重復(fù)序列(repeated sequence): 基因序列的多拷貝。自然狀態(tài)下,重復(fù)序列并不發(fā)生失活現(xiàn)象,基因工程中轉(zhuǎn)基因失活與多拷貝有關(guān),它可串聯(lián)排列在染色體同一位點,也可以分散在都能造成轉(zhuǎn)基因失活。可能是重復(fù)序列之間通過異位配對形成染色體構(gòu)型的不同染色體位置,變化,使重復(fù)序列位點染色體發(fā)生收縮(是染色質(zhì)化),從空間上阻礙了轉(zhuǎn)錄因子與轉(zhuǎn)基因的接觸,使基因處于關(guān)閉狀態(tài)。
真核生物的基因組相當(dāng)于基因的一 般只有一個復(fù)制脫氧核糖核酸序列(也稱單一DNA,unique sequence,single copy sequence,nonrepetitive sequence等)和具有多數(shù)反復(fù)存在的DNA順序組成。
簡介
稱后者為重復(fù)順序。組成基因組的DNA順序,根據(jù)其重復(fù)的頻度可分為三類。一是基因組只有一個復(fù)制順序的單一DNA,二為高度重復(fù)順序(highly repetitivesequence),由較短的順序105—107次直線連結(jié)而成,其中含隨體DNA等。第三為中等程度的重復(fù)順序(moderately repetitive sequence),為有300—500個核對的大致相同的順序——例如在將哺乳綱的脫氧核糖核酸用限制酶AluI(AG↓CT)切斷時所產(chǎn)主的主要片斷中所見到的高頻率(105)的順序(AluIfamily)——與單一DNA一起分散存在的,以及像核糖體核糖核酸基因或組蛋白基因群那樣的多次成直線相連存在的(多基因群)都包含在這一類中。此外有在反方向上重復(fù)的順序(inverted repetitive seq-uence),其變性DNA折疊成發(fā)夾結(jié)構(gòu)(hairpinstructure,foldback structure,snapback stru-cture),在編碼分析中可迅速再結(jié)合的類型。
染色體上存在的大量無轉(zhuǎn)錄活性的重復(fù)脫氧核糖核酸序列。其組織形式有兩種:串聯(lián)重復(fù)序列;分散重復(fù)序列。前一種成簇存在于染色體的特定區(qū)域,后一種分散于染色體的各位點上。
類型
高度重復(fù)序列
重復(fù)幾百到幾百萬次,一般是少于10個核苷酸殘基組成的短片段。如異染色質(zhì)上的衛(wèi)星DNA。它們是不翻譯的片段。在小鼠中約占基因組的10%
中度重復(fù)序列
重復(fù)次數(shù)為十次到幾百次。在小鼠中約占20%。如rRNA基因、轉(zhuǎn)運RNA基因和某些蛋白質(zhì)(如組蛋白、肌動蛋白、角蛋白等)的基因。
單拷貝序列
就是在整個基因組中獨有的一段序列,沒有與它相似的重復(fù)片段。它占到哺乳綱核酸含量的50%~60%。
輕度重復(fù)序列
是指重復(fù)2~10次的一些序列,例如tRNA基因和一些組蛋白基因;
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