在分子生物學中，開放閱讀框(Open Reading Frame, ORF)從起始密碼子開始，是脫氧核糖核酸序列中具有編碼蛋白質潛能，結束于終止密碼子連續的堿基序列。
由于密碼子（codon）讀寫起始位點的不同，DNA序列可能按六種ORF閱讀和翻譯（每條鏈三種，對應三種不同的起始位點）。ORF識別則是確定哪種開放閱讀框對應真正的多肽編碼序列的過程。
在真核生物中，ORF可能跨過外顯子，在mRNA中進行拼接。基因中的ORF包含并位于開始編碼與終止編碼之間，由于一段DNA或核糖核酸序列有多種不同讀取方式，因此可能同時存在許多不同的開放閱讀框架。
詞語釋義
開放閱讀框[open reading frame，ORF] 是結構基因的正常核苷酸序列，從起始密碼子到終止密碼子的閱讀框可編碼完整的多肽鏈，其間不存在使翻譯中斷的終止密碼子。
在mRNA序列中，每三個連續堿基(即三聯“密碼子”）編碼相應的氨基酸。其中有一個起始密碼子AUG和三個終止密碼子UAA，UAG，UGA。核糖體從起始密碼子開始翻譯，沿著mRNA序列合成多肽鏈并不斷延伸，遇到終止密碼子時，多肽鏈的延伸反應終止。由于讀寫位置不同，ORF在兩條鏈上具有六種可能性。
例子
以一段5'-UCUAAAGGUCCA-3'序列為例，此序列共有3種讀取法：
UCU AAA GGU CCA
CUA AAG GUC
UAA AGG UCC
由于UAA為終止密碼子，因此第三種讀取法不具編譯出蛋白質的潛力，故只有前兩者為開放閱讀框架。
軟件介紹
現在有很多找ORF的軟件，包括在線的，如：ORF Finder的功能ORF Finder被用來預測已存在的編碼區的小基因序列。它較早應于序列設計，應用優于長片斷、高質量的匹配。ORF Finder把提交序列分成六個亞區，并對這六個閱讀框分別進行默認，賦予每個亞區一個確定其編碼內容的度量，如果可能將對每一亞區進行進一步分析。每個亞區按照已有的分類結果，被隨機提交給查找它們是否編碼蛋白質的特定測試收集器。最后只有那些具有編碼潛能的重要區域才被報道。除此之外，ORF Finder也可用于大規模的開放式閱讀框尋找，支持對整個基因組的分析。
參考資料 >