真菌霉素（mycotoxins）是由真菌產生的有毒物質。
對人和動物有毒的包括 黃曲霉毒素，毒傘膚，麥角堿，蠅毒堿，毒膚和紅毒素 (ruhratoxinsy。對植物有毒}1}括格鏈飽酸，萎蔫酸 (5~丁基咄吮-Z-甲酸)和維多利長蠕抱毒素。
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