多位點(diǎn)序列分型(multilocus sequence typing,MLST)是一種基于核酸序列測(cè)定的細(xì)菌分型方法。這種方法通過PCR擴(kuò)增多個(gè)管家基因內(nèi)部片段并測(cè)定其序列,分析菌株的變異。MLST操作簡單,結(jié)果能快速得到并且便于不同實(shí)驗(yàn)室的比較,已經(jīng)用于多種細(xì)菌的流行病學(xué)監(jiān)測(cè)和進(jìn)化研究。隨著測(cè)序速度的加快和成本的降低,以及分析軟件的發(fā)展,MLST逐漸成為細(xì)菌的常規(guī)分型方法。
基本介紹
多位點(diǎn)序列分型(Multilocus sequence typing,MLST)是近年來發(fā)展很快的分子生物學(xué)分析方法,具有很高的分辨能力,既適于分子流行病學(xué)研究,也可用于分子進(jìn)化學(xué)的研究。通過分析多個(gè)管家基因(Housekeeping gene)450bp左右的核心片段的核酸序列,從而對(duì)菌株的等位基因進(jìn)行多樣性的比較,不同的菌株對(duì)應(yīng)不同的序列型(Sequence type).所以MLST越來越多的被作為能進(jìn)行國際間菌株比較的常用工具,建立一種更為準(zhǔn)確的分型系統(tǒng)方法。并且應(yīng)用于研究出現(xiàn)的不同的抗生素抵抗株,毒力或抗原的相關(guān)特殊基因型,及新的變異株引起的疾病流行等流行病學(xué)分析,進(jìn)行生物進(jìn)化和種群結(jié)構(gòu)的研究。
參考資料 >