教宗本尼狄克二世（拉丁語：Sanctus Benedictus PP. II，？～685年5月8日）是意大利籍教皇，于684年6月26日至685年5月8日在位。他在683年被選為教皇，但是直到次年6月才獲得拜占庭皇帝君士坦丁四世的批準即位。
本尼狄克二世在任期間，曾要求君士坦丁一世發出通令以宣布教皇即位無須通過皇帝批準，但此項制度后來仍然存在。他堅持前任教皇圣阿加托的指示，同意圣威爾弗里德重任英格蘭約克總主教，并在任期內恢復了羅馬教會的多處設施。
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