨著多肽科學的發(fā)展,科學家也對合成儀提出了更高的要求,從而帶動了合成儀的發(fā)展。目前多肽合成儀品種繁多,從合成量上分,可分為微克級的,毫克級的,克級的和公斤級的;從功能上分,可分為研究型的,小試型的,中試型的,普通生產(chǎn)型的和GMP生產(chǎn)型的;從自動化程度上分,可分為全自動的,半自動步槍的和手動的;從通道上分,可分為單通道的和多通道的;從技術(shù)角度上分,可分為第一代的,第二代的,和第三代的;等等。

第一代多肽合成儀 ]第一代多肽合成儀產(chǎn)生時間為上世紀六十年代末至七十年代初。b]代表產(chǎn)品是Beckman公司推出的Beckman 990 Peptide Synthesizer和Vega’s Biotechnologies公司推出的Vega’s 296 Peptide Synthesizer。如今該兩家公司均以放棄了多肽合成儀的研發(fā)與生產(chǎn),我們只能在早期的學術(shù)文獻中找到其設計原理與研究情況。雖然隨著生產(chǎn)工藝的改進和發(fā)展,第一代多肽合成儀已全部退出了市場。但1990年以前的眾多肽化學文獻都是在此實驗設備上運行研發(fā)而來,第一代的多肽合成儀為之后的合成儀研發(fā)與制造產(chǎn)生了重大意義。第二代多肽合成儀 ]第二代多肽合成儀誕生在上世紀八十年代。b]代表產(chǎn)品是Protein Technologies公司推出的PS3 Peptide Synthesizer以及Advanced ChemTech公司推出的ACT peptide synthesizer Model 90。標志性特點是溫和反應法合成多肽,一般可分為單純氮氣鼓泡和搖動式兩種。PS3 的設計原理是采用氮氣鼓泡的反應方式來對反應物進行攪拌,即合成儀上反應器是固定的,氮氣從反應器的下方通過反應器到上部排出,在這一過程中產(chǎn)生的汽泡把固相和液相混合起來。這樣設計的好處是結(jié)構(gòu)簡單,成本低,但反應相對溫和:1)有時候多肽-固相載體在靜電作用下會“抱團”,使其不能與液相充分混合,在這種情況下需要調(diào)高氮氣的壓力以消除靜電作用;而在靜電作用消除后要把壓力立刻調(diào)低,不然的話較高的壓力會把多肽固相載體“吹”到反應器液面上方。由于多肽-固相載體具有較強的粘壁性,一旦被粘到反應器液面上方就再也無法下來,也就是無法再參加反應。顯然第一代機器是無法自動作這樣的壓力調(diào)整的,這就是造成反應“死角”的重要原因。反應死角會降低多肽合成的效率和多肽的純度,有的甚至造成合成的失敗。2)長時間氮氣鼓泡會使溶液揮發(fā),液面降低后一部分多肽-固相載體就粘在液面上方,也無法再參加反應。3)氮氣消耗量大,運行成本增大。ACT90的設計原理是反應器在直立下圍繞原點作左右擺動,或者圓周運動。ACT的多肽合成儀同樣具有反應溫和的特點,即轉(zhuǎn)動角度與速度都不能夠完全達到氨基酸耦合的極限,反應往往需要更長的時間。第三代多肽合成儀 ]第三代多肽合成儀誕生在上世紀九十年代b] ]代表產(chǎn)品是美國b]Applied Biosystems公司的ABI 433 peptide synthesizer 、C S Bio公司的CS336無死角多肽合成儀和Peptide Scientific Inc公司生產(chǎn)的全系列180-270度度機械攪拌多肽合成儀。。ABI433的設計原理是反應器上方相對固定,而下方作圓周360度快速旋轉(zhuǎn),帶動反應器里的固液兩相從底部向上作螺旋運動,一直達到反應器的最上方。換句話說,溶液可以達到反應器內(nèi)部的任意點,真正做到了無死角。由于攪拌速率可達每分鐘1800轉(zhuǎn)的高速,反應得以充分完全。由于無死角的攪拌方式保證的肽的合成純度,ABI433型多肽合成儀(其退出多肽合成儀市場后最后一款儀器)至今在世界上還占有著很大的比例。當然,ABI產(chǎn)品的售價也是最高的。由于部件使用頻率高,電磁閥會經(jīng)常損壞,而ABI將7個電磁閥做成模塊化的設計,壞掉一個電磁閥必須要更換整個模塊,無形中增加了維修成本。 CS336的設計原理是反應器中點為圓心,上下做180度旋轉(zhuǎn)攪拌,攪拌速度可達180rpm,同時其采用了氮氣鼓泡反應方式的優(yōu)越性,將氮氣吹動作為可選反應方式融入反應方法中,多肽合成儀在科研領(lǐng)域的高耦合率效果得到充分體現(xiàn)。第四代多肽合成儀由于180度無死角的攪拌模式得到了越來越多的客戶的認可,Peptide Scientific Inc公司從2002年開始將180度上下翻轉(zhuǎn)的機械無極調(diào)速攪拌模式作為其開發(fā)的全系列產(chǎn)品的標志性特征,從PSI200、300、400、500到600全系列多肽合成儀均采用180-270度上下翻轉(zhuǎn)的機械攪拌模式,PSI采用了數(shù)控馬達系統(tǒng),攪拌速度無極可調(diào),攪拌強度和速度在物理能量上發(fā)揮到了極致。第五代多肽合成儀美國CEM公司以蛋白質(zhì)有機反應設備的制造著稱,推出了微波多肽合成儀Liberty。其采用微波加熱方式,大大提高了反應速度,將反應的速率增加到之前多肽合成儀的幾倍甚至十幾倍。其與生俱來的特點得到了很多研發(fā)型客戶的認可。藥物篩選型多肽合成儀如ACT公司推出的106通道異步全自動多肽合成儀、AAPPTEC公司推出的96通道全自動多肽合成儀、PTI公司推出的98通道全自動多肽合成儀等。

