喬瓦尼·波吉亞是羅馬教皇亞歷山大六世與情婦瓦諾莎·卡塔內的私生子，也是切薩雷、盧克雷齊婭和喬佛里的兄弟。他于1476年出生，繼承了甘迪亞公爵的名號與領土，以及塞薩公爵、那不勒斯治安官、圣彼得總督等稱號。然而，他的生命卻在1497年6月14日結束，被人謀殺。至今仍不清楚兇手是誰，但當時許多人指責他的兄弟凱撒·波吉亞。
簡介
喬瓦尼，又稱胡安（Juan）或瓊（Joan），他是亞歷山大六世與情婦瓦諾莎·卡塔內（Vannozza dei Cattanei，1442-1518）的四個孩子中的第二個孩子。目前還不清楚喬瓦尼是出生在1474年還是1476年，他曾長期被認為是亞歷山大和瓦諾莎的長子。但現代歷史學家，基本贊同他最有可能在1476年出生，比他的兄弟凱撒·波吉亞年輕。
喬瓦尼·波吉亞可能出生在羅馬，當時羅德里戈·波吉亞（后來成為亞歷山大六世）還是紅衣主教，并且他的情婦瓦諾莎已經嫁給了多梅尼科·達·Rignano（Domenico da Rignano）。
1493年，他繼承了同父異母的哥哥路易吉·波吉亞（Pier Luigi de Borgia）的公國，并娶了路易吉的未婚妻，瑪麗亞·恩里克斯·德·盧納（Maria Enriquez de Luna），成為了第二任甘迪亞公爵，塞薩公爵（Duke of Sessa），那不勒斯（又稱為：拿波里）治安官，圣彼得的總督（Governor of St. Peter's）、行政長官和教會軍的統帥。
公爵謀殺案
1497年6月14日晚上，他被可怕地謀殺了，在后來成為羅馬猶太人區的德拉德卡廣場的附近。據推測，是他的兄弟凱撒·波吉亞謀殺了他，因為凱撒是他死后的最大獲益者；然而，也有另一種傳言，是他的弟弟杰弗里·波吉亞謀殺了他，因為喬瓦尼和杰弗里的妻子桑夏（Sancia）有著非同尋常的關系，導致兄弟公開敵對。
喬瓦尼的尸體被發現在臺伯河中，腰帶上的錢包中里有封不動的30個達科特金幣（golden ducats）。他的隨從也被殺害，所以并沒有目擊證人。
后代
喬瓦尼和瑪麗亞有兩個孩子：“胡安·德·Y·恩里克斯·博爾哈（Juan de Borja y Enriquez，即胡安·波吉亞），成為第三甘迪亞公爵；和弗朗西斯·德·赫蘇斯·博爾哈（Francisca de Jesus Borja），成為一個修女，在巴利亞多利德修道院。”這第二位胡安，是圣弗蘭西斯（Saint Francis）的父親。圣·波吉亞（Francis Borgia，1510–1572），其卓著功績被譽為繼耶穌會會祖羅耀拉·圣依納爵（Saint Ignatius of Loyola）之后的最偉大的會長，1671年被列入圣品，10月10日被定為他的紀念節日。
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