綠菌屬（Chlorobium）是光合細菌下的綠色硫細菌科的一屬細菌，生長于含硫化氫的淡水水體及泥中，黑河及港灣環境。該屬的模式種為泥生綠菌（棲泥綠菌）(Chlorobium limicola Nadson, 1906)。綠菌屬的細菌利用非循環電子傳遞鏈還原NAD+，并使用光合色素a的1型反應中心進行光合作用。綠菌屬的光合色素主要為菌綠素 a，而光合色素c、d或e則主要用于吸收光線的葉綠素體。綠菌屬的細菌以硫化氫為電子來源，以二氧化碳為碳源。綠菌屬的細菌在水體表面以下的嚴格厭氧條件下生存，通常在富營養湖泊的厭氧帶中發現。綠菌屬的細菌被認為在地球的大規模滅絕事件中起了重要作用。如果海洋變成缺氧狀態，綠菌屬的細菌將能夠超越其他光合生物。它們將產生大量的甲烷和硫化氫，導致全球變暖和酸雨。這將對其他海洋生物和陸地生物產生巨大的影響。在白堊紀大滅絕時期沉積物中發現的化石證據表明，綠菌屬的細菌數量豐富。綠菌屬的一種細菌Chlorobium aggregatum與一種無色的非光合細菌存在共生關系，這種細菌外觀像一束綠色的細菌，附著在一個可以用鞭毛移動的中央桿狀細胞上。外部的綠色細菌利用光線將硫化物氧化成硫酸鹽，而內部的細胞則將硫酸鹽還原成硫化物。這些細菌同時分裂，使結構呈現出高度不同尋常的多細胞外觀。
形態特征
圓形、卵形、直或彎曲的桿狀， 0.4～1.1 μm寬，0.4～3 μm長，有時更長。細胞連在一起成鏈球狀或絲狀；彎曲的菌株形成較長的螺旋狀。二分分裂繁殖，不運動。革蘭氏陰性。現有的種表現出兩種明顯不同的顏色：綠色(草綠色)或褐色(巧克力色)。這些顏色也可在亮視野顯微鏡下很容易地分辨開。含有很少量的細菌葉綠素a，以細菌葉綠素c、d或e作為主要的細菌葉綠素成分以及類群5，綠菌烯(chlorobactene)的類胡蘿卜素，這些色素都位于細胞質膜和載色體上，載色體位于細胞質膜的下面并與其連接。沒有氣泡。 G+C 摩爾%：49.0～58.1(Bd)。模式種：泥生綠菌(棲泥綠菌)(Chlorobium limicola)。
綠菌科(Chlorobiaceae) 中一屬細胞呈桿狀、卵狀或弧狀、不運動和不放氧光合的細菌。革蘭氏陰性。細胞長度為1.0～2.5μm。以二等分裂方式繁殖。本屬包括綠色種和褐色種兩類，前者如泥生綠菌(C.limicola)和 弧形綠菌(C. vibrioforme)，后者如 褐桿狀綠菌(C. phaeobacteroides)和 褐弧狀綠菌(C. phaeovibrioides)。在無氧并有硫化氫存在時進行光合作用。分子氫可作還原劑。反應產物元素硫可沉積于細胞外的培養基中。貯藏物僅為多磷酸鹽。綠色種類分布于無氧、含硫化氫的水體中，如溝、池、湖、河、溫泉、港灣和海水中，褐色種類出現在水體深層或湖底靜水層中。G+C mol%值為49～58。
系統發育
目前被接受的分類是基于《原核生物名稱及命名法》（LPSN）和國家生物技術信息中心（NCBI）的。綠菌屬的物種呈深綠色，在Winogradsky柱中，常觀察到的綠色層由綠菌組成，這是一個用于研究微生物生態和代謝的實驗裝置。綠菌聚集體是一種與無色、非光合細菌共生關系的物種，這種共生關系在細菌界中是極不尋常的。
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