運行原理

多肽合成儀以固相合成為反應原理,在密閉的防爆玻璃反應器中使氨基酸按照已知順序(序列,一般從C端-羧基端 向 N端-氨基端)不斷添加、反應、合成,操作最終得到多肽載體。固相合成法,大大的減輕了每步產(chǎn)品提純的難度。為了防止副反應的發(fā)生,參加反應的氨基酸的側(cè)鏈都是保護的。羧基端是游離的,并且在反應之前必須活化。固相合成方法有兩種,即Fmoc和tBoc。由于Fmoc比tBoc存在很多優(yōu)勢,現(xiàn)在大多采用Fmoc法合成,但對于某些短肽,tBoc因其產(chǎn)率高的優(yōu)勢仍然被很多企業(yè)所采用。

具體合成由下列幾個循環(huán)組成:

1)去保護:Fmoc保護的柱子和單體必須用一種堿性溶劑哌啶)去 除氨基的保護基團。

2)激活和交聯(lián):下一個氨基酸的羧基被一種活化劑所活化。活化的單體與游離的氨基反應交聯(lián),形成肽鍵。在此步驟使用大量的超濃度試劑驅(qū)使反應完成。循環(huán):這兩步反應反復循環(huán)直到合成完成。

3)洗脫和脫保護:多肽從柱上洗脫下來,其保護基團被一種脫保護劑(TFA)洗脫和脫保護。

基本元件

反應器

數(shù)百年來,制藥業(yè)的反應器/反應釜 設備以玻璃材質(zhì)最為常見,因其完全透明且耐腐蝕,而被眾多化學、生物學專家沿用。多肽合成的過程需要操作人員直觀監(jiān)測,同時合成后可進行在線切割(切割試劑TFA的強腐蝕性對反應器材質(zhì)有了極大限制),這些要求限制反應器以玻璃材質(zhì)最為適用。

玻璃材質(zhì)的反應器在制造工藝上有極大的難度限制:①燒制工藝:磨口精度要求極高,正如很多國產(chǎn)設備都無法達到要求出現(xiàn)漏液漏氣現(xiàn)象,玻璃壁均勻程度等。②配合攪拌柄以及密封裝置的成套加工工藝③防爆處理

氨基酸儲罐

溶劑儲罐

量筒

轉(zhuǎn)液瓶

感應器

多端觸發(fā)器自感應定量量取法,直觀、科學、相對誤差最低。

廢液桶

廢液桶通常選擇容積較大的聚乙烯桶,保證通風良好,同時需安裝感應器裝置時刻檢測廢液情況,避免溢出。

控制配件

電磁閥

多肽合成儀中的電磁閥屬于敏感配件,其控制液路的串聯(lián)與閉路,在氨基酸轉(zhuǎn)移與量取,溶劑轉(zhuǎn)移與量取兩步驟中起到至關(guān)重要的作用。不同品牌的合成儀對電磁閥的設計與排布也略有不同。

控制面板

控制面板內(nèi)往往含有光敏組建,部分控制電磁閥以及感應器控制組。與電腦主機的控制系統(tǒng)、合成儀統(tǒng)一的鏈接在一起,完成多肽合成的全過程。

軟件系統(tǒng)

多肽合成儀的操作軟件。不同品牌合成儀所注冊的軟件也不同。

檢測方法

UV Monitor

在多肽合成儀中,在線檢測耦合效果的裝置,如UV Monitor往往是選配裝置,客戶可根據(jù)實驗的需要選購。其功能是讓操作者直觀的看到多肽合成的每一部氨基酸偶聯(lián)效果,從而針對特定的序列做合成設置的調(diào)整,最終達到最佳合成效果。

對于不熟悉多肽合成儀操作的用戶來說,UV Monitor是相當重要的。

試劑檢測:沒有選購在線檢測附件的多肽合成儀用戶,也可以采用試劑檢測方法做基本的耦合效果測定實驗。

固相多肽合成中,主要是通過檢測樹脂上游離氨基來判斷連接效率,檢測方法稱為Kaiser方法,其檢測結(jié)果,如果有游離氨基的時候,顯示藍色,或紅褐色(pro,ser,His)。

Kaiser試劑包括:A,6%茚三酮乙醇溶液;B,80%苯酚的乙醇溶液;C,2% 0.001M 氰化鉀吡啶溶液。

配制中的吡需要經(jīng)過三處理后,重蒸后再使用。檢測過程,取少量樹脂,加入A,B,C各2-3滴,100℃下加熱1-2min,如果溶液有蘭色,或樹脂出現(xiàn)蘭色,紅褐色,表明還有游離氨基,否則說明連接完全。

其它檢測游離氨基的方法:三硝基苯磺酸法,三硝基苯酚法,溴芬蘭法等。

參考資料 >

多肽合成的工作原理.安諾倫(北京)生物科技有限公司.2024-04-02

關(guān)于多肽合成.微信公眾平臺.2024-04-02

多肽合成方法(不銹鋼分子蒸餾儀).百家號.2024-04-02

多肽合成的基本原理.tianjibio.com.2024-04-02

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