殘基（英語：Residue）在化學中，是指化學大分子上的一個部位，例如甲基。在生物化學與分子生物學中，殘基特指聚合物如多糖、蛋白質或核酸上的某個特定單元。
在蛋白質的序列中，氨基酸之間的氨基和羧基脫水成鍵，氨基酸由于其部分基團參與了肽鍵的形成，剩余的結構部分則稱為氨基酸殘基。
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