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國務院管理醫藥（不含中藥）的職能部門。1988年3月，國家經濟貿易委員會下設的國家醫藥管理局，調整為國務院直屬機構。國家醫藥管理局負責全國藥品（不含中藥材、中藥飲片、中成藥）、醫療器械以及制藥機械、醫藥包裝的行業管理。1993年國務院機構改革，國家醫藥管理局改為國家經濟貿易委員會管理的國家局，不再列入國務院機構序列。主要負責全國藥品（不含中藥材、中藥飲片、中成藥）、醫療器械、制藥機械、衛生材料、醫藥包裝材料和化學試劑、玻璃儀器流通的行業管理。1998年3月國務院機構改革，成立國家藥品監督管理局，不再設置國家醫藥管理局。齊謀甲、鄭筱萸a先后任國家醫藥管理局局長。齊謀甲、鄭筱萸先后任中共國家醫藥管理局黨組書記。
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