自2010年12月的V-Jump2月號開始連載的漫畫。“游戲王”動畫系列第四部《游戲王zexal》的平行世界漫畫，劇本作者是參與了前四部《游戲王》動畫的常駐編劇吉田伸，作畫是三好直人。
流行AR決斗和盛行超量召喚的心園市，主角九十九游馬和來自異世界搭檔星光體一起收集「No.卡」的故事。從漫畫第10話開始，漫畫劇情不再跟同于動畫劇情。
故事簡介
在近未來的城市“心園市”（Heartland）里，無論是大人或小孩都熱衷于AR決斗。這城市的主角九十九游馬熱衷于這種決斗，但一直以來都是連敗者。
某日，九十九游馬與學校頭號不良少年“鯊魚”——神代凌牙決斗，而這場決斗將改變九十九游馬的命運。于這場激斗中，出現在九十九游馬夢里的詭異大門突然出現，并被九十九游馬利用掛墜鎖匙打開。大門散發出無數光芒，站著九十九游馬身旁的是從異世界來的神秘生命體星光體（astral）！為取回星光失去的記憶，星光需拿回100張名字帶有「No.」的超量怪獸卡，因此九十九游馬及星光兩人開始一起行動。
漫畫故事第1至9話，跟動畫故事1、2、5、6、13、14話基本相同。九十九游馬＆星光(Astral)結束跟天城快斗的決斗后，來到心園。在這里，游馬迎戰三位心城先生的刺客。同時，神代凌牙在曾經作為菲卡博士的助手的那的請求下，也開始收集「No.卡」。天城快斗離開菲卡博士和心城先生。心城先生把凌牙的舊友八云興司招募作為新的「No.」獵人。以游馬＆星光、凌牙＆瑠那、快斗、八云的四方「No.」爭奪戰正在拉開……
登場人物
主要角色
其他人物
漫畫版原創人物
漫畫目錄
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動漫差異
漫畫1~4話，對應動畫的1~2話，講的是九十九游馬和神代凌牙的決斗。漫畫里，「鯊口人」攻擊時，星光對游馬暗示可以使用手上的「翻倍機會」獲勝，故游馬沒有使用「No.39希望皇霍普」的效果。動畫里，把漫畫里游馬原本在手上的「翻倍機會」換成了「哥布林的敷衍了事」。「鯊口人」攻擊時，星光叫游馬使用「No.39希望皇霍普」的效果，游馬想到可以利用卡組里的「翻倍機會」獲勝，故沒有使用「No.39希望皇霍普」的效果。最后游馬立即神抽到「翻倍機會」從而獲勝。整個過程星光只有提供一張「No.39希望皇霍普」的作用，對最后游馬的獲勝操作不起任何作用。
漫畫5~6話，對應動畫的5~6話，講的是九十九游馬和表里德之助的決斗。動畫里比漫畫多了兩個回合。游馬使用到了「揮精靈」。
漫畫7~9話，對應動畫的13~14話，講的是九十九游馬跟天城快斗的首戰。漫畫里，快斗從劫匪身上回收「No.20」。決斗中，游馬使用到了「影無茶騎士」；快斗使用了「反射光子流」（漫畫效果）增加「銀河眼光子龍」攻擊力，并強制讓直接攻擊中的「No.39希望皇霍普」跟「銀河眼光子龍」戰斗。動畫里，快斗從劫匪身上回收的是「No.56」。決斗中，游馬使用的是陷阱怪獸「復制騎士」；快斗使用「光子化」無效「No.39希望皇霍普」的直接攻擊，到自己回合再用「銀河眼光子龍」攻擊「No.39希望皇霍普」。
登場No卡
No卡
※漫畫里的怪獸卡還有“性別”這個概念（包括男性、女性和無性別三種），請根據卡圖上的怪獸模樣自行判斷。（針對「No.22」的原作效果）
※漫畫里的衍生物也可以存在階級。（針對「No.48」的原作效果）
※漫畫里怪獸的效果文字總是寫不全（如「No.卡」只能被「No.卡」戰破的效果完全不寫，實質這效果是存在的），且完全不規范（因為漫畫里的卡只能寫幾個字）。
※「No.10白輝士啟明者」「No.17海惡龍」「No.20蟻巖土輝蟻」「No.39希望皇霍普」是漫畫、動畫里都出現的「No.卡」，而且其出現的劇情都基本一樣。
※「No.6」「No.9」「No.40」「No.46」「No.61」「No.66」都是出自動畫的「No.卡」，在漫畫第54回中由星光用「No.93希望皇霍普·真皇」的效果召喚出來。
閃光No
「SNo.」，「S」的注音為“シャイニング”，即Shining，這正好于動畫里的「CNo.」中的「C」表示的“混沌”相反。漫畫第32回，游馬和星光首次使用「SNo.39希望皇ホープONE」，召喚辭：シャイニング?エクシーズ?チェンジ！宇宙の秩序亂されしとき混沌を照らす一筋の希望が降臨する！見參！シャイニングNo.39希望皇ホープONE！！
其他版本
《游戲王決斗小隊ZEXAL》
原名：《游☆☆王Dチームゼアル》
作者：友永晃浩（高橋和希的徒弟之一）
連載時間：2012-2014
單行本：無（人氣太低沒有發行單行本）
介紹：Q版《游戲王ZEXAL》漫畫，基本沒有劇情，只是OCG決斗教學，該漫畫中使用的卡全是OCG卡片。
參考資料 >
游?戯?王ZEXAL/ 全9巻.集英社文庫.2016-12-12
漫畫版.dmzj.2015-08-26