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黃芩亞屬為黃芩屬的一個下級分類，為多年生或一年生草本，半灌木，稀至灌木，匍地上升或披散至直立，無香味。與黃芩屬其他植物比，該亞屬花萼上唇具盾片；小堅果背腹面不明顯分化，具瘤，無毛或被毛。
形態特征
黃芩亞屬植物的莖葉常具齒，或羽狀分裂或極全緣，苞葉與莖葉同形或向上成苞片。花腋生、對生或上部者有時互生，組成頂生或側生總狀或穗狀花序，有時遠離而不明顯成花序。花萼鐘形，背腹壓扁，分2唇，唇片短、寬、全緣、在果時閉合最終沿縫合線開裂達萼基部成為不等大兩裂片，上裂片脫落而下裂片宿存，有時兩裂片均不脫落或一同脫落，上裂片在背上有一圓形、內凹、鱗片狀的盾片或無盾片而明顯呈囊狀突起。冠筒伸出于萼筒，背面成弓曲或近直立，上方趨于喉部擴大，前方基部膝曲呈囊狀增大或成囊狀距，內無明顯毛環，冠檐2唇形，上唇直伸，盔狀，全緣或微凹，下唇中裂片寬而扁平，全緣或先端微凹，稀淺4裂，比上唇長或短，2側裂片有時開展，與上唇分離或靠合，稀與下唇靠合。
雄蕊4，二強，前對較長，均成對靠近延伸至上唇片之下，花絲無齒突，花藥成對靠近，后對花藥具2室，室分明且多少銳尖，前對花藥由于敗育而退化為一室，室明顯或不明顯，藥室裂口均具毛。花盤前方常呈指狀，后方延伸成直伸或彎曲柱狀子房柄。花柱先端錐尖，不相等2淺裂，后裂片甚短。小堅果扁球形或卵圓形，背腹面不明顯分化，具瘤，被毛或無毛，有時背腹面明顯分化，背面具瘤而腹面具刺狀突起或無，赤道面上有膜質的翅或無。
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