1949年5月20日在咸陽(yáng)縣（今咸陽(yáng)市）成立，機(jī)關(guān)設(shè)司令部、政治部、供給部、衛(wèi)生部，轄長(zhǎng)安區(qū)、咸陽(yáng)、盩厔縣（今周至縣）、鄂縣（今鄠邑區(qū)）、興平市、武功等6個(gè)縣游擊隊(duì)，隸屬于西北軍區(qū)。6月，第一野戰(zhàn)軍第十八、十九兵團(tuán)會(huì)師咸陽(yáng)，擊潰國(guó)民革命軍一部，將收編的6000余人與軍分區(qū)各縣游擊隊(duì)合并為6個(gè)支隊(duì)，
歷史發(fā)展
1949年11月，將第一、第五支隊(duì)改編為獨(dú)立第七團(tuán)，將第六支隊(duì)改編為獨(dú)立第八團(tuán)，將第二、第三、第四支隊(duì)改編為獨(dú)立第九團(tuán)。
1949年12月，軍分區(qū)隸屬于陜西軍區(qū)。
1950年4月19日，三原軍分區(qū)撤銷后合并于咸陽(yáng)軍分區(qū)。7月，三原軍分區(qū)原轄的獨(dú)立第二團(tuán)與咸陽(yáng)軍分區(qū)獨(dú)立第八團(tuán)合編為陜西軍區(qū)獨(dú)立第六團(tuán)；咸陽(yáng)軍分區(qū)獨(dú)立第七、第九團(tuán)合編為陜西軍區(qū)獨(dú)立第七團(tuán)，歸咸陽(yáng)軍分區(qū)建制。此時(shí)，軍分區(qū)轄咸陽(yáng)市、興平市、盩厔縣、鄂縣、涇陽(yáng)縣、三原縣、高陵區(qū)、淳化、枸邑（今旬邑縣）、禮泉縣（今禮泉）、銅川市、耀州區(qū)、富平等13個(gè)縣武裝科。
1951年6月，獨(dú)立第七團(tuán)編入志愿軍運(yùn)輸團(tuán)參加抗美援朝戰(zhàn)爭(zhēng)。
1952年7月軍分區(qū)撤銷司、政、后各部，機(jī)關(guān)編設(shè)7個(gè)科。
1953年2月，由于行政區(qū)劃的變更，咸陽(yáng)軍分區(qū)撤銷。原所轄之咸陽(yáng)市、咸陽(yáng)縣、鄂縣、銅川縣人民武裝部由陜西省軍區(qū)直接領(lǐng)導(dǎo)；涇陽(yáng)、三原、高陵、耀縣、富平5個(gè)縣人民武裝部交歸渭南軍分區(qū)；枸邑、淳化、盩厔、興平、醴泉5個(gè)縣人民武裝部交歸寶雞軍分區(qū)。
1961年9月13日，咸陽(yáng)軍分區(qū)重新組建，隸屬于陜西省軍區(qū)。機(jī)關(guān)設(shè)司令部、政治部，另編兩個(gè)科。原西安市人武部所轄咸陽(yáng)市、戶縣人武部，渭南軍分區(qū)所轄三原縣、高陵區(qū)、涇陽(yáng)縣人民武裝部，寶雞軍分區(qū)所轄旬邑縣、彬州市、長(zhǎng)武縣、永壽縣、乾縣、淳化、禮泉縣、周至縣、興平共14個(gè)縣（市）人民武裝部劃歸咸陽(yáng)軍分區(qū)。
1966年7月，專、縣公安大隊(duì)、公安隊(duì)分別編入軍分區(qū)和縣（市）人民武裝部。
1971年1月軍分區(qū)后勤處改為后勤部。12月，將1966年7月劃歸西安軍分區(qū)管轄的咸陽(yáng)市人民武裝部又劃歸咸陽(yáng)軍分區(qū)。
1976年代管陜西省軍區(qū)獨(dú)立第一團(tuán)。
1981年，機(jī)關(guān)撤銷科的編制。
1982年，獨(dú)立第一團(tuán)移交武警陜西省總隊(duì)。
1982年3月，又恢復(fù)了科的編制。
1983年11月，隨著行政區(qū)劃變動(dòng)，將周至縣、鄠邑區(qū)、高陵區(qū)3個(gè)縣人民武裝部交歸西安軍分區(qū)，由寶雞軍分區(qū)管轄的武功縣、楊陵區(qū)人民武裝部劃歸咸陽(yáng)軍分區(qū)。同時(shí)，撤銷了咸陽(yáng)市人民武裝部，成立秦都區(qū)人民武裝部。
1985年9月，機(jī)關(guān)只編司令部、政治部、后勤部，不設(shè)科。
1986年6月，根據(jù)中共中央、國(guó)務(wù)院、中央軍委《關(guān)于縣（市）人武部改歸地方建制有關(guān)問題的通知》，將所轄興平市、武功、涇陽(yáng)縣、三原縣、淳化、旬邑縣、禮泉縣、乾縣、永壽縣、彬州市、長(zhǎng)武縣等11個(gè)縣和秦都、楊陵2個(gè)區(qū)共13個(gè)人民武裝部交歸地方建制。
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